| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 385205 | 241 (1.130) | 36 (0.180) | 16/180 | 18.6 | 14.1% | intergenic (‑589/‑27) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 385217 | 216 (1.110) | intergenic (‑601/‑15) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/385099‑385205‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctcccCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA < NC_000913_3_bme_pgi/385217‑385119 TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 2:1231966/100‑1TTGCATATTTAATCGTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC < 2:1231300/100‑1 TGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTCTTCCTGCATACT > 2:2278987/1‑100 TGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACT > 2:1593493/1‑100 GCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATCCCTGAATACTG > 2:3531246/1‑100 CATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGC < 1:4996262/100‑1 CATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTG < 2:645759/99‑1 CATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTG < 2:645290/99‑1 CATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATAC > 2:5053619/1‑97 ATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC > 1:4279454/1‑100 ATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC > 1:4149961/1‑100 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC < 1:1337774/100‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC < 2:4556638/100‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC < 2:3264976/100‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC < 2:2451509/100‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC < 1:800314/100‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC > 2:2038247/1‑99 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC < 1:2213330/99‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC > 1:1665861/1‑99 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC < 2:519285/99‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC < 2:3544721/99‑1 TTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCC < 1:4832508/99‑1 GCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGG < 1:1269895/100‑1 CCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGG < 1:3673549/99‑1 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 1:2863736/99‑1 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 1:2149183/99‑1 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 2:46940/99‑1 TTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAG < 2:3805833/99‑1 TTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGT < 1:714383/99‑1 TTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGT < 2:465948/99‑1 TTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGT < 1:3445892/99‑1 TTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAAGTCTTTTAGTGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTTTCTTGTTATGGGAGCAGT < 2:1196440/99‑1 TTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTA < 2:4538695/99‑1 TTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTA < 2:966058/99‑1 TTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTA < 1:3126555/99‑1 TTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTAT < 1:2042629/99‑1 TGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATT < 1:5215825/99‑1 TGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATT < 2:986790/99‑1 TGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTAT < 2:4052037/98‑1 GCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTC < 2:464506/99‑1 GCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTC < 1:2921973/99‑1 GCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTC < 1:5160671/99‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 1:4332871/100‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 2:2540318/100‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 2:2509321/100‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAG < 1:156972/100‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCA < 2:3821971/99‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCA < 1:1593588/99‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCA < 2:603319/99‑1 CTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCA < 1:1652175/99‑1 AGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAA < 1:3073052/100‑1 AGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGA < 2:1380686/99‑1 AGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGG < 1:541922/98‑1 ATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACA < 2:4487693/100‑1 TGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAA < 2:3779653/84‑1 ACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGT < 1:4090287/100‑1 ATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAG < 1:859155/100‑1 TATTCCTGAATACTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTAT < 1:1790405/99‑1 CTGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAA > 2:3088364/1‑99 TGCTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAA > 1:2180124/1‑100 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CTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTGGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACG > 1:5170646/1‑100 CTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACG > 1:2604545/1‑100 CTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACG > 2:359116/1‑100 CTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACG > 2:4186229/1‑100 CTCCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACG > 1:2111088/1‑100 CTCCCCGGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGAAAAAAAACG < 2:1812382/100‑1 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:681872/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 2:4994682/1‑100 CCCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:3551501/1‑100 CCCCTGTATTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGCATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGG > 2:5224034/1‑99 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:2407722/1‑99 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC < 1:4613261/99‑1 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:3830101/1‑99 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGC > 1:570225/1‑99 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGG < 1:1411947/98‑1 CCCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGG < 1:7663/98‑1 CCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA < 2:2467197/100‑1 CCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCT > 1:3569918/1‑99 CCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCT > 1:2210710/1‑99 TTGCATATTTAATCTTTCCTTAGCCGTTTTTTTGCTAAGAATAAAATCATCTGTGCGATAACGACTAATTCTTTTAATGAATGTTTTTATTCCTGAATACTGCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/385099‑385205‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctcccCTGTCTTGTTATGGGAGCAGTATTCAGGAATAAAAACATTCATTAAAAGAATTAGTCGTTATCGCACAGATGATTTTATTCTTAGCAAAAAAACGGCTA < NC_000913_3_bme_pgi/385217‑385119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |