| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | 4240185 = | NA (NA) | 7 (0.140) | 6/256 | NT | NA | noncoding (1/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | 4240218 = | NA (NA) | noncoding (34/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 1100 total aligned reads displayed.
AGGTTACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTTATACAGGAAGCTCGCCACTGTGAAGGAGGTACTGCTATGACGTCACTCTC > NC_000913_3_hsa_pgi/4240070‑4240366 | tACGTTTCATTTGTTCCAGAGGAATATTTTCGATTTTTCGCGCATTGCTTGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACg < 1:216104/149‑1 (MQ=255) cGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTGTATTCTTCGCGCATTGCTTGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGTATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACggg < 2:580335/149‑1 (MQ=255) cGTTTCATTTGTTCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACggg < 1:943051/149‑1 (MQ=255) 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tttGTTCCAGAGGAAAATTGTCGATTTTTCGCGCATTGATGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGATAATTTTTGAATTTGAGGATTTTGTGCGTTTTGTCTTTCGGGATACTCGTCCCGGCGCGGATTATCCGGAGTACGggtacgtgt > 2:556381/1‑147 (MQ=255) tttGGTCCAGAGGGAGATTGTCGGGTGTTCGGGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCGCGTGAATGGGGGATTTTTGAATTAGCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGtat < 2:398059/149‑1 (MQ=255) tCCAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCGGGATGCGCCGCCGGGCGCGGCTTATCCGGCCTAAGGGTAAGTATATCCg > 1:913506/1‑149 (MQ=255) tcAGAGTGACATTGTCGGTTTTGCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCAGGTGAATGGGTGATTGTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTATGTATATCCgg < 1:683956/148‑1 (MQ=255) ccAGAGGAACATTGTCGATTTTTCGCGCATTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCgg < 1:593448/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |