| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 2700568 | 259 (1.220) | 23 (0.130) | 11/158 | 19.4 | 10.0% | noncoding (49/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
| ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 2700581 | 206 (1.200) | noncoding (62/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/2700451‑2700568‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaaaagtaaaacccccgAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACAA < NC_000913_3_bme_pgi/2700581‑2700483 CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGT > 1:545711/1‑100CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGT < 2:3688324/100‑1CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGT < 2:1934384/100‑1CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGT > 2:1967222/1‑100 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GAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTA > 2:3210344/1‑99 GAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTA > 2:3226947/1‑99 GAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTT < 2:3770197/98‑1 AGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAA < 1:3623246/100‑1 AGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAA < 1:775673/100‑1 TTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAA < 1:8101/100‑1 TTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAG > 1:9738/1‑100 TTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAG > 2:2391968/1‑99 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TGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAA < 2:4293464/99‑1 nCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAAC > 1:2539733/2‑100 GCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAAC > 2:3175832/1‑100 GCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAAC > 2:2188325/1‑100 GCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAAC > 2:1843857/1‑100 CTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACC > 2:288025/1‑100 CTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACC > 1:174884/1‑100 CTAAAGATTGCAAGTTGCTGGTAATAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACg < 2:4911557/100‑2 TAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCC > 1:1365186/1‑100 AAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGCTAAAACGTAAAACCCC > 2:485667/1‑100 agGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCC < 2:4633007/98‑1 AAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCC < 1:258855/99‑1 AGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCC < 2:1674229/98‑1 TAATAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG < 2:3225472/83‑1 AGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTT < 1:4621298/100‑1 ATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTT < 2:1699026/100‑1 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ACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACACCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTT > 2:4627044/1‑100 CCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTT > 2:1848941/1‑100 CCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTT > 1:3328347/1‑100 CCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTT < 2:1395291/100‑1 CCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTT < 2:982708/100‑1 CCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTT < 2:4602947/100‑1 CCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTT < 2:2783908/98‑1 CCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTA > 2:4116142/1‑100 CCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTA < 1:688375/100‑1 CCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTA > 1:3670898/1‑100 CCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTA > 1:3403916/1‑100 CCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACGTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTT < 2:4757297/97‑1 CGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACA < 2:472277/100‑1 CGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACA < 1:1207703/100‑1 CGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTAC > 1:1756654/1‑99 CTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_bme_pgi/2700451‑2700568‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaaaagtaaaacccccgAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACTTTAATTTTGTGCAGCATGCACCCTCAACAACAGCGATTATGGATCAGTGTACTTATCTTTTACAA < NC_000913_3_bme_pgi/2700581‑2700483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |