New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1114090 = | 73 (0.820) | 4 (0.050) | 3/246 | 10.4 | 6.1% | intergenic (+19/+63) | USA300HOU_RS05510/mntH_1 | hypothetical protein/Divalent metal cation transporter MntH |
? | USA300TCH1516_ALE | 1114149 = | 60 (0.770) | intergenic (+78/+4) | USA300HOU_RS05510/mntH_1 | hypothetical protein/Divalent metal cation transporter MntH | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTTTATTACT > USA300TCH1516_ALE/1114012‑1114284 | aTTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt > 1:785323/1‑141 (MQ=255) aTTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTAttt < 2:37043/141‑1 (MQ=255) tAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAAc > 1:569730/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAGTTATTAGATGCAACCACAATTTTAATGGTTTTATTTTTAACt > 1:246892/1‑141 (MQ=255) taaTCAGTAGAAACTACACATTATGACGATGAGTATAATCATTCTTAATATGTTCATAGCAAAAGCATAAACATTAAAATGTTAAGTTGTTTATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTGTTAACTTTGTAg < 2:572710/140‑1 (MQ=255) tCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTc > 1:354295/1‑141 (MQ=255) aaaaGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCtt > 1:970532/1‑141 (MQ=255) aacaacACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATg < 1:751740/141‑1 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt < 1:879861/141‑1 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt > 1:303050/1‑141 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATACTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTGGTTCTTGGAATGttt > 2:89144/1‑141 (MQ=255) aacaCATAAGGACGATGAGTATACTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt > 2:287473/1‑141 (MQ=255) aacaCATAAGGAAGATGAGTATACTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGttt > 2:88944/1‑141 (MQ=255) acacATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTg > 2:540126/1‑141 (MQ=255) aacaTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGa < 1:760975/140‑1 (MQ=255) caTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAAc > 1:242926/1‑141 (MQ=255) aTAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACg < 2:785323/141‑1 (MQ=255) tAAGGAAGATGAGTAGATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGa < 1:292882/141‑1 (MQ=255) aaaGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGa < 2:169977/140‑1 (MQ=255) aGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTACTGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGAtt > 1:424677/1‑141 (MQ=255) aTGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAg > 1:245351/1‑141 (MQ=255) aGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACa > 2:745107/1‑141 (MQ=255) gTATAGTGATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAt < 2:837234/141‑1 (MQ=255) tataATTATCATTAATTTGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAATATGTCAAGTTGTTAATTAGTAGATACCACCAACCTTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTCGAATGTTTGTACGATTAAATAGACAtt < 2:1041/141‑1 (MQ=255) actgttATGATTAATAGGTTGATAGCAAACGAAAGACCAGTAATTTTGTATGGTGTTAATTATTAGATACTTCCAACACTTTAATGCTTTTATCTTTAACTTTGTTGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACAttt < 2:422244/137‑1 (MQ=255) tATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAAt > 1:746724/1‑141 (MQ=255) aTCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATa < 1:826802/141‑1 (MQ=255) tCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATAc > 1:896116/1‑141 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTATTGTTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAAACATTTaaattcct > 1:212611/1‑136 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt < 1:702244/141‑1 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt > 1:167333/1‑141 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCGTGCATTGTCATAACCATTAAATAGACATTTAAAATACt < 1:478104/141‑1 (MQ=255) cATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGCTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACt < 1:676376/141‑1 (MQ=255) ttAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTa < 2:803484/141‑1 (MQ=255) tAATATGTTAAAAACAAAAAAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAg < 2:569730/141‑1 (MQ=255) aaTATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTAGAATGTTTGAGCGATTAAATAGACTATTAAAATACTTAGa > 2:521644/1‑141 (MQ=255) atGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaata < 1:54527/141‑1 (MQ=255) ttCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGaataata > 1:712483/1‑141 (MQ=255) aTAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAGATACTTAGAataataata > 1:917148/1‑141 (MQ=255) gCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAgt < 2:169248/141‑1 (MQ=255) aaaGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTCATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTc > 2:159299/1‑141 (MQ=255) aaaCCATTTAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCACCTTTTTAATGGTTTTATGTTTTACTTTGTTGTTTTTGGAATGTTTGAACGATTAAATTGACATTTAAAATACTAAGAATATTAGTAAGTGTTCATTaa > 2:353811/1‑141 (MQ=255) aaaCCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGaa > 2:328233/1‑141 (MQ=255) aaaCCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGaa > 2:5463/1‑141 (MQ=255) tAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGatat > 1:134064/1‑141 (MQ=255) tAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGatat < 1:151982/141‑1 (MQ=255) aaaaTGGTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAATATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATAtt < 1:410641/141‑1 (MQ=255) aaaTGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTa > 1:331862/1‑141 (MQ=255) aaaTGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTa > 1:331651/1‑141 (MQ=255) tttAAGTTGTTAATTATTCGTTACATCCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAAccc < 1:177993/140‑1 (MQ=255) ttAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCa > 2:563019/1‑141 (MQ=255) aaGTTGTGAATCAGTAGATACAACCAACTTTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATg < 2:72448/141‑1 (MQ=255) aGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGt > 2:886751/1‑141 (MQ=255) ttAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTttat < 2:394054/141‑1 (MQ=255) attaGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGa < 1:986239/141‑1 (MQ=255) agtaGATTCAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGa < 2:484820/139‑1 (MQ=255) taGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGaaa < 1:5463/141‑1 (MQ=255) aCAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTcc < 1:760188/141‑1 (MQ=255) caaccaacATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTccc < 2:712483/141‑1 (MQ=255) caaccaacATTTAAATGGTTTTATTCTTAACTTTGTAGTTCTTGAAGTGATTGAACGCGTAAATTGACTTTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTATCCAGTAAATGACATTAACCCATAGTTTATTGTAGACAgtgtcc > 2:895846/1‑136 (MQ=255) cATTTTAATTGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGt < 1:234676/141‑1 (MQ=255) cATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGt < 2:746724/141‑1 (MQ=255) cATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGCCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGt < 1:656328/141‑1 (MQ=255) cATTTTAATGGATTTATTTTTAACTTTGTACTGCTTGGAATTTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGt < 1:921558/141‑1 (MQ=255) aTTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTc > 1:860891/1‑141 (MQ=255) ttttAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAAGAAGTGTCCATGAAACGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAGGTCt < 1:674554/141‑1 (MQ=255) tttAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTAtt > 2:417858/1‑141 (MQ=255) ttAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACTGTTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTATCCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAGGTtttt > 1:932804/1‑141 (MQ=255) ttAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCttt > 1:88336/1‑141 (MQ=255) ttAATGGTTTTATTTTCAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTAttt > 1:586811/1‑141 (MQ=255) gtAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCCAGTCttt > 2:310229/2‑141 (MQ=255) tAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTtta < 2:424677/141‑1 (MQ=255) ggtttATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTTTATTACt < 2:413489/139‑1 (MQ=255) gTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTTTATTACt > 2:18144/1‑141 (MQ=255) | ATTTCTAAAAAAGAATCAAAAGAAACAACACATAAGGACGATGAGTATATTTATCATTAATATGTTCATAGCAAAAGAAAAACCATTAAAATGTTAAGTTGTTAATTATTAGATACAACCAACATTTTAATGGTTTTATTTTTAACTTTGTAGTTCTTGGAATGTTTGAACGATTAAATAGACATTTAAAATACTTAGAATAATAATAAGTGTCCATGAAATGATATTAACCCATGTTTTATTATAGAAAGGTCCCATCAAGTCTTTATTACT > USA300TCH1516_ALE/1114012‑1114284 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |