| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4237464 | 1044 (19.550) | 3 (0.060) | 3/260 | NT | 0.30% | coding (540/738 nt) | yjbG | extracellular polysaccharide export OMA protein |
| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4237500 | 1003 (19.510) | coding (576/738 nt) | yjbG | extracellular polysaccharide export OMA protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1109 total aligned reads displayed.
CGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACATTCTTCAGACTCTGACGCAGC > NC_000913_3_hsa_pgi/4237352‑4237648 | gCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAc > 1:586533‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGGGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAc > 1:898399‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCGGCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAc > 2:933225‑M2/1‑148 (MQ=255) gTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAcgca > 1:384488‑M2/1‑145 (MQ=255) tCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCGGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGAGCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTCCCCGGACGGAccccc < 2:493206‑M2/149‑6 (MQ=255) tCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGCGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAcgcac < 2:828679‑M2/149‑6 (MQ=255) aCGGTCCCGTTGGTAGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAcgcacgca < 1:129630/149‑1 (MQ=255) ttatgttgttCGTGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCaaaaa < 2:446473/145‑1 (MQ=255) tCACGTTGTTCGTGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGAGCCGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGTAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCaaaaa < 1:835733/149‑1 (MQ=255) tCACGTTGTTCGGGCTGATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCaaaaa < 2:797296/149‑1 (MQ=255) cACGTTGGTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTCCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGAaaaaca < 1:202469/149‑3 (MQ=255) aCGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAACAgc > 2:508972/1‑149 (MQ=255) gttgttCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAgcgc > 1:568032/1‑149 (MQ=255) tgttCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTCGCGAGCAATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCg > 1:644891/1‑149 (MQ=255) gttCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCgg < 1:818311/149‑1 (MQ=255) tCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTg < 1:628134/149‑1 (MQ=255) cGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTgg < 1:391420/149‑1 (MQ=255) gggCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCCGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGGCGGACGCAAGCAAACAACGCCGGTgac > 2:378173/1‑147 (MQ=255) gCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCtt > 1:609509/1‑149 (MQ=255) gCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCtt > 1:875619/1‑149 (MQ=255) tATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACt > 2:903468/1‑149 (MQ=255) tATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGAAGAAAAAAAAAAAAAAGCGCCGGTGGCTTACt < 2:62561/149‑1 (MQ=255) aTCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTg > 2:643365/1‑149 (MQ=255) aTCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTg > 1:983344/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACggg > 1:296398/1‑149 (MQ=255) aGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGTTTTACCCGGACGGCCGCACGCAAAACGCGCCGGTGGCTTACTGGac > 2:241778/1‑148 (MQ=255) aGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGaa > 2:593334/1‑149 (MQ=255) aGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGAACGCACACAGCGCCCGTGGCttcgtgtca > 2:279933/1‑142 (MQ=255) cGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACaa > 1:485740/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCAAGCATCCATTCACTCCAGGTCCCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGTTTACTGGAACAAGc < 2:42688/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCAAGCAGCCATTCATTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCGACGCGTGGGGGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGc < 1:259418/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGc < 1:804029/149‑1 (MQ=255) tcTGGCAAGCAGCCATTCACGCCAGGTCGCGAGGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCg < 2:518679/148‑1 (MQ=255) caggCAATCGGCCATCCACCCCAGGTCGGGACGTGGCGAGCTAGCTCTCTGACCAGAGCCCGCTCAGCGGAGCGGATCGCAGCGACGCATAGCCGGTGTATCCGGACGCACGCACGAAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGt < 2:668940/147‑1 (MQ=255) cTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGAGGATAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCCTACTGGAACAAGCGt > 1:950254/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTc > 2:748856/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGCAGCCATTCACGCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGTTGCGTATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCCAAAAGCGCCGGTCGCTTACTGGAACCAGCGta > 2:151994/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGCGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCCTCa > 2:973788/1‑149 (MQ=255) 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ctgcgaaGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAg < 2:459141/143‑1 (MQ=255) tGCTCAGCGGTGGGGATTGGAGCTAGGCGTGGGTGGTTTTCCCGGGCGGACGCATGTAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGt < 1:429206/149‑1 (MQ=255) cTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTga < 1:753790/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTgaga < 1:355325/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGATCGCAGCTAGGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGcc < 2:731560/149‑1 (MQ=255) gTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAcgcaccgctgagcaggctctggtcagagagatagctcgccacgtcgcgacctggagtgaatggctgcttgccaggacggc < 2:105429‑M2/121‑81 (MQ=255) gTGCGGATCCCAGCTACGAGTGGGTGGTTGACCCGGACGGACGCAGGCAAAAAGCGCCGGTGTCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCt < 2:355440/149‑1 (MQ=255) gCGGATCGCAACTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGa < 1:280095/149‑1 (MQ=255) gATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGt < 1:1000202/135‑1 (MQ=255) tagCAGCTACGCGAGAAGGGATTACACGAACGGACGCACCCAGAAAAAGACGGTAGCTTACTTGCACAAACGTCACTTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATCATTTATGTTGGCGTCGCGCAACACGTCTTGCGTGACACCCCCGCTGccc > 2:181153/3‑149 (MQ=255) cGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCt < 1:453675/149‑1 (MQ=255) agatACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACAAAAAAAAGAAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTaa < 2:780603/146‑1 (MQ=255) ccgcgTGGGTGGTTCACCCGGACGGACGCACTGAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACATGCGTCACGTAGAGCCGCTGCCCGGCAGCATTATTTCTGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGcc < 2:335113/148‑1 (MQ=255) cgcgTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTg < 1:306760/54‑1 (MQ=255) gcgTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGa < 1:508972/149‑1 (MQ=255) cgttgtTTACCCGTATGGCCGCACGAAAAAAGCGTCGCTGGCTTACGGGAACAAGCGTCACGTAGAGTCCATGCCCGGCAGCTTTATTTATGTTGGCCTCGCGGATTCCGTTTGGAGTGAGACGCCTGATGCGCTTAACGCAGACAttc < 2:477118/145‑1 (MQ=255) tggtTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTCCTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCATGATGCCCTTAACGCCGACAttctt > 1:234236/1‑149 (MQ=255) tggtTTACCCGAAAGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACAttctt < 1:339727/149‑1 (MQ=255) tggtGTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACAttctt < 2:393548/149‑1 (MQ=255) ggtTTACCCGTACGAATGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCAGGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACAttcttc < 1:323704/149‑1 (MQ=255) tttACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGCCAttcgccat > 1:683136/1‑144 (MQ=255) ttACCCGGACGGACGCACGGAAAAAGCGCCGGTGGCATAGTGGTACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACATTCTTCAGa < 1:186469/149‑1 (MQ=255) ttACCCGGACGGACGCACGCAAAACGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACATTCTTCAGa < 2:871907/149‑1 (MQ=255) cggacggaCGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACATTCTTCAGACTCTg < 2:257969/149‑1 (MQ=255) ggacgCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACCTTCTTCAGACTCTGACGCa < 2:846990/149‑1 (MQ=255) gacgCACGAAAAAAGCGCGGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCCCGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACATTCTTCAGACTCTGACGCAg < 1:470822/149‑1 (MQ=255) | CGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTGACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATGCCCTTAACGCCGACATTCTTCAGACTCTGACGCAGC > NC_000913_3_hsa_pgi/4237352‑4237648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |