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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) aaaaaaaTGAAAAAAGAAGTAACAGGTGTCATCAAACAAAATTCAAACTATTATTGTGTTCAATGTGAAAGTACAAATCCAACGCATTTTTATCAGTATGATTCCTCAGTACATTCCAAGAAAATTGTATATTGCAGAAAt < 2:494548/140‑1 (MQ=255) aaaaaaTTAAAAAAGAAGTAACAGGTGTCATCAAACAAAATTCAAACTATTATTTTGTTCAATGTGAAAGTACAAATCCAAAGCATTTTTATCAGTATGATTCCTCAGTACATTCCAAGAAAATTGTATATTGCAGAAAtt > 1:775157/1‑141 (MQ=255) aaaaaaTTAAAAAAGAAGTAACAGGTGTCATCAAACAAAATTCAAACTATTATTGTGTTCAATGTGAAAGTACAAATCCAAAGCATTTTTATTAGTATGATTCCTCAGTAAATTCCAAGAAAATAGTATATTGCAGAAttt > 2:234216/1‑141 (MQ=255) aaaTTAAAAAAGAAATAACAGGTTTCATCAAACAAAATTCAAACTATTATTGTGTTCAATGTGAAAGTACAAATCCAAAGCATTTTTATCAGTATGATTCCTCAGTACATTCCAAGAAAATTGTATATTGCAGAAATTGta < 1:335218/141‑1 (MQ=255) tAAAAAAGAAGTAACAGGTGTCATCAAACAAAATTCAAACTATTATTGTGTTCAATGTGAAAGTACAAATCCAAAGCATTTTTATCAGTATGATTCCTCAGTACATTCCAAGAAAATTGTATATTGCAGAAATGGTATATc > 1:670332/1‑141 (MQ=255) | ATCATTTGAAAGCCAAAATGCTAAAGATATAAGAAAATCATTATAATATTAGGCTCTTTTTTACGTTGAAATGAGGTTTTAAGCATTAAACATTACGGGAAATTAATTCATCCTCATACTTCACTTACTAATGAAAAAATTAAAAAAGAAGTAACAGGTGTCATCAAACAAAATTCAAACTATTATTGTGTTCAATGTGAAAGTACAAATCCAAAGCATTTTTATCAGTATGATTCCTCAGTACATTCCAAGAAAATTGTATATTGCAGAAATTGTATATC > USA300TCH1516_ALE/828158‑828438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |