New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 2433 total aligned reads displayed.
ATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGT > NC_012417/2797‑3077 | tttttaattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACg > 2:968850/1‑141 (MQ=255) ttaattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAgt < 1:9593/141‑1 (MQ=255) tatttttttTAATTCTATTTTATTTGATAATCCTTTTTACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAgtg < 2:1137360/138‑1 (MQ=255) taattttGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAgtg < 2:886593/141‑1 (MQ=255) 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2:401229/1‑141 (MQ=255) ttttttGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaa > 1:397642/1‑141 (MQ=255) ttttttGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaa < 1:526415/141‑1 (MQ=255) tttttGAAACCAGTGTTAGCGGTGTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAAATTGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTTCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaa < 2:481010/141‑1 (MQ=255) tttGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTTTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATaaaaaa > 2:625616/1‑141 (MQ=255) ttGAAACGATTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTTTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGGAACTGTTGATACTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAc < 1:564452/141‑1 (MQ=255) gAAACtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaa > 2:1163080‑M1/1‑5 (MQ=255) gAAACtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaa < 1:133587‑M1/141‑137 (MQ=255) gAAACGAGTGTTAACGAGTTTCGTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAccc < 1:493153/141‑1 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaat > 2:763175‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaaacgaat > 1:586572‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaacgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaat > 2:866866‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctcgaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaat > 2:134373‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaCGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAAcccc < 1:415193/141‑1 (MQ=255) aaCtcgttcacactcgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgactaaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaatt > 2:784929‑M1/1‑3 (MQ=255) aCtcgttcacacccgtttcaaaaaacaacctattccttcttctttttatgaccctctaaacctaaataaattaatgtgaaaaccaatgaataaataaaactttctaaaaagtcaaaaggattatcaaataaaatcgaatta < 1:1021180‑M1/141‑140 (MQ=255) aCGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAg > 2:705098/1‑141 (MQ=255) | ATTTTTAATTTTGTTAATTCGATTTTATTTGATAATCCTTTTGACTTTTTAGAAAGTTTTATTTATTCATTGGTTTTCACATTAATTTATTTAGGTTTAGAGGGTCATAAAAAGAAGAAGGAATAGGTTGTTTTTTGAAACGAGTGTGAACGAGTTTCTTCTTGTCTTGATACTATATAGAAATAACTCGATTTTATATATATAGCTGTAACTGTTGATATTACAGTGTTTAAACGTGTTTTTGTGCGTGAAAGGAAAATTTGACAATAAAAAACCCCAGT > NC_012417/2797‑3077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |