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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | USA300TCH1516_ALE | 1,577,317 | 0 | A | T | 9.4% | 270.1 / 4.2 | 104 | V67D (GTT→GAT) | USA300HOU_RS07705 | Glycyl‑glycine endopeptidase ALE‑1 |
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
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1:754172/141‑1 (MQ=255) ttttGAACTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGATATTTT‑TCCATTGATTTTTTTTTCTTTTTAAATGCTGACAGATTATTTTTCATTTCACTATTTATAACACCTAATTATAGCTTTAATCTTTTCAtt > 2:795647/1‑140 (MQ=255) ttttGAACTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGATATTTT‑TCCATTGATTTTTCAGACTTATCAAATGCTGACAGATTAGCTTTCATTTCACTATTAACAACACCTAATTGTCGCTTTAAACCTTTCagg > 1:490976/1‑139 (MQ=255) tttGAACTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGCTCTTTTATGCCAT‑AGTGTTCAGACTTATCAAATGCTGACAGATTAGCTTTCATTTCACTATTAACAACACCTAATTGTCGCTTTAAACCTTTCATGc < 1:518649/141‑1 (MQ=255) tttGAACTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGATATTTT‑TCCATTGATTTTTCAGACTTATCAAATGCTGACAGATTAGCTTTCATTTCACTATTAACAACACCTAATTGTCGCTTTAAACCTTTCATGc < 2:674010/141‑1 (MQ=255) ttGAACTTTAAGCCTATCATTTAAACCCTTAATTCTAGACTGATATTTT‑TCCATTGATTTTTCAGACTTATCAAATGCTCACAGCTTAGCTTTCCTTTCACTATTCACAACACCTACTTTTCGCTTTAAACCTTTCCTgac > 2:44127/1‑139 (MQ=255) tGAACTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGATATTTT‑TCCATTGCTTTTTCAGACTTATCAAATGCTGACAGATTAGCTTTCATTTCCCTCTTCACAACACCTAATTGTAGCTTTAAACCTTTCATGCAt > 2:192204/1‑141 (MQ=255) aCTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGATATTTT‑TCCATTGATTTTTCAGACTTATCAAATGCTGACAGATTAGCTTTCATTTCACTATTAACAACACCTAATTTTCGCTTTAATCCTTTCATGCATTCt < 1:600174/141‑1 (MQ=255) | GAGCTAATTTTTCTTTTTTATTGGCTTCTACTAACTTTAAATATGCTTTCTCAACATCTTTTACACTGGATTTAGCTTTTTGGTAATTAGCGTTAACTTGTTTAAGCTCATCTTCTACTTGAGAATACATCTTTTTTTGAACTTTAAGCCTATCATTTAACCCCTTAATTCTCGCCTGATATTTT‑TCCATTGATTTTTCAGACTTATCAAATGCTGACAGATTAGCTTTCATTTCACTATTAACAACACCTAATTGTCGCTTTAAACCTTTCATGCATTCT > USA300TCH1516_ALE/1577177‑1577457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |