| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913_3_KO_pgi | 2,977,050 | Δ46 bp | coding (452‑497/1032 nt) | galR → | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913_3_KO_pgi | 2977050 | 2977095 | 46 | 75 [2] | [0] 73 | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_KO_pgi | = 2977049 | 2 (0.020) | 67 (0.820) | 52/262 | 0.9 | 98.6% | coding (451/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| ? | NC_000913_3_KO_pgi | 2977096 = | 0 (0.000) | coding (498/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
GCTGCGTTGGTCGTCCATGCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGA > NC_000913_3_KO_pgi/2976947‑2977241 | acaaaaagagcgtcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctg > 2:817685‑M2/150‑150 (MQ=255)acaaaaagagcgtcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctg > 2:286458‑M2/150‑150 (MQ=255)acaaaaagagcgtcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatcctgacttcgcctcattaatgaaccaaatgcccggtatggtgccgttcaaccgtatcctgcctcgctg > 4:9940‑M2/150‑150 (MQ=255) aaaaagagcgtcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaaggctcggtatggtgctgatcaaccgtagcctacatggcaggc > 4:472615‑M2/148‑150 (MQ=255) gagcgtcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAAcgc < 2:852296‑M2/8‑1 (MQ=255) gtcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCa < 2:182231‑M2/12‑1 (MQ=255) tcaggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCAt > 2:876599‑M2/138‑150 (MQ=255) caggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCAtt > 1:519716‑M2/137‑150 (MQ=255) aggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCAttt > 1:606825‑M2/136‑150 (MQ=255) ggccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTa < 2:235426‑M2/16‑1 (MQ=255) gccattgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaacgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTaa > 4:153544‑M2/134‑150 (MQ=255) ttgagcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCa < 1:124993‑M2/21‑1 (MQ=255) gcaactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCaa > 1:515524‑M2/126‑150 (MQ=255) aactgatccgccatcgctgttctgcgttggtcgaccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTACTTCAGCAAgg < 4:590728‑M2/27‑1 (MQ=255) aactgatccgccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAgg < 1:733555‑M2/27‑1 (MQ=255) ctgatccgccatcgctgtgctgcggtggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccggatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTc < 2:247631‑M2/29‑1 (MQ=255) ccatcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGc < 2:668560‑M2/37‑1 (MQ=255) catcgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCa > 2:657934‑M2/113‑150 (MQ=255) ggctgtgttgcgttgctcgtccatgccaaaatgatcccggatgcttatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGAAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTg < 2:303884‑M2/41‑1 (MQ=255) cgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTg < 1:408637‑M2/41‑1 (MQ=255) cgctgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcccgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTg < 2:417177‑M2/41‑1 (MQ=255) tgtgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGtt > 4:461571‑M2/107‑150 (MQ=255) tgctgcgttggtcgtccatgccaaaatgaccccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtaccctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTAt < 4:501116‑M2/46‑1 (MQ=255) gctgcgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcttcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtgtcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATc < 4:468166‑M2/47‑1 (MQ=255) cgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCtgtg < 1:817685‑M2/51‑1 (MQ=255) cgttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCtgtg < 1:286458‑M2/51‑1 (MQ=255) ttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAg < 3:204157‑M2/22‑1 (MQ=255) ttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAg > 4:204157‑M2/98‑119 (MQ=255) ttggtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGct < 1:277164‑M2/53‑1 (MQ=255) gtcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTa > 1:362687‑M2/95‑150 (MQ=255) tcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTaa > 3:174507‑M2/94‑150 (MQ=255) tcgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTaa > 3:252131‑M2/94‑150 (MQ=255) cgtccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaaggcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAAc < 3:376112‑M2/58‑1 (MQ=255) tccatgccaaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcgcggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATGTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCa > 4:348496‑M2/91‑150 (MQ=255) 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aaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTAttt > 1:393868‑M2/83‑150 (MQ=255) aaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTAttt > 1:722076‑M2/83‑150 (MQ=255) aaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTAttt < 4:415806‑M2/68‑1 (MQ=255) aaaatgatcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTAttt < 3:579947‑M2/68‑1 (MQ=255) atcccggatgctgatttagcctcattaatgaaacaaatgcccggtatggtgctgatcaaccgtatcctgcctggctGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACg > 2:43516‑M2/77‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |