New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913_3_bme_pgi 716720 =288 (1.180)17 (0.110)
+TATTAATTTTAATACAGCCTGCCTTTTATTAATT
8/128 18.8 8.2% intergenic (‑123/+1) ybfG/ybfI pseudogene/pseudogene
?NC_000913_3_bme_pgi 720995 = 302 (1.240)intergenic (+155/+61) ybfK/kdpE uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 314 total aligned reads displayed.

TCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAAT  >  NC_000913_3_bme_pgi/720897‑721094
                                                                                                  |                                                                                                   
   aTAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGc                                                                                                 >  1:375029/1‑100 (MQ=255)
   aTAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGc                                                                                                 <  1:4809680/100‑1 (MQ=255)
    tAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGcc                                                                                                >  1:5346368/1‑100 (MQ=255)
     aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg                                                                                               >  2:4902890/1‑100 (MQ=255)
     aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg                                                                                               >  1:2146197/1‑100 (MQ=255)
      aaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg                                                                                               >  2:4056190/1‑99 (MQ=255)
       aaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGta                                                                                             <  2:5990611/100‑1 (MQ=255)
         aaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatt                                                                                           <  2:680022/100‑1 (MQ=255)
           tGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtattta                                                                                         <  2:1032995/100‑1 (MQ=255)
            gATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttat                                                                                        >  1:5493796/1‑100 (MQ=255)
             aTCAATCTTAATTAATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAGTATAGAATTGGTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttat                                                                                        <  2:4197637/99‑1 (MQ=255)
                aaTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattatt                                                                                    <  2:2099654/100‑1 (MQ=255)
                aaTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat                                                                                     <  2:1174168/99‑1 (MQ=255)
                aaTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat                                                                                     <  2:1578325/99‑1 (MQ=255)
                   cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg                                                                                 >  1:5725974/1‑100 (MQ=255)
                      aaTTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc                                                                               <  2:5134622/99‑1 (MQ=255)
                      aaTTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc                                                                               <  2:1679511/99‑1 (MQ=255)
                      aaTTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCt                                                                              >  1:1738986/1‑100 (MQ=255)
                        tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt                                                                             <  1:2391657/99‑1 (MQ=255)
                        tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt                                                                             >  1:4092552/1‑99 (MQ=255)
                        tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGCTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCttt                                                                            <  1:690337/100‑1 (MQ=255)
                        tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTCTTTTGTGTGGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt                                                                             >  1:606355/1‑99 (MQ=255)
                            tttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAGGCCGTAATAATAAATACGGCttttta                                                                         <  2:4465461/99‑4 (MQ=37)
                            tttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaat                                                                         <  2:5203972/99‑1 (MQ=255)
                            tttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttat                                                                        <  1:1019460/100‑5 (MQ=38)
                            tttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCttttta                                                                         <  2:3573336/99‑4 (MQ=37)
                              taATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatta                                                                       <  1:4067704/99‑1 (MQ=255)
                                atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat                                                                     >  1:2053818/1‑99 (MQ=255)
                                atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata                                                                    <  1:934445/100‑1 (MQ=255)
                                  gatgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTATTtaataa                                                                   >  2:2500783/1‑99 (MQ=255)
                                  gatgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt                                                                                       >  1:866122/1‑79 (MQ=255)
                                  gatgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaataa                                                                   >  1:3104792/1‑99 (MQ=255)
                                    tgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTTTTTTTTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag                                                                >  2:2676065/1‑100 (MQ=255)
                                    tgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa                                                                  <  2:4642629/98‑1 (MQ=255)
                                    tgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag                                                                <  1:3840161/100‑1 (MQ=255)
                                     gaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaataa                                                                   >  2:4581776/1‑96 (MQ=255)
                                      aGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggc                                                              <  1:2674175/100‑1 (MQ=255)
                                      aGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggc                                                              <  1:2304523/100‑1 (MQ=255)
                                      aGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggc                                                              <  1:2580935/100‑1 (MQ=255)
                                      aGCTTTTTACTCAGGAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtat                                                                                            <  2:1914131/70‑1 (MQ=255)
                                       gCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTGATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggca                                                             <  2:2952562/100‑1 (MQ=255)
                                        cTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcag                                                            <  2:786802/100‑1 (MQ=255)
                                        cTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcag                                                            <  1:2933107/100‑1 (MQ=255)
                                         tttttACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaataa                                                                   >  2:3498177/1‑92 (MQ=255)
                                         tttttACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcagg                                                           >  2:2345863/1‑100 (MQ=255)
                                           tttACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcagg                                                           <  1:785480/98‑1 (MQ=255)
                                              ncTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTa                                                      >  1:1157754/2‑100 (MQ=255)
                                               cTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTTTTTTTTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGTTTTTTTTTAATAAAAGGCTGTCTGTAt                                                     >  2:1972677/1‑100 (MQ=255)
                                               cTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAt                                                     >  2:4733982/1‑100 (MQ=255)
                                                  aGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAt                                                     <  2:3247318/97‑1 (MQ=255)
                                                  aGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa                                                   >  1:2537446/1‑99 (MQ=255)
                                                    tAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaaa                                                <  2:4981369/100‑1 (MQ=255)
                                                    tAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaaa                                                <  1:4436150/100‑1 (MQ=255)
                                                      atatAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaaa                                                <  2:217355/98‑1 (MQ=255)
                                                      atatAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAt                                               <  1:5173972/99‑1 (MQ=255)
                                                       tataAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTa                                             <  1:637296/100‑1 (MQ=255)
                                                        ataAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAtt                                              >  2:3854705/1‑98 (MQ=255)
                                                        ataAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTaa                                            >  1:2996544/1‑100 (MQ=255)
                                                         taAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTaa                                            <  1:2872839/99‑1 (MQ=255)
                                                         taAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGCATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAat                                           <  2:4087537/100‑1 (MQ=255)
                                                           aaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata                                          <  1:2745490/99‑1 (MQ=255)
                                                             atatTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTc                                       <  2:1857630/100‑1 (MQ=255)
                                                               atTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCa                                      >  2:2401130/1‑99 (MQ=255)
                                                                ttGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaaa                                    <  1:3679259/100‑1 (MQ=255)
                                                                  gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg                                   <  1:3376563/99‑1 (MQ=255)
                                                                  gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg                                   >  2:2289910/1‑99 (MQ=255)
                                                                  gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg                                   <  2:5721990/99‑1 (MQ=255)
                                                                    aTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGTCTGTATTAAAATTAATATTCAAATCa                                 >  2:4752456/1‑99 (MQ=255)
                                                                     ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCAt                                >  2:1110392/1‑99 (MQ=255)
                                                                       gTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAATGCCGTCTGTTTTAAACTTAatat                                         >  2:3143786/1‑88 (MQ=255)
                                                                       gTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaaa                             >  1:1236088/1‑100 (MQ=255)
                                                                       gTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaaa                             >  1:3615711/1‑100 (MQ=255)
                                                                       gTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATaa                              <  2:5812141/99‑1 (MQ=255)
                                                                        ttATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAc                            <  1:2224202/100‑1 (MQ=255)
                                                                         tATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAcc                           >  2:5390873/1‑100 (MQ=255)
                                                                          aTTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAcc                           >  2:1270712/1‑99 (MQ=255)
                                                                              ttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATa                       <  1:1870483/99‑1 (MQ=255)
                                                                               tgtgtgTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAg                      <  1:1628990/99‑1 (MQ=255)
                                                                                gtgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGa                         >  2:3416230/1‑95 (MQ=255)
                                                                                 tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc                    <  1:5276072/99‑1 (MQ=255)
                                                                                 tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc                    <  1:1357831/99‑1 (MQ=255)
                                                                                 tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc                    <  1:4485796/99‑1 (MQ=255)
                                                                                 tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc                    <  1:2150900/99‑1 (MQ=255)
                                                                                 tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc                    <  1:3292335/99‑1 (MQ=255)
                                                                                   tgttgtTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa                  >  1:423538/1‑99 (MQ=255)
                                                                                    gttgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATa                >  1:1028798/1‑100 (MQ=255)
                                                                                     ttgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATAc               <  1:4998663/100‑1 (MQ=255)
                                                                                       gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTCTTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCg             >  1:5899986/1‑100 (MQ=255)
                                                                                       gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCg             >  1:3466034/1‑100 (MQ=255)
                                                                                        tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg            <  2:4356830/100‑1 (MQ=255)
                                                                                        tttAAGACAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg            >  2:5977827/1‑100 (MQ=255)
                                                                                           aaGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGtt          >  2:3691573/1‑99 (MQ=255)
                                                                                            aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGttt         >  2:1783853/1‑99 (MQ=255)
                                                                                            aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGACAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc        <  1:4567357/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             gATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGttt         >  2:1413604/1‑98 (MQ=255)
                                                                                               nttaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg      >  2:377431/4‑99 (MQ=37)
                                                                                               attaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg      >  1:3238925/4‑99 (MQ=37)
                                                                                                 taaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa   >  2:5632901/2‑100 (MQ=37)
                                                                                                 aaaaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa   <  2:2546553/100‑1 (MQ=255)
                                                                                                  aaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCTATACCGGTTTCTGTAAt  >  1:5069886/1‑100 (MQ=37)
                                                                                                  |                                                                                                   
TCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAAT  >  NC_000913_3_bme_pgi/720897‑721094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.