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aCTTCGTTTAACATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCa > 1:37342/1‑141 (MQ=255) aCTTCGTTTAACATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTATTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCa < 1:801020/141‑1 (MQ=255) cTTCGTTTAACATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCaa > 1:642328/1‑141 (MQ=255) gTTTAACATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATCTGTTTACATATCACTCTTCTTCCATCAGCATGAGGCCAATTAAATATGGATTTTTTAGGANGTTCGATATCCTtata > 1:937446/1‑141 (MQ=255) tAACATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCAATATaaca < 2:66327/141‑1 (MQ=255) aCATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGGTGTTCCATATTAATATaacaac > 1:999424/1‑141 (MQ=255) aCATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCAATATaacaac > 1:1052808/1‑141 (MQ=255) atcatTATATGTTTATTTGATGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGACTTTCTCGGATGTTCCATATCAATATAACAACgt > 2:667254/1‑140 (MQ=255) catTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCAATATAACAACGata < 1:279036/141‑1 (MQ=255) atatGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGCATAGTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCAATATAACAACGATATACt < 1:693365/141‑1 (MQ=255) tatGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCAATATAACAACGATATACtt > 2:198599/1‑141 (MQ=255) | TTCTCCATGTTCAATTAACATGTTTAAATATGCATCGCGGAGTTCTTCTTCACTCATATCATTAATCATTTCTTTAAGACTATCAATCCACATATTTCTGCGTAATTGATAGTCTTCTTCAACTTCGTTTAACATCATTATATGTTTATTTGCTGCTTCTGGACTAGCTGTAAAGAGTAATGCAATCATATGTTTACATATCACTCGTCTTCCATCAGCATGAGGACAATTACATATGGATTTTCTAGGATGTTCCATATCAATATAACAACGATATACTT > USA300TCH1516_ALE/1415097‑1415377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |