New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
CAATTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAA > CP000731/2107‑2387 | aacttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgct < 1:3831‑M1/1‑1 (MQ=255) cttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacactctactctcaatgacgagtgactttagatactatttattccaattgcttt < 2:731911‑M1/3‑1 (MQ=255) cttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcttt < 1:576656‑M1/3‑1 (MQ=255) cttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgcttt > 2:631446‑M1/139‑141 (MQ=255) aTTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAAttt > 2:322854/1‑141 (MQ=255) aTTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTCTTTAATGAGCATAACTCAGAACCAGCGTATGAATGCGGAAAAAAttt > 1:173313/1‑141 (MQ=255) ttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacggtttactttagatactatttattccaattgctttt < 2:75976‑M1/4‑2 (MQ=255) ttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattccaattgctttt < 2:580802‑M1/4‑2 (MQ=255) ttaaagggcgtagcaaaaaaattagctaaaattgggataaaaggaaacctagctggaatcgcagctactatggtttcgaaggatgtacaatgtaatcttaaatacgggttactttagatactatttattcacattgcTTTa < 1:361172‑M1/4‑1 (MQ=255) aaaGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTAATATAGTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTa < 1:404631/139‑1 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2:624695‑M1/108‑1 (MQ=255) aaGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGTGTCCGAGGCt < 2:741135/141‑1 (MQ=255) aGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTc < 2:54827/141‑1 (MQ=38) aCATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACg < 1:622114/141‑1 (MQ=35) gTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAAt < 1:760277/141‑1 (MQ=31) aTGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACa < 2:282082/141‑1 (MQ=32) gCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAAt > 1:115664/1‑141 (MQ=32) aaaTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATa > 1:198746/1‑141 (MQ=32) aTTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATaaa < 2:752936/141‑1 (MQ=32) TTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGCTTGTTAAGGGTTCCGAGGCCCCACGTCAATAAAACAATTGGCATaaaa < 2:69227‑M1/141‑1 (MQ=255) TTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATaaaa > 1:247558‑M1/1‑141 (MQ=255) | CAATTAGATAAACAAGTTAATAGGTTTTTAAAGAATGATATTCATGTATTAGAAATTCAAATACACAGTAATTGGTTATATATTTCAGCTATTGTTTTTTATGAGGATAAATAAGGAACATCGTATTTATGCCGAAAAAATTTATTGATGTTGAGAAGAACCCTTAACTAAACTTGCAGACGAATGTCGGCATAGCGTGAGCTATTAAGCCGACCATTCGACAAGTTTTGGGATTGTTAAGGGTTCCGAGGCTCAACGTCAATAAAACAATTGGAATAAAA > CP000731/2107‑2387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |