Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | USA300TCH1516_ALE | 2,289,257 | A→C | V78G (GTA→GGA) | cdaA ← | Cyclic di‑AMP synthase CdaA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | USA300TCH1516_ALE | 2,289,257 | 0 | A | C | 98.5% | 201.3 / NA | 67 | V78G (GTA→GGA) | cdaA | Cyclic di‑AMP synthase CdaA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (31/35); minor base T (0/1); total (31/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGT > USA300TCH1516_ALE/2289123‑2289390 | ttGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccccc > 1:190682/1‑140 (MQ=255) ttGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATcccccc > 1:661561/1‑140 (MQ=255) aaaCCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCAt < 1:394973/140‑1 (MQ=255) ttGAATCAATTTCTCTTAGTCTTTCCTATACTTATTTGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTTCCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATaa < 2:955561/140‑1 (MQ=255) ttGAATCAACTTCTCTTCATCCTTACTATACGCATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATaa < 2:144119/140‑1 (MQ=255) tGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTCCCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAAc > 1:82688/1‑140 (MQ=255) tGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAAc > 2:951801/1‑140 (MQ=255) tGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAAc > 1:303231/1‑140 (MQ=255) tGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAAc > 1:74951/1‑140 (MQ=255) aaTCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAACCTAATCCCCCCCATTGAATAACGa < 1:638639/140‑1 (MQ=255) tctcTTCATCATTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGCGTTAAAACGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTCACGCCCGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTACAGCTAAGCCCCCCCATTGAATAACGATCACGaag > 2:900599/1‑139 (MQ=255) tCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCACCAATTGAATAACGAAATTGaataatat > 1:373325/1‑138 (MQ=255) accTTTACTATACCTATTAAAATTATATCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCCAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAg < 1:427384/138‑1 (MQ=255) aTCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTAAATAACGATATCGAATAATTTAg > 1:683780/1‑140 (MQ=255) cTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCACCTAAATAATGATATCGAATAATTCAGAt > 2:701993/1‑140 (MQ=255) ttACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGt > 2:431811/1‑140 (MQ=255) tataCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTACa > 1:281166/1‑140 (MQ=255) ataCGTATTAGAACTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTCAATAACGAGATCGAATAATTTAGATGTTGCAg < 2:711661/140‑1 (MQ=255) aCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGTTACCTCTTCCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTc < 1:384401/140‑1 (MQ=255) aCGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTc < 1:667331/140‑1 (MQ=255) tATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAg > 1:947397/1‑140 (MQ=255) aTTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGAACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCAAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGt > 1:810900/1‑140 (MQ=255) tAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTc < 2:691959/140‑1 (MQ=255) tAGAAGGATAGCGTGTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTGTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTATTATTAACGCTCTTCCCCCCCATTGAAGAGCGATATCGAATGATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTc < 2:171817/140‑1 (MQ=255) gaggTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa > 2:118901/4‑140 (MQ=255) gAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTTGTTGGAATATTACTATTTAAGCTAATCCCCTCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa < 2:912691/140‑1 (MQ=255) gAAGCATCGCGATTTAAAAAGCTCTTTCTACGAATTTGTTCTCAAGAACGAAATCTTCCTGGCGGGACGAAGAGTGTTAGATCTAATCCCACCAATTGCATACCGATATCGCATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCaa > 2:250368/1‑140 (MQ=255) aaGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAat > 1:383631/1‑140 (MQ=255) aaGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAat > 2:830604/1‑140 (MQ=255) aaGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAat < 1:159339/140‑1 (MQ=255) ttAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATATTTTAGATGTTGCAATCAAGTTCAATATCATACTTAta > 1:406008/1‑139 (MQ=255) aaaGCTACCTCTACCACGTTGTTCTAACGCACGTCTAAGTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGCTGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATcatct > 1:558814/1‑136 (MQ=255) aaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATCATGTAGATGTTGCAGTCAAGCTCAATATCATACATATctgct > 2:146956/1‑140 (MQ=255) aaaGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATAATTATctgct > 2:419970/1‑140 (MQ=255) aGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGa < 2:60666/140‑1 (MQ=255) aGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGa < 2:888682/140‑1 (MQ=255) gCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGAc < 2:176532/140‑1 (MQ=255) ctACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCACCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTTCAGTCAATTTCAATATCATACTTATCTTCTAACCAATAAc > 1:208244/1‑140 (MQ=255) tACCTAGTTGTTCTAACGCACGTCTTATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAACAATTTAGATGTTGCAGTCAATTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACa < 1:482818/140‑1 (MQ=255) tACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACCTATCTGCTGACCAATAACa < 1:531901/140‑1 (MQ=255) gttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTTGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACt < 2:74951/140‑1 (MQ=255) gttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACt < 1:951801/140‑1 (MQ=255) ttgttgTAACGCACCTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTACTAAACCTAAGCCCCCCCATTGACTAACGATATCGAATTATTTAGCTGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTa < 2:97794/140‑1 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTTGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGGTGTTGTAGGCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTa < 1:440191/140‑1 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTa < 1:523822/140‑1 (MQ=255) ttgttCTAACGCACGACTAATTTCTGGTTGGAAAATTACTAATAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTa < 1:412288/140‑1 (MQ=255) gCACGTCCAATTTCTAGTTAGCATCTTACCCTTAAACTCAACCCCCCCCATTTAATAACGATATCGAATAATTTAGATCTTGCAGTCAAGTTCACTATCATACTTCTCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCttt < 1:431811/140‑1 (MQ=255) tCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTa < 1:804870/140‑1 (MQ=255) cTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTCATCCCCCCCATTGAATAACGCTATCGAATAATTTCGATGTTGCAGTCCAGTTCAATATAATACTTCTCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTaa > 1:957836/1‑140 (MQ=255) aaTTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCTATATCATACTTATCTGATGACCAATAACAATTACTAATATGCCTTTAAGTAAtt > 2:241427/1‑140 (MQ=255) tttCTGGTTGGCATATTACTATTAAAGCTTATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt < 1:761354/140‑1 (MQ=255) tttCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt < 1:962959/140‑1 (MQ=255) tttCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTCAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGt > 2:999003/1‑140 (MQ=255) tCTTGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTAt < 1:93494/140‑1 (MQ=255) tcgtcggAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATATTTTAGATGTTGCAGTCAAGTTTAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCg < 1:262822/135‑1 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCg > 2:663271/1‑140 (MQ=255) tGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACAAATAACAATTACTAATATCCCTTAAAGTAATTgaaacg > 1:782029/1‑135 (MQ=255) gggTTGGAATATTACTATTAAATCTTATTCCCCCCATTTAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTGCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCg < 1:312203/139‑1 (MQ=255) ggTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGc > 2:353616/1‑140 (MQ=255) ttGGAATATTACTATTAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCtt < 2:303231/140‑1 (MQ=255) ttGGAATATTACTATTAAAGCTAACCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCtt < 2:82688/140‑1 (MQ=255) ttgAATATTACTATTACTGCTAATCACACCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCttt < 1:332367/138‑1 (MQ=255) tatTACTATTAAAGTTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATATTTATCTGCTGACCCATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc < 2:346926/140‑1 (MQ=255) tatTACTAATAAAGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTc < 2:914482/140‑1 (MQ=255) aGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATTTTTCTTTAAGTAATAGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGAcct > 1:430471/1‑139 (MQ=255) aGCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCg < 1:45268/140‑1 (MQ=255) gCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGt > 2:82718/1‑140 (MQ=255) gCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATAGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGAcatt > 2:853553/1‑137 (MQ=255) gCTAATCCCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAAGATCGTACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGt > 2:806030/1‑140 (MQ=255) | TTGAAACCGATTGAATCAATTTCTCTTCATCTTTACTATACGTATTAGAAGTATAGCGTTTTAAAAAGCTACCTCTACCAAGTTGTTCTAACGCACGTCTAATTTCTGGTTGGAATATTACTATTAAAGCTAATACCCCCCATTGAATAACGATATCGAATAATTTAGATGTTGCAGTCAAGTTCAATATCATACTTATCTGCTGACCAATAACAATTACTAATATCCCTTTAAGTAATTGTATCGCTTTAGTTCCCTTAAAGACCGT > USA300TCH1516_ALE/2289123‑2289390 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |