BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	USA300TCH1516_ALE	707,910	A→G	intergenic (‑1/‑121)	znuC_1 ← / → ideR	High‑affinity zinc uptake system ATP‑binding protein ZnuC/Iron‑dependent repressor IdeR

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*	USA300TCH1516_ALE	707,910	0	A	G	100.0%	284.0 / NA	83	intergenic (‑1/‑121)	znuC_1/ideR	High‑affinity zinc uptake system ATP‑binding protein ZnuC/Iron‑dependent repressor IdeR
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ATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAA  >  USA300TCH1516_ALE/707776‑708045

aTAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGttt                                                                                                                                    <  2:809111/140‑1 (MQ=255)

      gAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGAGGAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATAcct                                                                                                                              >  1:889270/1‑140 (MQ=255)

         gATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTTTAcctcct                                                                                                                           >  1:588118/1‑140 (MQ=255)

         gATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTCTAcctcct                                                                                                                           >  1:694383/1‑140 (MQ=255)

         gATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATAcctcct                                                                                                                           >  1:256446/1‑140 (MQ=255)

         gATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGAATTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGAGTTTATAcctcct                                                                                                                           >  1:54844/1‑140 (MQ=255)

            ttACCAGCACCATTCGGGCCCATGCTACCAATTATTTCACCGAGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAAt                                                                                                                        >  1:751229/1‑140 (MQ=255)

            ttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAATTCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAAt                                                                                                                        >  2:758352/1‑140 (MQ=255)

            ttACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAAt                                                                                                                        >  2:180468/1‑140 (MQ=255)

             tACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAAtt                                                                                                                       >  1:748441/1‑140 (MQ=255)

                   cACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGt                                                                                                                 <  1:847053/140‑1 (MQ=255)

                     ccctgtgggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATTGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGttt                                                                                                               <  2:600611/134‑1 (MQ=255)

                         tCGGTCTCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAGATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGc                                                                                                           <  2:685954/140‑1 (MQ=255)

                         tCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTCTTACCTCCATCACGATTTAATGGTTTGGTCTCCGCATAGCGTTTATACCTCCTAATTAAATGTTTAGGc                                                                                                           <  2:965055/140‑1 (MQ=255)

                          cggtatcATGAGACCATTTTTTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCt                                                                                                          <  2:53688/134‑1 (MQ=255)

                          ccgcgccACGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCt                                                                                                          <  2:181938/135‑1 (MQ=255)

                            ggCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGGAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTTTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTaa                                                                                                        <  2:104604/140‑1 (MQ=255)

                              cccATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTCCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAACGTTTAGGCTAAcc                                                                                                      <  2:587537/140‑1 (MQ=255)

                               ccACGATACCAATTATTTCGCAGCCTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTGTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCt                                                                                                     <  2:161610/140‑1 (MQ=255)

                                catagtACCAATTTTTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTGATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCta                                                                                                    <  2:255596/135‑1 (MQ=255)

                                cATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCta                                                                                                    <  2:344640/140‑1 (MQ=255)

                                  tGATACCCATTACTGCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCCAACAAGTGTGTATTCCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaat                                                                                                  <  2:412629/140‑1 (MQ=255)

                                  tGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTACTTAAAAGTTTAGGCTAACCtaat                                                                                                  <  1:533937/140‑1 (MQ=255)

                                  tGATACCAATTATTTCGCCGACTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaat                                                                                                  <  1:43178/140‑1 (MQ=255)

                                      aCCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCtaattaat                                                                                              >  2:385678/1‑140 (MQ=255)

                                             attTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTataa                                                                                       <  1:253892/140‑1 (MQ=255)

                                             attTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTataa                                                                                       <  2:694006/140‑1 (MQ=255)

                                                tCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATCGTAtaataa                                                                                    >  2:944893/1‑140 (MQ=255)

                                                 cgccgcGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATaaa                                                                                   >  2:131919/1‑140 (MQ=255)

                                                 cgccgcGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCCTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATaaa                                                                                   >  2:132139/1‑140 (MQ=255)

                                                   ccgcGTACCGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACt                                                                                 <  1:423332/140‑1 (MQ=255)

                                                    cgggTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTg                                                                                <  2:519618/137‑1 (MQ=255)

                                                          cTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTCAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTCATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAata                                                                          <  1:613797/140‑1 (MQ=255)

                                                            ggTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATAtt                                                                        <  2:625776/140‑1 (MQ=255)

                                                               aTCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTAt                                                                     <  1:915089/140‑1 (MQ=255)

                                                                   aTAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATg                                                                 <  1:850757/140‑1 (MQ=255)

                                                                       ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCaa                                                             >  1:980350/1‑140 (MQ=255)

                                                                       ggAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTAATCATGTaaa                                                             >  2:297869/1‑140 (MQ=255)

                                                                        gAAATGTTTTTAAGTCCATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAg                                                            <  2:907019/140‑1 (MQ=255)

                                                                        gAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCGTATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAg                                                            <  2:289934/140‑1 (MQ=255)

                                                                          aaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTATCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:606407/140‑1 (MQ=255)

                                                                          aaTGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:180468/140‑1 (MQ=255)

                                                                          aaTGTTTTTAAGTACACGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTa                                                          <  1:610877/140‑1 (MQ=255)

                                                                            tGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTaaa                                                        <  1:643648/140‑1 (MQ=255)

                                                                              gttgtAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAAtt                                                      <  1:267397/136‑1 (MQ=255)

                                                                                tttAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCg                                                    >  2:269361/1‑140 (MQ=255)

                                                                                tttAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATAACTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTGATTGTATAATAAATTGACAATATTTATCATCTCACGTAAATTCg                                                    >  1:810001/1‑140 (MQ=255)

                                                                                 ttAAGTACATGCTTATTAACTAAAAACAGATTTAAATCGTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGt                                                   <  1:27347/140‑1 (MQ=255)

                                                                                       aCATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatata                                             >  1:229325/1‑140 (MQ=255)

                                                                                          tGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataata                                          <  2:349131/140‑1 (MQ=255)

                                                                                          tGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGatataata                                          <  2:633585/140‑1 (MQ=255)

                                                                                             ttattaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAg                                       >  1:863906/1‑140 (MQ=255)

                                                                                              tattaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATAGAATATAGa                                      <  2:839783/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                ttaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATCTAATATAGACa                                    >  1:266148/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                ttaCCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACa                                    >  2:345157/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                   ccTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTACATTCGTGATATAATATAGACAatg                                 >  1:462324/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                   ccTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatg                                 <  1:131919/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                   ccTAAAAACAGATTTAAATCCTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATCACTACTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAatg                                 <  1:132139/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                      aaaaaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTACCCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAAAGAAAaagtag                              >  1:64966/1‑139 (MQ=255)

                                                                                                         aaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTAtgtg                           >  1:656662/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                         aaCAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATAAAGACAATGTAtgtg                           <  1:385678/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                           cAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAATAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAg                         <  1:337399/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                             gATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGTATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGt                       <  1:648336/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                              aTTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTg                      >  2:933384/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                               tttAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACTATGTATGTGAGGTGa                     >  1:588148/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                 tAAATCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCGAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGaaa                   >  1:67674/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                  aaaTCTTTTGTTTCTAACCCGCGAGCATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAg                  >  2:970412/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                  aaaTCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTGTCATGTCACGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAg                  >  1:704204/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                  aaaTCTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAg                  <  1:412623/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                      cTTTTGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATg              >  1:32594/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                      attttGTTTATAAAAAGCATTTATACCTACTAATTAAAAGTCTTGGCAAACCTAATTAATTGACAAATAATCAAAGAATATGTATCATGTCAAGTAAATTCGCGATATAATATAGACAACGTACGTGAGATGAAAGAATg              >  2:286860/2‑140 (MQ=255)

                                                                                                                       ttttGTTTCTTACAAGCGTTTATTCCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGt             <  1:70602/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       ttttGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGt             <  1:3916/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        tttGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATTTCAAGTACATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGtt            <  2:756130/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        tttGTTTCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGtt            <  2:627210/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        tttGTTTATCAAAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGtt            >  2:973742/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                            tttCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACt        >  1:811117/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                            tttCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACt        >  2:157734/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                              tCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTga      <  2:255321/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                              tCTAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTAGGTTAACTga      >  2:232779/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                              tCTAACAAGCCTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTga      <  2:201072/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                tAACAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaag    <  2:516948/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                  aCAAGCGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTgaagaa  <  2:823439/140‑1 (MQ=255)

ATAAGGGAAGATTTACCAGCACCATTCGGGCCCATGATACCAATTATTTCGCCGCGTACTGGTATCGATAAGGAAATGTTTTTAAGTACATGCTTATTACCTAAAAACAGATTTAAATCTTTTGTTTCTAACAAACGTTTATACCTCCTAATTAAAAGTTTAGGCTAACCTAATTAATTGTATAATAAACTGAGAATATTTATCATGTCAAGTAAATTCGTGATATAATATAGACAATGTATGTGAGGTGAAAGTATGTTAACTGAAGAA  >  USA300TCH1516_ALE/707776‑708045

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`