New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_bme_pgi | 1722616 = | 68 (1.160) | 3 (0.060) | 3/276 | 7.6 | 4.4% | coding (496/2013 nt) | ydhK | putative efflux protein (PET) component of YdhJK efflux pump |
? | NC_000913_3_bme_pgi | = 1722612 | 66 (1.210) | coding (492/2013 nt) | ydhK | putative efflux protein (PET) component of YdhJK efflux pump | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATGAAGGGGTGATTGGG > NC_000913_3_bme_pgi/1722468‑1722765 | tAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatgat < 2:700244/150‑1 (MQ=255) gcgTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTTAGGCCAGCCAGCTGTGGGATAACGCTGAGGCGCGCGTTTGCGAGGGAAGAGTCTGTATTTAGTGCGCCGGCatgatgatgatg > 2:402733/1‑150 (MQ=255) tATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCTGGCGCGCGTTTGCGTGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCAGGATGATGATGATc > 1:382826/1‑150 (MQ=255) aTGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGTGGCCAGCGAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATTGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATcc < 2:870476/150‑1 (MQ=255) tGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCt > 1:680965/1‑150 (MQ=255) tGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCt > 1:858731/1‑150 (MQ=255) tGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCt > 1:943500/1‑150 (MQ=255) cATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCTGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGc < 1:246931/150‑1 (MQ=255) aTTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGcc < 1:128545/150‑1 (MQ=255) aTTTCAACTGGCGGGCTACACCGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTATGTCCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGcc > 1:290083/1‑150 (MQ=255) tCAACTGGCGGGATACACGGCGTCCATCATCGACTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCATCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAg < 1:586462/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGc > 2:486307/1‑150 (MQ=255) cGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGTCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCg < 2:444386/150‑1 (MQ=255) cGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCg < 2:673407/150‑1 (MQ=255) cGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCg < 2:680965/150‑1 (MQ=255) cGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCg < 2:858731/150‑1 (MQ=255) gggCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCTGTATTTTTTGCGGCGGCTTGATGATGATGATCCTGCGGAGCAGTTGCGa > 2:110945/1‑150 (MQ=255) tACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCt > 1:732844/1‑150 (MQ=255) cTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCACTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTCTTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGccc < 1:468501/150‑1 (MQ=255) gCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTa > 1:301497/1‑150 (MQ=255) ccATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCttt > 2:17280/1‑150 (MQ=255) ccATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCttt > 2:494641/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCTGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGc > 2:153165/1‑150 (MQ=255) gCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTg < 2:76488/150‑1 (MQ=255) ctatCCGATGGTTAATAATACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCTTGATCATGATGAACCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGACCTTTTAACCGCAtt > 1:260169/4‑150 (MQ=255) cTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAtt > 1:343892/1‑150 (MQ=255) cTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAtt > 1:907384/1‑150 (MQ=255) cTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTACCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCAtt > 2:229319/1‑150 (MQ=255) cGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCACTTTAAACAGCATTGaaaa > 2:71506/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAAc < 2:21696/149‑1 (MQ=255) aTGGTAAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAAc < 1:46249/150‑1 (MQ=255) ggTTAATATTACTTAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGAATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCATTTTAACCGCATTGAAAAACAt > 2:267714/1‑150 (MQ=255) ggTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGAATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCCACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACAt > 1:864143/1‑150 (MQ=255) tAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATATTCTGCGGCGGCATGAAGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACGGCATTGAAAAACATGCa > 1:383565/1‑150 (MQ=255) atatTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACg > 1:944196/1‑150 (MQ=255) tatTACTGATGCCAGCCAGATGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc < 1:80703/150‑1 (MQ=255) tatTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATCGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc < 1:49051/150‑1 (MQ=255) atTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGcc < 2:751148/150‑1 (MQ=255) atTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGcc < 1:489687/150‑1 (MQ=255) tGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGAtt > 2:653817/1‑150 (MQ=255) gAGGCCAGTCAGCTGTGGGATATCGCTAAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATACTCGGTATTTTGTGCTGCTGCATGATGAAGATGATGGTGCCGAGCAGTAACGATGCTACTGCCCTTGTTAGCGCATTGAACGACATACACGCCCGATTa > 2:541232/1‑150 (MQ=255) gccagccaGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCCACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTg < 2:864143/150‑1 (MQ=255) gccagccaGCTGGGGGAGATCGCGCACGCGCGCGTTTGCGAGGAAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTg < 2:306987/150‑1 (MQ=255) agccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTTGaa > 2:647218/1‑150 (MQ=255) gtgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGttt < 2:301497/150‑1 (MQ=255) tgGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGt > 2:723525/1‑150 (MQ=255) gggATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCTAGtt < 1:295110/150‑1 (MQ=255) tatCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAACACATGCACGCCCGCTTACTGGAACATGCCAGTTAAct > 2:852686/1‑150 (MQ=255) tatCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTACGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCCCGCCCGATTACTGTAACATGCCAGATTAct > 2:856390/1‑150 (MQ=255) gCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTgg < 1:881413/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTAGAACATGCCAGTTTACTCTgg < 1:647218/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCGTGTGCGAGGTAATAGGCGGTATTATGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGGCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAg < 1:891368/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGcc > 2:259142/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGAATACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGcc > 2:580941/1‑150 (MQ=255) cgTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGAAGTTACGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAaac > 1:419238/1‑150 (MQ=255) ggtagCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGCTGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGAAGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAaacc < 1:112760/146‑2 (MQ=255) cGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGGAGCCTGAAACAACCGa > 1:595631/1‑150 (MQ=255) cGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGa > 2:865785/1‑150 (MQ=255) gAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGCAACAACCGAt > 1:707495/1‑150 (MQ=255) aGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGCTGCTACTGCCCTTTTTCCCGCATTGAAAAACCTGCACGCCCGATTACTGGAACATGCGAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATg > 1:806547/1‑150 (MQ=255) aTAGGCGGTATATTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCAtt < 2:732844/150‑1 (MQ=255) gggTATTTTCTGCTGCCGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTCGCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTCGAACATGCCAGTTTAATCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgc < 2:260169/149‑1 (MQ=255) cGGTATTTTGTTCGGCGGCTTGATGATGATGTTCCTGCAGAGCAGTTCCGATGCTACTGGCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgc < 1:402733/150‑1 (MQ=255) cGGTATTTTGTGGGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgc < 2:907384/150‑1 (MQ=255) cGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgc < 2:343892/150‑1 (MQ=255) aTTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTgcagca > 1:39672/1‑150 (MQ=255) tgtgCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATg > 1:937349/1‑150 (MQ=255) cggcATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCCCATGAAGGGGt > 2:409041/1‑150 (MQ=255) cggaATGATGATGATGATCCTGCCGTGCAGTGCCGATGCTACTGCCCTTTACACCGCATTGAAAAAGATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTGTGTCAGCATTAAACCACCGATGCGATTCGTGCAGCACATGAAGGGGt < 1:550785/150‑1 (MQ=255) gcATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACACCCGATGCCATTAGTGCAGCACATGAAGGGGTGa > 1:876797/1‑150 (MQ=255) tgatgatgatgaTCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATGAAGGGGTGATTg < 1:723525/150‑1 (MQ=255) atgatgatcatCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCATTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATGAAGGGGTGATTggg < 2:316851/150‑1 (MQ=255) | TAACGTCGCGTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATGAAGGGGTGATTGGG > NC_000913_3_bme_pgi/1722468‑1722765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |