New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 68659 = | 76 (0.860) | 3 (0.040) | 3/242 | 10.5 | 4.4% | coding (775/852 nt) | USA300TCH1516_00061 | hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 68655 | 63 (0.820) | coding (771/852 nt) | USA300TCH1516_00061 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGGAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCT > USA300TCH1516_ALE/68523‑68797 | agcaaCACCTCCACATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAATTCTGAAACCTTTTACATCAATAATGAGCTTAAACACTCTAAACACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataata < 2:251569/137‑1 (MQ=14) ggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataa > 1:102439/1‑140 (MQ=255) ggAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataa > 1:687570/1‑140 (MQ=255) aaCACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataata > 2:502614/1‑140 (MQ=255) aaCACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataata > 2:358191/1‑140 (MQ=255) aaCACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAAACACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataata > 2:209779/1‑140 (MQ=255) ccGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataa‑‑‑taataat < 1:73717/140‑1 (MQ=255) cGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataa‑‑‑taataata > 1:236764/1‑140 (MQ=255) aTAACGCACCGATAGAAATTTTCCATTCCTCACTAAAGACTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTTGAAAAGTACATTAAAAACaataataataa‑‑‑taataataat < 2:979944/140‑1 (MQ=17) aTAACACTCCAATTGCAACTTGCCATTCCGCTCTAAAGTCTTAAACTTTTTACATCAATAATTAGCTTAACCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACaataataataa‑‑‑taataataat < 2:771437/140‑1 (MQ=17) aCGCCCTGATAGAAAGTTTCTATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGa < 1:20397/140‑1 (MQ=255) cccGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTc < 1:350835/140‑1 (MQ=255) gATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTcaac > 1:527597/1‑140 (MQ=255) agaGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTcaaca < 1:234043/138‑1 (MQ=255) aTAGAATGTTTCCATTCCTCGCTACAGTCTGAAACTTATTACATCAATAATGAGATTAATCACTCTAATCACATTGCAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTcaaca < 1:384306/140‑1 (MQ=18) gAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACaaaa < 1:171588/140‑1 (MQ=255) aaaGTTTCAATTTCTCGGTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAAGCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACaaaaa < 1:334108/140‑1 (MQ=255) aaGTTTCCATTCCTCGATAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAg < 2:406261/140‑1 (MQ=18) ccATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCt < 1:794997/140‑1 (MQ=255) ccATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCt < 1:502614/140‑1 (MQ=255) ttCCTCGCTAAAGTCCGAAACTTATTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACt < 1:772756/140‑1 (MQ=255) ttCCTCGCCAAACTCTGAAACTTGTTACACCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACt < 1:334930/140‑1 (MQ=255) tCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAAC‑‑‑AATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATcccc > 1:876471/1‑140 (MQ=255) gCTAATGTCTGTATCTTTTTTCATCAATATTGAGCTTAGTCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATccc < 1:37177/140‑1 (MQ=25) gCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TACTAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATccc < 2:888914/140‑1 (MQ=255) gCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTATGCTACTTATccc < 1:710631/140‑1 (MQ=255) gCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATccc < 1:150042/140‑1 (MQ=255) aattccgAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAACAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAACTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCGCTGt < 2:611727/134‑1 (MQ=21) aattCTGAAACGTATTACACCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGt < 1:927233/137‑1 (MQ=255) aaGTGTGAAACTTTTTACATCAATGATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCTAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGTCTACTTATCCCCtct < 2:221137/140‑3 (MQ=25) aaGTCTGAAACTTTTTACATCAATAAGGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGt < 1:149321/140‑1 (MQ=255) tCTGAAACTGTTTACATCAATAACGAGCTTAATCACTCTAATCATCTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTaaa < 2:434795/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACag > 2:618871/1‑140 (MQ=255) aCTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACag > 2:641739/1‑140 (MQ=255) tttACATCAATAATGAGCTTAATCCCTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGaa < 1:436682/140‑1 (MQ=255) tttACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGaa < 2:844505/140‑1 (MQ=255) ttaacaacaATAATGAGCTTAATCACTCTTATCACATCGTAATAGAGCTTGTCGAAAAGGACATAAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGaa < 2:667138/137‑1 (MQ=25) atGTGCCTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATACCTTCTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAg < 1:239238/140‑1 (MQ=25) aGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGatc > 1:851350/1‑138 (MQ=255) aGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAAc > 2:484420/1‑140 (MQ=255) gCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACa < 1:151339/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACa > 2:749872/1‑140 (MQ=255) tAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATgg < 2:527597/140‑1 (MQ=255) ctctAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGtttt < 1:618311/140‑1 (MQ=255) tctAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGttttt > 2:1005153/1‑140 (MQ=255) tctAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGATGtgttt > 2:48362/1‑140 (MQ=255) caaaTCAAATTGTAATAGATAATGTCTAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATAAAGAGTCTTCGATGCTGAGAACATGGTGTTTtta < 1:486785/138‑1 (MQ=18) ccaactGTAAAAGCTATTGTCGAAGAGTACATTAAAAACAATAATAATAG‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATGGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAg < 2:689569/135‑1 (MQ=21) cacaTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAg < 2:177136/140‑1 (MQ=255) cacaTAGTAATAGATATTGTAGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAg < 1:962176/140‑1 (MQ=255) cacaCTGTAATAGATATTGTCTAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACCAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAg < 2:40849/140‑1 (MQ=255) acaTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATACTAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTACACGCCAGAGAATTACTCGCCTCGAACATGCGGTTTttcttgcgt > 1:79142/1‑136 (MQ=21) aTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 2:39457/140‑1 (MQ=255) aTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 1:624328/140‑1 (MQ=255) aTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 1:358191/140‑1 (MQ=255) aTTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTc < 2:326282/140‑1 (MQ=255) gTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGACTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAAAACAGGGTGTTTTTATTAAGTTCCCg > 1:154888/1‑140 (MQ=255) atTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAggg < 1:661376/140‑1 (MQ=255) ttGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGt > 2:387438/1‑140 (MQ=255) gTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTACGTTTCCGTTTTAAGGGTTc < 1:749872/140‑1 (MQ=255) caaaaaGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAg < 2:942382/138‑1 (MQ=255) cGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAg > 2:114413/1‑140 (MQ=255) gAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTGGGATACTTATCGTCATTAAAAGAAAGAGAATTAATGGGCTAGAACAGGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGt > 2:184/1‑140 (MQ=18) gAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTCAGTTCCAGTTTTAATGGTTCAGt > 2:167649/1‑140 (MQ=255) aaGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGcc < 2:756359/140‑1 (MQ=255) caaaaTTAAAAACAATAATAAAAACACTAAGAATAATCGATTACAACAATAACTATGCTACTTATCCCCTCTAAAATACCGAGAATTAATAGCCTAAAACATGGTGTTTTTATTAAGTTACCGTTTTAAGGGCTCAGTGc < 2:406060/136‑1 (MQ=255) aCATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAg > 2:334385/1‑140 (MQ=255) aCATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTACCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAg > 2:143070/1‑140 (MQ=255) aCATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCAACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTACGGGTTCGGTGCCCTAg > 1:102119/1‑140 (MQ=255) aaaCAATAAAAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATtata < 2:875756/140‑1 (MQ=255) aCAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAgg < 1:114413/140‑1 (MQ=255) cAATAATAATAA‑‑‑CAACAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGc < 2:154888/140‑1 (MQ=255) aataataataa‑‑‑taataataatCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGct < 2:158245/140‑1 (MQ=255) ataataataa‑‑‑taataataatCGAATTTAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGctc < 1:264345/140‑1 (MQ=255) ataataataa‑‑‑taataataatCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTATGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATATGctc > 2:730679/1‑140 (MQ=255) ataataataa‑‑‑taataataatCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGctc < 1:866985/140‑1 (MQ=255) ataataataa‑‑‑taataataaaCGAAGTTAACCAAAACTCGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGctc < 1:724046/140‑1 (MQ=18) taataataa‑‑‑taataataatCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGctct < 2:731018/140‑1 (MQ=255) | GGGAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCACTCTAATCACATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACAATAATAATAA‑‑‑TAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTATCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCCTAGGATTATAGGCTCT > USA300TCH1516_ALE/68523‑68797 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |