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| MC JC | NC_000913_3_pae_pgi | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA | |
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Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
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2:1361426‑M2/8‑150 (MQ=255) aaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGAt > 1:479593‑M2/6‑103 (MQ=255) aaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGAt < 2:479593‑M2/98‑1 (MQ=255) aaaTGTATCAATCATCCTTTTGTTTTAGGTGTATCACAATCTGTTAAAAAGTTTTTAGACAAGCTAAAAAGAAAAAATGAAACAGGAATACTCGAACTGGCATGTTGCGCACCGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGATataa < 4:493401/150‑1 (MQ=255) aatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaa > 1:1489538‑M2/5‑150 (MQ=255) gTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGca < 1:999001‑M2/106‑1 (MQ=255) gTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGca < 1:999007‑M2/106‑1 (MQ=255) 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NC_000913_3_pae_pgi/1979147‑1979428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |