New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4222777 | 1351 (14.700) | 65 (0.740) | 20/284 | 4.9 | 4.9% | intergenic (‑290/+27) | arpA/iclR | ankyrin repeat protein/transcriptional repressor |
? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4222785 | 1232 (14.070) | intergenic (‑298/+19) | arpA/iclR | ankyrin repeat protein/transcriptional repressor | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_hsa_pgi/4222622‑4222777 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggcagaGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAACA < NC_000913_3_hsa_pgi/4222785‑4222637 gtGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATG < 1:805507/148‑1 gatATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATG < 2:377211/147‑1 GAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATG < 2:1382658/150‑1 GAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATG < 1:784843/150‑1 GAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATG < 2:1278922/150‑1 GAGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATG < 1:480223/150‑1 tGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 2:433109/149‑1 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATTATGG > 1:1421377/1‑150 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 1:1290463/150‑1 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 1:1466613/150‑1 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 2:1179707/150‑1 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG > 1:576175/1‑150 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG > 2:713012/1‑150 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 2:728755/150‑1 AGATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGGTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG > 2:1261498/1‑150 AGATCTTGCGATTTTCTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGAAATTAAGATATTTTGGCGTCAATGCGATTAAAAGACACACTTATTCTATTTCCACTCAGGTATGATGG > 2:620272/1‑150 AGATCTTGCGATTTTATTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 1:312861/150‑1 AGATATTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGG < 1:1262624/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTTGTTTGATGTTTAATAATAATGCTGAGTTAATATCAGTGTGTGATGGGTATGACATTTAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACACACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 2:1115029/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCTTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 1:1404411/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 1:1345318/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 1:456121/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 1:643051/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 2:13378/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 2:18770/150‑1 ATCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTCGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTAAATAAAAGGGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGC < 1:92386/150‑1 TCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCA > 2:1460005/1‑150 TCTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCA < 1:1140884/150‑1 TCTTGCGATTTTATTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCA > 1:939973/1‑150 aTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGTTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG < 1:99604/149‑1 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG < 2:337138/150‑1 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG > 2:102046/1‑150 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG > 2:927397/1‑150 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG > 1:1044601/1‑150 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG > 2:300620/1‑150 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG > 1:1070637/1‑150 CTTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAG < 2:1173352/150‑1 TTGCGATTTTGTTAATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGA < 1:498975/150‑1 AATAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAAATAATGCTGAGTTAATAAAAGTGTGTGAAGTGTATGACATTAAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAACAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAGGCAATATTCTGC < 1:714928/150‑1 TAATTAAGTGGTTTGATGTTTAAAATTAATGCTGAGTTAATAATAGTGTTTGAAGTGTATGACATTTAGTTATTTTGGCGTCAATGCGATTAAGAGACACCCTTATTCTATTGCCACTCAGGTATGATGGGCAGAGGCAATATTCTGGCC < 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GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAGACCACTTAATTATTAAC > 2:806851/1‑150 GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAAC < 1:1470957/150‑1 GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAAC > 1:29325/1‑150 GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAAC < 2:783018/150‑1 GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAAC < 1:304460/150‑1 GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCAGACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAACCCACTTAAGTATAAAC > 1:1058213/1‑150 GAGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATAGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAAC < 1:139803/150‑1 AGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAACA > 2:737575/1‑150 AGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAACA > 1:188775/1‑150 AGGCAATATTCTGCCCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAACA > 1:64008/1‑150 AGGCAATATTCTGACCATCATACCTGAGTGGCAATAGAATAAGGGTGTCTGTTAATCGCATTGACGCCAAAATAACTTAATGTCATACACTTCACACACTTTTATTAACTCAGCATTATTTTTAAACATCAAACCACTTAATTATTAACA < 1:1372130/150‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |