Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | USA300TCH1516_ALE | 58657 | 58991 | 335 | 9 [7] | [6] 8 | USA300TCH1516_00049/USA300HOU_RS00245 | hypothetical protein/hypothetical protein |
TTACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCTAATAATACATATATAAAATAAATAATTATCAGAATATATTTAGAAATTGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAGATACTTAGAGTCACTATATAACACCTTTAAAACTGAGTTAGAAAACGAACGCACTCGCTATT > USA300TCH1516_ALE/58881‑59130 | ttACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCTAATAATACATATATAAAATAAATAATTATCAGAATATATTTAGAAATTGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAATATTTATAAtt > 3:83359/1‑141 (MQ=255) gCTAATAATACATATATAAAATAAATAATTATCAGAATATATTTAGAAATTGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAg < 4:83359/141‑1 (MQ=255) taataaTACATATATAAAATAAATAATTATCAGAATATATTTAGAAATTGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAatat > 3:158522/1‑84 (MQ=255) taataaTACATATATAAAATAAATAATTATCAGAATATATTTAGAAATTGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAatat < 4:158522/84‑1 (MQ=255) tGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAGATACTTAGAGTCACTATATAACACCTTTAAAACTGAGTTAGAAaacgaac > 2:462181/1‑141 (MQ=255) atTAAATAAAAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAGATACTTAGAGTCACTATATAACACCTTTAAAGCTGAGTTAGAAAACGAACGCACTCGCTAtt > 1:399409/1‑141 (MQ=255) taaataaaAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAGATACTTAGAGTCACTATATAACACCTTTAAAACTGAGTTAGAAAACGAACGCACTCGCTa < 3:39676/137‑1 (MQ=255) taaataaaAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAGATACTTAGAGTCACTATATAACACCTTTAAAACTGAGTTAGAAAACGAACGCACTCGCTa > 4:39676/1‑137 (MQ=255) | TTACCTTATGAGGTAGCCTTTTATTTGTCACCTAATATTGCTCTAAGGCTAATAATACATATATAAAATAAATAATTATCAGAATATATTTAGAAATTGATATTTAATAATTAAATAAAAGTATGCTAAATATTTATAATTTACAAGTGAGCTGATAGAAAGATGAGTATAAGCGAATATAAAAATAGATACTTAGAGTCACTATATAACACCTTTAAAACTGAGTTAGAAAACGAACGCACTCGCTATT > USA300TCH1516_ALE/58881‑59130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |