| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 1,035,144 | C→T | 6.2% | intergenic (‑66/‑133) | USA300TCH1516_00961 ← / → USA300TCH1516_00962 | Lipoate‑‑protein ligase 1/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 1,035,144 | 0 | C | T | 6.2% | 197.1 / 3.2 | 69 | intergenic (‑66/‑133) | USA300TCH1516_00961/USA300TCH1516_00962 | Lipoate‑‑protein ligase 1/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/29); new base T (2/2); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
AAACATATTCTTCCATTGCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACTTAAAATGACT > USA300TCH1516_ALE/1035012‑1035282 | acaCATATTGTTCCATTGGTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTACTGAATTTAATTCTTATCTCTCCCTTATAAGTATATATATTCTCTATTTATTTATGCGTTAACTTTGCTCAAAATGGCGATtatt > 2:445914/3‑140 (MQ=255)aaaCATATTCTTCCATTGCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCACATtata > 2:784821/1‑141 (MQ=255) atTCTTCCATTGCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTca < 1:209824/141‑1 (MQ=255) tcCATTGCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAt > 1:763843/1‑141 (MQ=255) tcCATTGCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATGTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAt < 2:502122/141‑1 (MQ=255) tGCTAAGTTTAAAGTTGTATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTc < 2:934058/141‑1 (MQ=255) gCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAGTATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCt < 1:634795/141‑1 (MQ=255) aaGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTaaa < 2:375157/141‑1 (MQ=255) aaGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTaaa < 1:670738/141‑1 (MQ=255) gTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACGAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CCTTCTAAata > 1:675574/1‑141 (MQ=255) ttAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGACAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATc > 1:715413/1‑141 (MQ=255) aGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCt < 2:588755/141‑1 (MQ=255) gATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTCCTTATTTATGCCTTAACTTTGCCCCAAATGCCAATTCTATACTCCCCACC‑CCTTCTAAACATCGCCTTAAAg > 1:475330/1‑141 (MQ=255) aaTATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACAtt < 2:626075/141‑1 (MQ=255) ttattattaCTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTttat < 2:930419/141‑1 (MQ=255) attatcaCTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTGAGATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTttatta < 1:385912/141‑1 (MQ=255) ttattaCTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATTTCGGCTTAAGGTTACATTTtattat > 1:711294/1‑141 (MQ=255) tattaCTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATCTCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAATGTTTCTCAAAATTCCAATGATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTattatt < 1:930562/141‑1 (MQ=255) tattaCTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTattatt < 1:336420/141‑1 (MQ=255) tttCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTTTTTGttttt > 2:775339/1‑138 (MQ=255) tttCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAAt < 1:478339/141‑1 (MQ=255) ttCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAAGTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATa < 1:215479/141‑1 (MQ=255) tCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATAGATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAg > 2:605374/1‑141 (MQ=255) cATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGt < 2:783158/141‑1 (MQ=255) aTTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGtt > 2:425055/1‑141 (MQ=255) aTTACAATCTCTCCCTTATATATAACTGATTTCTCTACTTATTTCTGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTACATATAGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGtt > 2:432887/1‑141 (MQ=255) tACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGTCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTTATTTTTAATAttttt > 2:855549/1‑140 (MQ=255) tACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGTCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTa > 2:492879/1‑141 (MQ=255) tACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTCGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTa > 1:511747/1‑141 (MQ=255) aCAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTAt > 1:144267/1‑141 (MQ=255) aTCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACATATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTg > 2:913050/1‑141 (MQ=255) tcCCTTATATCTCTATATATTCTCTACTTATTTCTGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAg < 2:897322/141‑1 (MQ=255) tcCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAg < 1:281657/141‑1 (MQ=255) tcCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAg > 1:462345/1‑141 (MQ=255) ccccTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAg < 1:595207/140‑1 (MQ=255) ccTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGGCTTAACTTTGCTCTACATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTg < 2:757052/141‑1 (MQ=255) cTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGa > 1:185709/1‑141 (MQ=255) cTTATAGCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTGGTTTTGCTTAGAATGCGAGTTACGTACTCACTAAT‑AACTGTAAATTCTGCCAAAAAGGGACAATTTATTATGTTTGATTGTTAAGAGTTTAATTGtgcagcga < 2:388332/141‑8 (MQ=255) tagatatatTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGt < 2:745240/138‑1 (MQ=255) atatctTCTCAACTAATTTCCGCCTTAACTTTGCTCAAACTGCCAACTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGACTTCAGGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATATTTTACTTGTTCACTGAATTTTATTAcc > 2:36126/1‑140 (MQ=255) tatatTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACaa > 1:124496/1‑141 (MQ=255) tatatTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACaa < 1:333595/141‑1 (MQ=255) ttacttactTATGCCTTAACTTGGCTCAAAATGCCAATTACACACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAAttt < 2:50606/140‑1 (MQ=255) tACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTa < 1:4337/141‑1 (MQ=255) ttatttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGTCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGtt < 1:492879/141‑1 (MQ=255) ttatttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGtt > 1:821893/1‑141 (MQ=255) ttatttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGtt < 2:558840/141‑1 (MQ=255) ttatttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGtt > 1:341741/1‑141 (MQ=255) ttatttatGCCTTAACTTGGCTCAAAATGTCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGtt < 1:855549/141‑1 (MQ=255) tatttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATGGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTTGTACAATTTATTTTAGttt > 2:681162/1‑140 (MQ=255) tatttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGGTAAGTGAATTTTAGTACGATATAATTTAGTTa > 2:406014/1‑141 (MQ=255) atttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCAAAAAT‑GATTCTCGATATGGGATTGAAGTTTCCTTCTAACAGTATCGATTGTTAATATGGCAGGCGTGAAGTGAATTGTAGGATAATATAATTTAGTTAt > 2:81938/1‑141 (MQ=255) tttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATg > 1:788669/1‑141 (MQ=255) tttatGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATg > 1:191728/1‑141 (MQ=255) ttatGCCTTAACTTTTCTCAAAATGCCAATATTATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTTGTACAATATAATTTAGTTATGa > 2:244466/1‑141 (MQ=255) atGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGAtt < 1:603038/141‑1 (MQ=255) aagttttCTCAAAATGGCAATTAAATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTGAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAACTTAGGTATGATTTAaggag < 1:651867/138‑1 (MQ=255) aaCTTTGCTCAAAATGCCAATTATTTACTCACAAAT‑CACTCTAAATATCGGCCTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTCATAGTGGACTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAaggag < 1:784821/141‑1 (MQ=255) tttGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGGGGAc > 2:794913/1‑141 (MQ=255) ttGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTTGTTATGATTTAAGGAGGACt > 2:497438/1‑141 (MQ=255) tGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACtt < 1:913050/141‑1 (MQ=255) tGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGAATATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACtt > 1:447325/1‑141 (MQ=255) tGCTCAAAATGCCAATTATATACT‑ACTATTCCATCCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGCCtt > 1:935404/1‑141 (MQ=255) gCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACTTa > 1:145739/1‑141 (MQ=255) cTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGAATTaa > 1:8456/1‑141 (MQ=255) cTCAAAAGGCCAATTATATACTCACAAAG‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACAGTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACTTaa > 1:597267/1‑141 (MQ=255) tCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACTTaaa < 2:511747/141‑1 (MQ=255) cAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACTTaaaa > 1:255037/1‑141 (MQ=255) tGCCAATTATATACGCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGGTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGAGTTAAAATGaag > 2:715253/1‑139 (MQ=255) | AAACATATTCTTCCATTGCTAAGTTTAAAGTTGGATCTGTAATATTATTATTACTAATGAATTTCATTACAATCTCTCCCTTATATCTATATATATTCTCTACTTATTTATGCCTTAACTTTGCTCAAAATGCCAATTATATACTCACAAAT‑CATTCTAAATATCGGCTTAAAGTTACATTTTATTATTTTTGATTGTTAATAGTTTATTTGTTAAGTGAATTTTAGTACAATATAATTTAGTTATGATTTAAGGAGGACTTAAAATGACT > USA300TCH1516_ALE/1035012‑1035282 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |