| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_pgi | 1757141 = | 123 (1.060) | 16 (0.150) | 15/258 | 10.9 | 12.2% | intergenic (+31/‑280) | pykF/lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein |
| ? | NC_000913_3_pae_pgi | 1757161 = | 114 (1.050) | intergenic (+51/‑260) | pykF/lpp | pyruvate kinase I/murein lipoprotein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGC > NC_000913_3_pae_pgi/1757014‑1757308 | gagCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCttttt < 3:19116/150‑1 (MQ=255) gCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCttttttt < 3:377770/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGCGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTtttatt < 4:273643/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTtttatt > 2:41167/1‑150 (MQ=255) gCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATc > 1:825503/1‑150 (MQ=255) gCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATc < 2:706426/150‑1 (MQ=255) cacacaAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCtttttt < 3:634456/140‑1 (MQ=255) cacacaAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCtttttt > 4:634456/1‑140 (MQ=255) cacacaAAGGTGACGATGTAGTTATGGTTTCTCGTGCAATGGTACCGAGCGGCACCACTCACACAGAATCTGTTCCCGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGACCTAATCTGTATATCAAAGCGCACTGATGGGCGCTTTTTGTATTTAATCg > 4:116362/1‑150 (MQ=255) acacaAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGa > 2:23714/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCCTTTTTTATTTAATCGATAAc > 1:1124379/1‑150 (MQ=255) ttGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCAACTGTTCACATCCTGTAATATTGCTTTTGGGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAAt > 2:1080059/1‑150 (MQ=255) ttATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATaaaaaa < 3:721133/150‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatc < 1:41167/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTTGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatcaa < 1:357060/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatcaa < 4:702075/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatcaa < 2:388391/150‑1 (MQ=255) gTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAACATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatcaaa > 1:745308/1‑150 (MQ=255) tGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGa < 2:471160/150‑1 (MQ=255) gTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGAtt > 1:1012849/1‑150 (MQ=255) tGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGAttt > 2:971941/1‑150 (MQ=255) cACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCa < 2:1156842/150‑1 (MQ=255) aCTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCAc > 4:464862/1‑150 (MQ=255) tGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACCATAGGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACta > 2:22376/1‑150 (MQ=255) gTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACtata > 2:139057/1‑150 (MQ=255) gTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACtata > 1:1178751/1‑150 (MQ=255) cGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCa < 1:787062/150‑1 (MQ=255) gCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGaa < 1:111531/109‑1 (MQ=255) gCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACt > 1:713926/1‑150 (MQ=255) cACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACtt > 2:966395/1‑150 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTAt > 2:953052/1‑150 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTAt > 3:121069/1‑150 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTAt > 4:57683/1‑150 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTAt < 1:139057/150‑1 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTAt > 3:50097/1‑150 (MQ=255) tactaACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTAt > 1:1172323/1‑150 (MQ=255) taACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTa > 2:955318/1‑150 (MQ=255) taACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTa > 2:1116476/1‑150 (MQ=255) aaCACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTaa > 3:76632/1‑150 (MQ=255) 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1:121018/100‑1 (MQ=255) tCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAaaatc > 2:121018/1‑100 (MQ=255) cACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGa > 1:635448/1‑150 (MQ=255) aCGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGaa > 3:684234/1‑150 (MQ=255) aCGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGaa > 3:271374/1‑150 (MQ=255) gTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAga > 4:335504/1‑149 (MQ=255) tGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGa > 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aattaattTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAAttttt < 2:1163856/150‑1 (MQ=255) aattaattTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAAttttt > 1:1173160/1‑150 (MQ=255) ttaattTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGaa > 1:1162539/1‑124 (MQ=255) ttaattTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGaa < 2:1162539/124‑1 (MQ=255) ttaattTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAAttttttt > 2:107852/1‑150 (MQ=255) attTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAAttttt < 4:541743/145‑1 (MQ=255) attTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAAttttt > 3:541743/1‑145 (MQ=255) tttGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCt > 3:238984/1‑150 (MQ=255) tatCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGTAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAAcc > 2:95249/1‑150 (MQ=255) tatCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAAcc < 1:891869/150‑1 (MQ=255) atCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAAccc > 1:278830/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGCTTTCACCATATAATCTCACTTTATCTAAGATGACTCCGCTGGAAGCATCCTGCTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAAGCCa > 3:315050/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCa > 2:642898/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAg < 1:953052/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCg > 1:1074654/1‑150 (MQ=255) aGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACt < 2:860876/84‑1 (MQ=255) aGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACt > 1:860876/1‑84 (MQ=255) ccTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGAt > 3:780019/1‑150 (MQ=255) ccTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGAt > 1:209004/1‑150 (MQ=255) cTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATg < 2:713926/150‑1 (MQ=255) tGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGc > 3:126378/1‑150 (MQ=255) gATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGct < 4:349588/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGa < 2:46824/91‑1 (MQ=255) ggCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGa > 1:46824/1‑91 (MQ=255) gcgcTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCttt < 3:311286/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCttt > 2:47344/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAg < 1:458289/150‑1 (MQ=255) tttttttATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGc > 3:530942/1‑150 (MQ=255) | GAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTAACACCGCATCTGTTCACGTCCTGTAATATTGCTTTTGTGAATTAATTTGTATATCGAAGCGCCCTGATGGGCGCTTTTTTTATTTAATCGATAACCAGAAGCAATAAAAAATCAAATCGGATTTCACTATATAATCTCACTTTATCTAAGATGAATCCGATGGAAGCATCCTGTTTTCTCTCAATTTTTTTATCTAAAACCCAGCGTTCGATGCTTCTTTGAGC > NC_000913_3_pae_pgi/1757014‑1757308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |