Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913_3_bme_pgi | 198,073 | G→A | 5.8% | R49H (CGC→CAC) | bamA → | BamABCDE complex OM biogenesis outer membrane pore‑forming assembly factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913_3_bme_pgi | 198,073 | 0 | G | A | 5.8% | 193.5 / 2.0 | 69 | R49H (CGC→CAC) | bamA | BamABCDE complex OM biogenesis outer membrane pore‑forming assembly factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/38); new base A (2/2); total (29/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.97e-01 |
TGGCGATGAAAAAGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCATTAC > NC_000913_3_bme_pgi/197929‑198220 | tGGCGATGAAAAAGTTGCCCATAGGGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGTTATTCATTTCGCAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGcaca < 2:224032/149‑1 (MQ=255) gggCGATGAAAAAGTTGCTCATAGCGCCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGcaca < 1:525017/148‑1 (MQ=255) ggggATGAAAAAGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGTTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCATCGTGTCGCCGTTTGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAg < 2:73514/146‑1 (MQ=255) ggCGATGAAAAAGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCTGCGCCTCCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAg < 1:327881/149‑1 (MQ=255) ggCGATGAAAAAGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATTCGGTGTTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAg < 1:15679/149‑1 (MQ=255) gAAAAATTTGCGCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTCTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGaca < 2:691171/149‑1 (MQ=255) gAAAAAGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGaca < 1:90968/149‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGacac > 1:703740/1‑149 (MQ=255) cTCATAGCGTTGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGGTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAatga < 1:144699/149‑1 (MQ=255) tCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGCAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAatgat > 2:50505/1‑149 (MQ=255) tCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCACACAGGCGACACGGTTAatgat > 1:123195/1‑149 (MQ=255) tCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCACACAGGCGACACGGTTAatgat > 1:124804/1‑149 (MQ=255) tAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGaa < 1:726779/149‑1 (MQ=255) caGCGTCGGTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTTCTGAAGGGTTCGTAGTGAATGATATTCATTTCGAAGGGCTTCAGAGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGaa < 1:344368/148‑1 (MQ=255) gCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGGGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGa < 1:368551/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGata < 1:653357/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGTTTAGCAGCGGCACCGGATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGatat < 2:790130/149‑1 (MQ=255) tgctgTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGt > 1:138826/1‑149 (MQ=255) ctgTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCTTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTaa < 1:775495/149‑1 (MQ=255) ctgTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTaa < 1:739778/149‑1 (MQ=255) ctgTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGACCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGATGATATCAGTaa > 1:95952/1‑149 (MQ=255) tgTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGTTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGTCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCTCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAAt < 1:220905/149‑1 (MQ=255) gTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATa < 2:882765/149‑1 (MQ=255) gTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGATTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTAGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGTTGCGCACAGGCGACACGGTTAATTATGACAATATCAGTGATa > 2:813067/1‑149 (MQ=255) tttAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATAc < 2:249814/149‑1 (MQ=255) tttAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATAc < 2:273491/149‑1 (MQ=255) acggcCACCGTATACGGTTCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGATGGCTTTCAGTGTGTCGTCGTTGGTGCGGTCCTTGTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTcg < 1:310506/146‑1 (MQ=255) ctGCAGAAGGGATCGTAGTCAAAGAAAATCATATCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTAcc > 2:757270/2‑149 (MQ=255) tGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGca > 2:731339/1‑86 (MQ=255) tGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGca < 1:731339/86‑1 (MQ=255) aaGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAAc > 1:864385/1‑149 (MQ=255) tggtggTGAAAGATATTCATTTTCGAGGCCTTCAGCGGGTCGCTGTTGGTGCGGCTCTCCGCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACATGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAg < 2:62083/144‑1 (MQ=255) gTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGACGCTGATTTGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTTCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTATGAGGa > 2:148082/1‑149 (MQ=255) aaaGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTAc < 1:345945/128‑1 (MQ=255) aaaGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTAc > 2:345945/1‑128 (MQ=255) aaaGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCCGCACTCCTCAGTCTGCCGGAGCGCACAGGCGACACGGTTAACGATGAAGACATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGCTTGCTACTGGCAACTTTGAGGATGTTcg > 2:633911/1‑149 (MQ=255) atcttCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCCGCGTTGGTGCGGACCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACTGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTc < 1:774611/146‑1 (MQ=255) ttCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTGCTCAGTATGCCGGAAAGAAAAAGAGGCGCTGTTTATAAAGAAGTGATACGTAACACCATAGGCGCTCGGTTTGATACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCtt > 2:223183/1‑149 (MQ=255) ttCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCAtt < 1:172464/104‑1 (MQ=255) ttCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCAtt > 2:172464/1‑104 (MQ=255) aTTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACCTTGAGGATGTACGCGACCTTCGt > 1:872252/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGAt < 2:740815/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATg < 1:50505/149‑1 (MQ=255) cGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTCGTCGATTTCAGCTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATg < 1:666554/149‑1 (MQ=255) agAAGGCCTTCAGCGTGTCTCTGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGACGAAGATATCAGTAATACCATT‑‑CGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGt < 1:233139/148‑1 (MQ=255) aaGGCCTGCAGCGTGTCGCCGTGGGTGCGCCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCAAAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATAGCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGt < 2:287394/149‑1 (MQ=255) ggCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCGCTTCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGa < 1:787103/149‑1 (MQ=255) ggCCTTCAGCGTGGCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTAGGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGa < 2:38586/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATa < 1:89534/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATAc > 1:316633/1‑149 (MQ=255) ttCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATAcc > 2:723347/1‑149 (MQ=255) aGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCtt > 2:725771/1‑149 (MQ=255) tgtCCCCGGTGGTCCGGCCCTCCCCAGGATGCCGGTGCGCACAGGCGACAGGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTgg < 2:134420/149‑1 (MQ=255) cGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCACACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGaa < 2:124804/149‑1 (MQ=255) cGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCACACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGaa < 2:123195/149‑1 (MQ=255) cccTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGGAAGACCATGCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTAATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAAAGt > 1:172299/1‑149 (MQ=255) tcctcAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCg > 1:175853/1‑149 (MQ=255) tcctcAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCg > 1:5561/1‑149 (MQ=255) cctcAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATATTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTCAAAGaagatccta > 1:65184/1‑142 (MQ=255) ctcAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCACGGAAAAGAACGTCTGAc > 1:894552/1‑149 (MQ=255) ctcAGTATGCCGGTCCGCACAAGCGACACGGTTAATGATGAAGCTATCAGTAATACCATTCGCGCTCTATTTGCTACCGGCAACTTAGAGGCTGTTTGAGTCCCTCCTGATCGCCATACTCATCTGACTAACGTAAAAGAACGTCCTAc > 2:797530/1‑149 (MQ=255) tcAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCAAACGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAAATTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGAcc > 1:253238/1‑149 (MQ=255) gTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCAtt < 1:723347/149‑1 (MQ=255) tATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCAGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTg > 2:368977/1‑149 (MQ=255) tGCAGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTAGCGCTCTGTTTGCTACCGGAAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCGTTCTGGATCAGGTAAAAGAACGTACAACCATTGcc > 2:493897/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCa < 2:175853/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGCAGATATCAGTAATACCATTCGCGTACTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCa < 1:774081/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCACAGGCGACACGGTTAAGTATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGTGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCa < 2:509237/149‑1 (MQ=255) tGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCAtt > 2:136062/1‑149 (MQ=255) gcgcACAGGCGACATGGTTAATGTTGAAGATATCAGTAATACCATTCGCTCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCATTa < 2:200887/149‑1 (MQ=255) cgcACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCATTAc > 1:101553/1‑149 (MQ=255) | TGGCGATGAAAAAGTTGCTCATAGCGTCGCTGCTGTTTAGCAGCGCCACCGTATACGGTGCTGAAGGGTTCGTAGTGAAAGATATTCATTTCGAAGGCCTTCAGCGTGTCGCCGTTGGTGCGGCCCTCCTCAGTATGCCGGTGCGCACAGGCGACACGGTTAATGATGAAGATATCAGTAATACCATTCGCGCTCTGTTTGCTACCGGCAACTTTGAGGATGTTCGCGTCCTTCGTGATGGTGATACCCTTCTGGTTCAGGTAAAAGAACGTCCGACCATTGCCAGCATTAC > NC_000913_3_bme_pgi/197929‑198220 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |