| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 2,373,506 | A→T | 15.7% | N90K (AAT→AAA) | pbuG ← | Guanine/hypoxanthine permease PbuG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 2,373,506 | 0 | A | T | 15.7% | 143.1 / 24.6 | 65 | N90K (AAT→AAA) | pbuG | Guanine/hypoxanthine permease PbuG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/18); new base T (3/7); total (39/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.90e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-02 | |||||||||||
TAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAAC > USA300TCH1516_ALE/2373366‑2373646 | tAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCa < 1:531348/141‑1 (MQ=255) gAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAGCCCGGGGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTa > 1:455479/1‑141 (MQ=255) aTTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTACTCCCA‑t > 2:739871/1‑141 (MQ=255) ataataaCTTCCCTAAACCCTATGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAAAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCt < 1:511443/141‑1 (MQ=255) aataaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTgg < 1:816272/141‑1 (MQ=255) aataaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTgg < 2:10533/141‑1 (MQ=255) ataaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAACACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGt > 1:835051/1‑141 (MQ=255) taaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTg > 1:98723/1‑141 (MQ=255) taaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTg < 1:461210/141‑1 (MQ=255) aaCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAAAATGCATTTAATCCAA‑TACCTGGTGc > 2:277026/1‑141 (MQ=255) aCTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCt > 2:926441/1‑141 (MQ=255) cTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCATAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CACGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTa < 1:630810/141‑1 (MQ=255) tAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGCCTCCCTCAT‑GTGTACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCaa > 1:448083/1‑141 (MQ=255) tAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGTTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAAGCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCaa < 2:269877/141‑1 (MQ=255) aaaCCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAAt < 1:104679/141‑1 (MQ=255) cccTGCGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGC‑TTTAACGCCACAACCTGGTGCTAACGCAATTgg < 1:456888/141‑1 (MQ=255) ccTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACCTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGa < 2:7943/141‑1 (MQ=255) gtgACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATAGGatat > 2:937816/1‑141 (MQ=255) gtgACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACATGGTGCTAACGCAATTGTatat > 1:186414/1‑141 (MQ=255) gtgACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACCCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTACTAACGCAATTGGatat > 1:490161/1‑141 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAGTACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGAAATTTa > 2:447048/1‑141 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACCACAGTAAATGCACAGAATGCATTTAATAGAA‑TAACTGGGGCTAACGCAATTGGATAtttc > 2:150402/1‑140 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGGTATTTa > 2:161501/1‑141 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATAttca > 1:331576/1‑139 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTa > 1:865261/1‑141 (MQ=255) aCGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGGGCTAACGCAATTGGATAtttg > 1:419867/1‑140 (MQ=255) cGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAg > 1:920449/1‑141 (MQ=255) atatCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCGATTGGATATTTAGCTATTa < 1:562849/141‑1 (MQ=255) tCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGcc < 2:98723/141‑1 (MQ=255) gCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGcccc < 1:716926/141‑1 (MQ=255) ccAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGcccc < 1:23736/140‑1 (MQ=255) cAAAGAATCTACCTGAGCATAAAACGCCTGCTAAACCAACTTGCCACGCAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTCAACGCCAAGAATGCACTTACTCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCACTTGCCCACTTAGCTATCCGccccc > 2:864575/1‑140 (MQ=255) cAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCa < 2:455479/141‑1 (MQ=255) aGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTGGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGa < 1:779826/141‑1 (MQ=255) tataCCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAg < 2:187452/141‑1 (MQ=255) aCCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑AATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCAGTTAATCCAA‑TACCTGGTGCTAACGCAAATGGATAGTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCgg > 2:844930/1‑140 (MQ=255) agaATAAACCGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTa < 2:72705/141‑1 (MQ=255) aaTAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACa > 1:577079/1‑141 (MQ=255) gTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTCACACCACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAAGTCCATCGGCGCGTGATGTAGGAGCCCCATGAATAGCGAGCATACAAATGCTGCTaag > 1:306826/1‑140 (MQ=255) aaaCCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGATGCTAATGCa > 1:633476/1‑141 (MQ=255) cAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGAGATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCGTACAAATGCCGCTAATGCGGTcc > 2:330861/1‑140 (MQ=255) aaCTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGc < 2:362337/141‑1 (MQ=255) cctGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTa < 1:855822/139‑1 (MQ=255) ggCCAAGGAATACC‑CAGGGTTAACACAACGGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACa < 1:864575/140‑1 (MQ=255) gCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACaa > 1:492129/1‑141 (MQ=255) aaGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACaaaaa > 2:819116/1‑141 (MQ=255) atgAATACC‑CATGTTTAACACAACATTAAATGCAAAGAATGCATTTAACCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCGATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAAt < 2:539654/139‑1 (MQ=255) aGGAATACC‑CATGGCTAACACGACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATGTTTAGCTATTAGACCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAAt > 2:646544/1‑141 (MQ=255) aCC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCAcc > 1:752701/1‑141 (MQ=255) cc‑cATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTGTTTATTATCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCt > 1:686564/1‑141 (MQ=255) tGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGt < 2:308482/141‑1 (MQ=255) tGGTTAAAACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCGAACTTAATTGGATATTTAGCTATTCGCCCGATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGt < 2:705206/141‑1 (MQ=255) agacaacaGTCAATACAAGGAATGCATTTAATGTCA‑TAACTAATGGAACTGCATTTATTGAGTAAGTTGTTGGCGCCAGGAATAGCGAGACTACAAATGCTGCTAATGCAGTGGCTAAAAAAGGGGCCACGTGGTCAAttt > 2:429974/3‑141 (MQ=255) acacAACAGTAAATGCAAAGAATGCTTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCAttt > 1:578818/1‑141 (MQ=255) acacAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCCGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTGCCttt > 1:843/1‑141 (MQ=255) acacAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCAttt > 1:144763/1‑141 (MQ=255) acacAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCAttt > 1:493949/1‑141 (MQ=255) tacaacaGTAAATGCAAAGTATGCATTTAATCCCA‑TTCCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCAtttt < 1:157232/140‑1 (MQ=255) cacaACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCAtttt < 2:114710/141‑1 (MQ=255) aaaTGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATAtcttc < 2:733594/141‑1 (MQ=255) aaTGGAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACCAAAATGGCACCATGGTCAATGTTCGAAtcttct > 2:571315/1‑141 (MQ=255) aaTGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTGCATTTTCATAtcttct > 2:412281/1‑141 (MQ=255) aaTGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATAtcttct > 2:828842/1‑141 (MQ=255) aaTGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATAccttct > 2:224222/1‑141 (MQ=255) aGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGc > 1:146781/1‑141 (MQ=255) gCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTa > 2:876030/1‑141 (MQ=255) aTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACACAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTacc > 2:259595/1‑139 (MQ=255) aTTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCCCATTGGTCCCTTTTCCTATCTTCTGAAAAACCTTTAac > 1:377954/1‑141 (MQ=255) | TAAGGAATTGCATTAATAATAACTTCCCTAAACCCTGTGACGGTTAATATCGCAAAGAATATACCTGAGAATAAAACGCCTGTTAAACCAACTTGCCAAGGAATACC‑CATGGTTAACACAACAGTAAATGCAAAGAATGCATTTAATCCCA‑TACCTGGTGCTAACGCAATTGGATATTTAGCTATTAGCCCCATGAATAGCGAGCCTACAAATGCTGCTAATGCAGTCGCTACAAAAATGGCACCTTGGTCCATTTTCATATCTTCTGATACGCCTTTAAC > USA300TCH1516_ALE/2373366‑2373646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |