Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 1,233,504 | T→A | V470D (GTT→GAT) | prkC → | Serine/threonine‑protein kinase PrkC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 1,233,504 | 0 | T | A | 98.9% | 281.5 / NA | 94 | V470D (GTT→GAT) | prkC | Serine/threonine‑protein kinase PrkC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (45/47); minor base G (1/0); total (46/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAGT > USA300TCH1516_ALE/1233367‑1233636 | tGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATa > 1:468170/1‑140 (MQ=255) gTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACg < 1:712922/140‑1 (MQ=255) gTGAACGTGGTGAACGGTGTGACAGTGTTGATGTTGGTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAGTGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTGGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACg < 2:749681/140‑1 (MQ=255) tGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGa > 1:357941/1‑140 (MQ=255) tGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATCGCGTTACATCCGAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGa < 1:775532/140‑1 (MQ=255) cGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGGTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGa > 1:677523/1‑140 (MQ=255) gtgtTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGaa > 2:374203/1‑140 (MQ=255) gtgtTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCGTAAAGATAATACGCTTgct > 2:493026/1‑138 (MQ=255) tgtTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGaaa < 1:933517/140‑1 (MQ=255) tgtTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGaaa > 1:168273/1‑140 (MQ=255) tGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATAAGATTGAAAAAg > 1:842441/1‑140 (MQ=255) tggtgACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGtatata < 1:439841/140‑1 (MQ=255) gtgACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATataat > 1:871320/1‑140 (MQ=255) gACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATACCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATAGAAAAAGTATAtaataa > 2:650478/1‑140 (MQ=255) aGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCa < 1:661765/140‑1 (MQ=255) gtgtTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCaa > 2:113560/1‑140 (MQ=255) gtTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAgc > 1:183494/1‑140 (MQ=255) tttaTGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAgcg < 2:935611/137‑1 (MQ=255) atatCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATa > 1:51646/1‑140 (MQ=255) tatCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATAc < 1:155433/140‑1 (MQ=255) tagcAAAGGGGCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGCTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATAc < 1:51700/137‑1 (MQ=255) acaaaaaGGCCATCAAAAAGTGAAACGGCCGAATGTCATTCGTTTACCCAAGGAGGAAGCCTTGCACAAATTAAACTCGTTAGGTCTTAAAGATGACACGATTGAAAAAGTTTATAATCATCAAGCGCCAAAAGGCTACa < 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< 2:139804/139‑1 (MQ=255) aaaaGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAgt > 2:589141/1‑140 (MQ=255) gagggTTAAAATGCAAAATGTCGTTGGTTTACCTGAGGAGGCGGCCTTGCGGGGCGGTATATCTGTAGGTCTTAAAGATGTTGGGATTGGAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAgtg < 2:210365/137‑1 (MQ=255) aaGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAgtgt > 2:353825/1‑140 (MQ=255) aGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATAGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCGAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTa < 1:650478/140‑1 (MQ=255) ggTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTaa > 2:111497/1‑140 (MQ=255) tAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCg > 2:489097/1‑140 (MQ=255) aaTGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCaa > 2:133774/1‑140 (MQ=255) gcAAATGTCATTCGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATAc < 2:151668/139‑1 (MQ=255) ccAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATACTCAACCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATAc < 2:755081/140‑1 (MQ=255) ccAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATAc < 2:754977/140‑1 (MQ=255) aTGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGaa > 1:411960/1‑140 (MQ=255) tCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATc > 2:989938/1‑140 (MQ=255) cATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCg > 1:535169/1‑140 (MQ=255) aTTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGAAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAAGAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGc < 2:528013/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCTACCTAAGGACGAAACCTTGCAGAAATCAAAATCGTGCGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTAAACAACAACCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGAATGTCCCTAAATACTGAAATCGc < 2:462715/140‑1 (MQ=255) ggTTTACCTAAGGAGGAAGCCGTGCAGAAATTAAGAGCGTTAGGGCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACAGTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAAGCGCTAt < 1:911731/140‑1 (MQ=255) gTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTAtt < 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> 2:255160/1‑140 (MQ=255) cTAAGGCGGAAGCCTTGCAGCAATTAATATTGTTAGTTCTTAAAGATGATACGTTTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGAt < 2:946734/140‑1 (MQ=255) tAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCTTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGAtt < 2:845912/140‑1 (MQ=255) tAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGAtt < 2:677523/140‑1 (MQ=255) tAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGAtt < 1:805239/140‑1 (MQ=255) aaGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTc < 2:734986/140‑1 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCt > 2:441830/1‑140 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCt > 1:633486/1‑140 (MQ=255) aggaggAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCt < 1:133774/140‑1 (MQ=255) gagggAGCCTTGAAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATAGGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCTAAATGCAACCGCAAATACTGAAATCGCGATTCATGATTCTaa > 1:709147/1‑140 (MQ=255) gaggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGAGACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAACTCGCGAATCATGATTCTac > 2:155753/1‑139 (MQ=255) aggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATAGTTCTCCAAAAAGGGATGGGGTAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACCGAAATCGCTATTCAGGATTCTAat < 1:734707/140‑1 (MQ=255) ggaAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAata > 1:443854/1‑140 (MQ=255) aaGCCTTGCAGAAACTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGCATATAATAATCAAACGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGAAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATAtt < 2:918406/140‑1 (MQ=255) aGCCTTGCAGAAATTAAAAGCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATCATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTa > 1:603106/1‑140 (MQ=255) gCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTaa > 2:700048/1‑140 (MQ=255) ccTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATGATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTaaa > 2:560239/1‑140 (MQ=255) ccTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTaaa > 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< 1:149340/140‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGa < 1:914581/140‑1 (MQ=255) aTTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATAATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCACAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAAt < 1:614256/140‑1 (MQ=255) ttAAAATCGTTAGGTCTTACAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATc > 1:549879/1‑140 (MQ=255) ttAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATc < 1:73955/140‑1 (MQ=255) aaTCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAACAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTACCCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTa < 2:809131/140‑1 (MQ=255) aaTCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTa < 2:612969/140‑1 (MQ=255) agcGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAg < 1:703878/138‑1 (MQ=255) aTCGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACCATATGAATCTTTAg < 1:552100/140‑1 (MQ=255) cGTTAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAAGCGCAAATACTGAAATCGCTATTGATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAgga > 2:652234/1‑139 (MQ=255) ttAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTTTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCAt > 1:963265/1‑140 (MQ=255) tAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATATTAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAATCTATATGAATCTTTAGGCAtt > 1:696815/1‑140 (MQ=255) tAGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCAtt > 1:531337/1‑140 (MQ=255) aGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTa < 1:777108/140‑1 (MQ=255) aGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTa < 2:537541/140‑1 (MQ=255) aGGTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTa < 1:443851/140‑1 (MQ=255) ggTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTaa > 2:902085/1‑140 (MQ=255) ggTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAAGAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTaa > 2:90623/1‑140 (MQ=255) gTCTTAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAg < 1:549391/140‑1 (MQ=255) tAAAGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAg < 1:221901/140‑1 (MQ=255) aaaGATGATACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCTTGATTTTAATGTTTAATTTTATGATTCTTTAGGAATTTAGTAAGt > 1:247773/1‑140 (MQ=255) | TGGTGAACGTGTTGAACGTGGTGACAGTGTTGATGTTGTTATATCAAAGGGCCCTGAAAAGGTTAAAATGCCAAATGTCATTGGTTTACCTAAGGAGGAAGCCTTGCAGAAATTAAAATCGTTAGGTCTTAAAGATGTTACGATTGAAAAAGTATATAATAATCAAGCGCCAAAAGGATACATTGCAAATCAAAGTGTAACCGCAAATACTGAAATCGCTATTCATGATTCTAATATTAAACTATATGAATCTTTAGGCATTAAGCAAGT > USA300TCH1516_ALE/1233367‑1233636 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |