| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 499 total aligned reads displayed.
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gatactatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcatctgcaattttatttaaggggtcttctcaacaTc < 1:84323‑M1/2‑1 (MQ=255) atactatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacaTCa < 1:349407‑M1/3‑1 (MQ=255) atactatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgacgacattcgtctgaaagttcggttaagagttcttctaaacatta < 2:193067‑M1/3‑3 (MQ=255) acGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACTAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGCTTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCa < 1:608109/141‑1 (MQ=17) cacATTTATTCCGAAAAAATTTATTCATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCaa < 1:116619/139‑1 (MQ=2) cGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCaa < 1:155530/141‑1 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< 1:626510‑M1/6‑1 (MQ=255) cATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGGATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCAGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGGTCCGAGGCTCAACGTCAATa > 1:696905/1‑141 (MQ=2) tatttattccaattgctttatttgcgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacaTCAATaa < 2:670072‑M1/7‑1 (MQ=255) tatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacaTCAATaa < 2:83243‑M1/7‑1 (MQ=255) tatttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcgtatcaacaTCAATaa < 1:857688‑M1/7‑1 (MQ=255) atttattccaattgctttattgacgttgagcctcggaacccttaacaatcccaaaacttgtcgaatggtcggcttaatagctcacgctatgccgacattcgtctgcaagtttagttaagggttcttctcaacaTCAATaaa > 1:919762‑M1/134‑141 (MQ=255) 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2:647391/141‑1 (MQ=255) aaggTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAATCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTTTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCttt < 2:328544/139‑1 (MQ=255) aGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCttt > 2:407923/1‑141 (MQ=255) aGGGTTCCGAGGCCCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGTATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCttt < 2:602071/141‑1 (MQ=255) tCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATAtt > 1:804486/1‑141 (MQ=255) gAGGCGCAACGTAAATAAAGCAAGTGGAAGAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAAGACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGGATTATGATTCCAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCt < 2:31827/141‑1 (MQ=255) aGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAGGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCTa < 2:628903/141‑1 (MQ=255) gCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCTAca < 2:917211/141‑1 (MQ=255) ctcaactTAAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGAGTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCACACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCTAcag > 2:721821‑M1/8‑141 (MQ=255) tCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCTAcagc < 1:310832/141‑1 (MQ=255) aaCGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCTAcagcag < 2:281109/141‑1 (MQ=255) | ACACGCATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAGCAATTGGAATAAAGCACCTATGATTATTTAAAAATATAAGTTATAATACATTCAAAAATATTTTTGAATGAGGTGTATTATGATTCAAACGGTTGTTGCTGCTGCTGTTCTTTATATTGCTACAGCAGTTGA > CP000731/4272‑4552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |