New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_bme_pgi | = 2304902 | 38 (0.510) | 7 (0.090) | 6/280 | 10.1 | 15.7% | noncoding (486/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
? | NC_000913_3_bme_pgi | = 2304985 | NA (NA) | noncoding (569/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTT > NC_000913_3_bme_pgi/2304866‑2305130 | cccGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCaa < 2:1067039/149‑1 (MQ=31) ccGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGGTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTCTGGAGTGCTCCACCCCGTAGGACGGATAAGGCGCTTACACCGCCTCCAAc > 2:700042/1‑149 (MQ=11) ccGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAAc < 1:378679/149‑1 (MQ=32) cGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa > 2:581666/1‑149 (MQ=32) cGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 1:27232/149‑1 (MQ=32) cGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 1:1310643/149‑1 (MQ=32) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGATATCTGACTCCCAACCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAAAATCTaa > 1:652938/1‑149 (MQ=11) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATTTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTaa < 1:830247/149‑1 (MQ=25) gTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGCCTTATCAGGCCTACACCGCTGCGAAATGCCCCACCCCATAGGTTGTATAACGCGCTCGCGCCCCCTCCCACATCtta > 2:305489/1‑147 (MQ=11) gTCGGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTaa < 1:526105/149‑1 (MQ=25) tCGGATAAGGCGGTGACGCCGCATCCGACATCTAAGGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAAc < 2:919417/149‑1 (MQ=25) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCACGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATCTGGCGGTTACGCCCCCTCCAACATCAAAAGcc > 1:744457/1‑149 (MQ=11) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGa < 2:1242537/149‑1 (MQ=39) ctcggccgcATGCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGtt < 1:765073/145‑1 (MQ=11) gcATCCGCCATCAAACGCCCAAGCCGGCTGCCTGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGAGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAt < 2:872314/149‑1 (MQ=11) ccGATATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGATGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGa < 1:975680/149‑1 (MQ=255) ccGACATCTAACGCCCAAGCGGGTTTCGTGATGCGCCGCTGTCACGTCTTATCAGGCTCACACCGCTGTGAAGTGCTCCTCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGa < 1:834507/149‑1 (MQ=11) ccGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTGACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGa < 1:1050860/149‑1 (MQ=255) gACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCACCATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACg > 1:99531/1‑149 (MQ=255) gACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACAt > 1:829269/1‑118 (MQ=33) gACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACAGCTGTGGAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCGCCTGGCAACATCGACCGCCCGCGCCGGTTGACTGGTgcggcg > 2:70391/1‑149 (MQ=11) tCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGAAGTGTCGTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGTATCACGCGGTTACGCCGCCTCCAACATCTAATGCCCGAGCCGGTGGCCTCGTGCgcggcttg > 2:225162/1‑142 (MQ=11) tAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGAGGCTGgcg > 1:1216626/1‑149 (MQ=38) aaCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc > 1:294372/1‑149 (MQ=37) aaCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGACTCCACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTGGGATAGATAACTCGGTTACGCCGCAGCCAACGTCTAGCGCGCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCCGgcgc > 2:450710/1‑149 (MQ=11) aCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGGAGTGCTCCAGCCGGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCGGAGCCGGTTGCGTGATGTGAAGGTGgcgag > 1:353497/1‑147 (MQ=11) gCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc > 2:1038796/1‑149 (MQ=39) ccAAGCCGATTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGGCtt > 1:1249141/1‑149 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCGAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGGAGCTGGCGCGTCTTAT‑Ca > 1:840319/1‑149 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATAc < 1:581666/149‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGATTTTCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGcc < 1:1240236/149‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACACCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCca > 1:869357/1‑149 (MQ=255) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATc > 2:51765/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCgg > 2:1128836/1‑149 (MQ=255) tGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTCGCGCGTCTTCT‑CAGCATCCGCCACCTCCgcacta > 2:1267121/1‑144 (MQ=14) ccgTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGTATAAGGCGGTTACTCCGCAGCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCAt < 1:606118/148‑1 (MQ=255) gTCTTATTAGGCCTCCCCCCCTGGAAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGc < 1:903977/149‑1 (MQ=18) ttttATCAGGTCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGcc < 1:998753/147‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGa < 1:194257/149‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAt < 1:1317268/149‑1 (MQ=255) tCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtg < 1:722399/149‑1 (MQ=255) aaGGTCTACACCGCTGTTAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGGTAAGGTGGTTACGCCACATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtgt < 1:1059231/148‑1 (MQ=18) aGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtgtg > 1:955929/1‑149 (MQ=255) ggCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTgg > 2:643415/1‑149 (MQ=255) gCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGc < 1:702297/149‑1 (MQ=255) cTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑Ca > 2:1205561/1‑110 (MQ=40) cTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑Ca < 1:1205561/110‑1 (MQ=40) cTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGt < 1:688649/149‑1 (MQ=255) cTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCACCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGCAGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGt > 2:1134732/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTCCTGCAACA‑ACTCGACTTCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTAt < 1:651897/149‑1 (MQ=17) aaacCGCCGTGAAGTGGGGCACCCCGTAGGTTAGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTAt < 2:724595/147‑1 (MQ=17) cacCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATc < 1:1139618/149‑1 (MQ=255) ccGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGCGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCTGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCAt > 1:460234/1‑149 (MQ=255) cGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCGGGATGTGGCGTATCAtt > 1:343674/1‑149 (MQ=255) cGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCACCATCTACCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCAtt < 1:1270710/149‑1 (MQ=255) cTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTAc > 2:414512/1‑149 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCt > 1:1187409/1‑83 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCt < 2:1187409/83‑1 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtgtg < 2:869568/130‑1 (MQ=255) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGAtgtg > 1:869568/1‑130 (MQ=255) tGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGNTGGGGNGNTGCATTACCACGCAat > 1:798298/1‑149 (MQ=21) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAatat > 2:1217099/1‑149 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCCTGCCGGGTACTGCGTATCATTACAACGCAATATcc > 2:609662/1‑149 (MQ=21) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGAGc > 2:63607/1‑55 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGc < 1:63607/55‑1 (MQ=255) cccccGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc < 2:452533/148‑1 (MQ=255) aCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc < 1:258675/149‑1 (MQ=255) aCCCCGTAGGTCGGATTAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACCCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCCGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGc < 1:1131817/149‑1 (MQ=255) ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCa < 1:655220/106‑1 (MQ=255) ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCa > 2:655220/1‑106 (MQ=255) cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATGGTATGCCGGa > 1:555276/1‑115 (MQ=255) gTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCCctc > 2:1271890/1‑148 (MQ=255) | CCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAT‑CAGCATACGCCACATCCGGCATACCATGCCGGATGTGGCGTATCATTACAACGCAATATCCGCCACTT > NC_000913_3_bme_pgi/2304866‑2305130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |