| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | USA300TCH1516_ALE | 973,213 | C→A | E175* (GAG→TAG) | yitU_1 ← | 5‑amino‑6‑(5‑phospho‑D‑ribitylamino)uracil phosphatase YitU |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | USA300TCH1516_ALE | 973,213 | 0 | C | A | 97.3% | 228.3 / ‑3.7 | 75 | E175* (GAG→TAG) | yitU_1 | 5‑amino‑6‑(5‑phospho‑D‑ribitylamino)uracil phosphatase YitU |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base A (41/31); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
TATCTTCATCACCGAATGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTCAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTGGATTACCC > USA300TCH1516_ALE/973075‑973349 | tATCTTCATCACCGAATGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTaaa < 1:648939/141‑1 (MQ=255) cTTCATCACCGAATGCAATAATATTATTTCGGTCCATAACTAAAAGTTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAatat < 2:102518/141‑1 (MQ=255) tcaCCGAACGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCg < 1:257610/141‑1 (MQ=255) caCCGAATGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCgg < 2:171720/141‑1 (MQ=255) ccGAATGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTACATATAAGCGGCa > 1:160677/1‑141 (MQ=255) ccGAATGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCa > 2:633428/1‑141 (MQ=255) aTGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGGTAAATATGGTCGGCATaaa > 2:122520/1‑141 (MQ=255) tGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATaaaa < 1:902159/141‑1 (MQ=255) ataataTTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGa > 2:941296/1‑141 (MQ=255) attattTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAg > 2:94808/1‑141 (MQ=255) attTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCat > 1:59968/1‑141 (MQ=255) tCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATAtt < 2:929451/141‑1 (MQ=255) tCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATAtt < 1:607884/141‑1 (MQ=255) tCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTATTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATAtt < 2:505056/141‑1 (MQ=255) cGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATAttt < 2:966832/141‑1 (MQ=255) gTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTGTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATAttttt < 2:225679/141‑1 (MQ=255) cAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGa > 1:576674/1‑141 (MQ=255) aaTATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGAt < 1:141627/141‑1 (MQ=255) aaTATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTGACTAATACCAGCTTTCGCAATGGGAATGACAGAGAATGGTGCACTCTACCGTCGATGCTAAATAGGAGCGGCATAAAAGTTAGGAAGCatatgtgttgt < 2:260701/141‑8 (MQ=255) aaTAGTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCGTCTAGATTTATGAATACCAAGTTTGACAATTTCAATGAAAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTAGATGCTAAATATGAGCAGCATAAAAATGAGTAAGCAGAttttgtgt < 2:260714/141‑5 (MQ=255) tAAAAATTGTCTAGCTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCGGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGAATATTGTTTATTTCAgg > 2:479421/1‑141 (MQ=255) tAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAgg > 2:734296/1‑141 (MQ=255) tAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAgg > 1:35084/1‑141 (MQ=255) ttGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGTATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTAtttt < 2:713570/141‑1 (MQ=255) ttGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTAtttt < 2:635570/141‑1 (MQ=255) ttGTCTAACTGGCCCAATTCCTCTTGCTGTATTACTACCAAGTTTTACATGTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCTATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGCGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTAtttt < 2:456390/141‑1 (MQ=255) ggttAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCCAGTTTTACAACTGCAATGACAGAGAATGGTGCGCCCCAGCGGCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGGGTAAGCCTATTTTTGATTTCAGGTAtttagc < 2:120560/138‑4 (MQ=255) tAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACttt < 2:948866/141‑1 (MQ=255) cTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTttctt > 2:958144/1‑141 (MQ=255) cTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTttctt > 2:571960/1‑141 (MQ=255) cgtcTCATTGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTttcttc < 2:484830/138‑1 (MQ=255) cTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGc > 1:769065/1‑141 (MQ=255) aTGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCa > 2:91677/1‑141 (MQ=255) gCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTCCTTTCTTCGGCTTCAAt > 1:369037/1‑141 (MQ=255) cctactGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAAtt < 2:665814/136‑1 (MQ=255) ctctTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGAAGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCGTATTTTTGATTTCAGGTATTTTGCTTTCTTCGGCTTCAATTa > 1:276297/1‑141 (MQ=255) tctTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTaa > 1:827277/1‑141 (MQ=255) tctTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTaa > 1:827515/1‑141 (MQ=255) tttATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTCTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGa > 1:686978/1‑141 (MQ=255) ttattaATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCACCCCAGCGTCGATGCTAAATGTGATCGGCGTAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTAATTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAg > 1:450240/1‑141 (MQ=255) ttaATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGTGAATGGTGCGCCCCAGCGTGGATGCTGAATATGATCGGCATAAACATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTAGTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTa < 2:328842/141‑1 (MQ=255) accagtttttACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGGCCCAGCGTGGATGCTAATTATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGa < 2:379503/135‑1 (MQ=255) aCCTAGTCTTACAATTTCAATGAAGGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTGTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGa > 2:446539/1‑141 (MQ=255) ccAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGAt > 1:573961/1‑141 (MQ=255) cAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGGGGTAGGGGAtt > 1:119908/1‑141 (MQ=255) aaGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTCAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTc > 1:391608/1‑141 (MQ=255) aGTTTTACAATTTCAATTACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCt < 1:747280/141‑1 (MQ=255) ttACAATTTCAATTACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTTAGGTAGGGGATTCTTTCa < 1:984337/141‑1 (MQ=255) ttACAATTCCAATGACAGGGACTGGTGCGCCCCAGCCTCGATGCCAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCa < 1:40337/141‑1 (MQ=255) aCAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAg < 2:103313/141‑1 (MQ=255) aCAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGACTCTTTCAAg > 1:798809/1‑141 (MQ=255) cAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGt > 1:616524/1‑141 (MQ=255) actttCAATGACAGGGAATGCGTCGCTCCAGCGTCGTTGCTAAATTTGATCCGCATAAAGATGAGGAAGCATATTCTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAAGCAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTg < 2:536998/139‑1 (MQ=255) aagttCAATAACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTGCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTg < 2:392903/138‑1 (MQ=255) aaTTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCCGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTg < 2:358804/141‑1 (MQ=255) aaTTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTg > 2:922816/1‑141 (MQ=255) aaTGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAg > 1:213894/1‑141 (MQ=255) gACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTaa > 2:56348/1‑141 (MQ=255) gTGCGCCCCAGAGTCTATGCTAAATATGATCGGCCTAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCTGCTTCTATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTAGACAAGTAAATTACCAGttt < 1:600745/141‑1 (MQ=255) tGCGCCCCAGCGTCGGTGCTAAATAAGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGCCAAGTAAATTACCAGTTTg > 1:496204/1‑141 (MQ=255) tGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGGTTCTTTCACGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTg > 1:312574/1‑141 (MQ=255) tGCGCCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTg > 1:64780/1‑141 (MQ=255) cgcCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGCGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGaa > 2:39031/1‑141 (MQ=255) cgcCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGaa < 1:741291/141‑1 (MQ=255) cgcCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGaa > 2:694834/1‑141 (MQ=255) cgcCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGaa > 2:194268/1‑141 (MQ=255) cgcCCCAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCCTCTCCTACAATTAAAATTGAGGTAGGCGATTATTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGaa > 1:470947/1‑141 (MQ=255) cAGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCtt < 1:94808/141‑1 (MQ=255) aGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTg > 1:104398/1‑141 (MQ=255) aGCGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGACTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTg > 1:325031/1‑141 (MQ=255) aGCGTCGATGCTAAATATGATCGACATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTg > 2:535772/1‑141 (MQ=255) gCGTCGATGCGAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGTATATTGTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAAGTGAGTTATGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATGACCAGTGTGAATTCtttg < 2:276297/141‑3 (MQ=255) cGTCGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTGGa > 1:370775/1‑141 (MQ=255) cGATGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGCTTTCAGGTATTTTACTTTATTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTAAATTCTTGGATTa > 1:240671/1‑141 (MQ=255) tGCTCAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTGGATTAccc < 2:391608/141‑1 (MQ=255) tGCTAAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGGTTGAATTCTTGGTGTAccc > 1:320500/1‑141 (MQ=255) | TATCTTCATCACCGAATGCAATAATATTATTTCGGTCAATATTTAAAAATTGTCTAACTTGCTCAATGCCTCTTGCTTTATTAATACCAAGTTTTACAATTTCAATGACAGGGAATGGTGCGCCCCAGCGTCGATGCTCAATATGATCGGCATAAAAATGAGTAAGCATATTTTTGATTTCAGGTATTTTACTTTCTTCGGCTTCAATTAAAATTGAGGTAGGGGATTCTTTCAAGTGGACAAGTAAATTACCAGTTTGAATTCTTGGATTACCC > USA300TCH1516_ALE/973075‑973349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |