| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_KO_pgi | 1,158,933 | G→A | W355* (TGG→TGA) | ptsG → | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_KO_pgi | 1,158,933 | 0 | G | A | 98.7% | 812.4 / ‑3.1 | 228 | W355* (TGG→TGA) | ptsG | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base A (117/106); total (118/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
GTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGGCTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGAAATGGCACCGGC > NC_000913_3_KO_pgi/1158787‑1159079 | ttGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGt < 2:82341/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTc < 2:365847/150‑1 (MQ=255) cGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGa < 1:1202119/150‑1 (MQ=255) cGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGa < 1:132031/150‑1 (MQ=255) cTGTACCTCATCCACGCGATTCTGGCACGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGGCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGAtcgtc < 1:12608/150‑1 (MQ=255) tGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGAtcgtcg < 2:1935797/150‑1 (MQ=255) tGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGAtcgtcg < 2:965502/150‑1 (MQ=255) acctcatcCACGCGCTTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGACGCGCGAAGGTCAGTCGTTCTCCAACGCTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTa < 1:1303657/147‑1 (MQ=255) catcatCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTAt > 3:1527357/1‑150 (MQ=255) tcatcCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCg > 4:535030/1‑150 (MQ=255) catcCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCgg > 1:1450555/1‑150 (MQ=255) atcCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGt < 4:837768/150‑1 (MQ=255) cACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTAt < 1:1109910/150‑1 (MQ=255) cgcgATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGc < 2:672053/150‑1 (MQ=255) gcgATTCTGGCAGGCCTGTCATTCCCAATCGGTATGCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAGACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCCCTTGTGCg > 4:357434/1‑150 (MQ=255) tCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGt < 2:279006/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGtt < 2:1748814/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCTGGTATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTtac < 1:982928/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTtac < 2:409931/150‑1 (MQ=255) cTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGTATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACAcc < 3:483129/150‑1 (MQ=255) aTTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGAGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCtt > 2:1445993/1‑150 (MQ=255) tCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCCTCTTcc < 4:1255067/150‑1 (MQ=255) cccAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGt < 1:764470/121‑1 (MQ=255) ccAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCcgc < 4:767192/150‑1 (MQ=255) ccAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGGTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCcgc > 2:1204326/1‑150 (MQ=255) cAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGtt < 1:1051710/131‑1 (MQ=255) cAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGtt > 2:1051710/1‑131 (MQ=255) cAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTAGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCcgcg > 4:1303768/1‑150 (MQ=255) aaTCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGCTTGTTTACTACACCATCTTCCGCGt > 1:537542/1‑150 (MQ=255) tGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTg > 2:915385/1‑150 (MQ=255) gTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCgg < 3:999938/106‑1 (MQ=255) tATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGAt > 4:1071931/1‑150 (MQ=255) ttcttcTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTa > 4:1184668/1‑150 (MQ=255) tcttctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTaa > 2:1994453/1‑150 (MQ=255) cttctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTaaa < 2:2427712/150‑1 (MQ=255) ttctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCt > 4:1221506/1‑142 (MQ=255) ttctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCt < 3:1221506/142‑1 (MQ=255) ttctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGa < 2:552766/144‑1 (MQ=255) ttctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAg > 2:1293769/1‑150 (MQ=255) tctGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGc > 1:2143510/1‑150 (MQ=255) tGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGtt < 2:729554/105‑1 (MQ=255) tGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCAc < 1:1873278/150‑1 (MQ=255) ggggATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACt < 3:1275676/150‑1 (MQ=255) ggggATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACt > 1:65080/1‑150 (MQ=255) gggATGCGTGACGTTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTg > 2:607626/1‑150 (MQ=255) gATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGa > 1:924500/1‑150 (MQ=255) gCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCt < 2:773284/150‑1 (MQ=255) gCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGGTCGGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCt < 1:25065/150‑1 (MQ=255) gTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTtacta > 4:1477500/1‑112 (MQ=255) gTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTtacta < 3:1477500/112‑1 (MQ=255) gTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGa > 1:1972358/1‑150 (MQ=255) gTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGa > 1:1219493/1‑150 (MQ=255) aCGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCTTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGaaaa < 1:1880277/150‑1 (MQ=255) aCGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGaaaa > 4:1030850/1‑150 (MQ=255) aCGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCg < 1:202551/150‑1 (MQ=255) aCGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCg < 4:1632749/150‑1 (MQ=255) gtcgtTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGGTCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCggg < 1:1701647/150‑1 (MQ=255) gtcgtTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGt > 1:1592982/1‑85 (MQ=255) gtcgtTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGt < 2:1592982/85‑1 (MQ=255) cgtTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTc < 4:1564070/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGt < 3:659222/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGt < 3:1118448/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTATGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGCCTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGt < 4:502874/150‑1 (MQ=255) ctcGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTCTCGGTTATGCGCTTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGa > 2:2405582/1‑150 (MQ=255) tcGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGaa < 3:1197162/150‑1 (MQ=255) cGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAg < 1:304990/150‑1 (MQ=255) cACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAc > 2:1369198/1‑150 (MQ=255) aCGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGCTCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCCCTGGAGCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAcg > 2:511708/1‑150 (MQ=255) cGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGGTCCCTATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAcgc < 1:1553698/150‑1 (MQ=255) tCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCcgc < 2:1879183/100‑1 (MQ=255) cTGATCGACTTCATCGTTATGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACt < 2:109274/150‑1 (MQ=255) gATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGa < 3:297676/150‑1 (MQ=255) aTCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGaa > 2:1735701/1‑150 (MQ=255) cGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGa < 3:357434/150‑1 (MQ=255) cGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGa < 1:479844/150‑1 (MQ=255) gACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGAt > 3:201928/1‑150 (MQ=255) aCTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATg > 1:116998/1‑150 (MQ=255) gtCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGCTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGACGACCAGACTGGAGATgaa > 2:1408019/2‑148 (MQ=255) aTCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTta < 4:1523033/71‑1 (MQ=255) tCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGAtt < 1:289819/65‑1 (MQ=255) tCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGAtt > 2:289819/1‑65 (MQ=255) tCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCCTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAg < 3:1303768/150‑1 (MQ=255) gTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCCACAGCg > 2:2479032/1‑150 (MQ=255) ttCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGa < 1:729060/150‑1 (MQ=255) ttCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGa > 3:1001529/1‑150 (MQ=255) tctgtctgGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGAc < 3:420217/150‑1 (MQ=255) ctgtctgGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACa < 1:224863/150‑1 (MQ=255) gtctgGTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGGGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAATGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCATAAGCGACAgg < 4:1363385/150‑1 (MQ=255) ggTAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTAcc > 4:414270/1‑150 (MQ=255) tAACAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACa > 2:1685716/1‑142 (MQ=255) aaCAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTg < 3:88067/75‑1 (MQ=255) aaCAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTg > 4:88067/1‑75 (MQ=255) aaCAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGc > 3:1150280/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCg > 3:901114/1‑150 (MQ=255) cagcagCAAACTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGa > 3:580192/1‑150 (MQ=255) aaCTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGAAATGGCAc > 3:1636041/1‑150 (MQ=255) cTGTGACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGAAATGGCACCg > 1:2619676/1‑150 (MQ=255) tgtgACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGAAATGGCACCgg > 4:303684/1‑150 (MQ=255) tgtgACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGAAATGGCACCgg > 4:1581601/1‑150 (MQ=255) gtgACTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTg > 2:2236707/1‑61 (MQ=255) | GTTGCGCCGATCCTGTACATCATCCACGCGATTCTGGCAGGCCTGGCATTCCCAATCTGTATTCTTCTGGGGATGCGTGACGGTACGTCGTTCTCGCACGGTCTGATCGACTTCATCGTTCTGTCTGGTAACAGCAGCAAACTGTGGCTGTTCCCGATCGTCGGTATCGGTTATGCGATTGTTTACTACACCATCTTCCGCGTGCTGATTAAAGCACTGGATCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGACGCGACTGAAGATGCAAAAGCGACAGGTACCAGCGAAATGGCACCGGC > NC_000913_3_KO_pgi/1158787‑1159079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |