New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3981187 = | 61 (1.230) | 4 (0.090) | 4/264 | 6.6 | 6.3% | coding (301/1386 nt) | yifK | putative APC family amino acid transporter |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3981219 = | 62 (1.340) | coding (333/1386 nt) | yifK | putative APC family amino acid transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGCGAAATCG > NC_000913_3_hsa_tpiA/3981042‑3981334 | cGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATgg > 1:408069/1‑149 (MQ=255) ttCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTggg < 1:698610/149‑1 (MQ=255) ttCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTggg > 1:149302/1‑149 (MQ=255) tCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGAt < 1:700298/139‑1 (MQ=255) tCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGAt > 2:700298/1‑139 (MQ=255) tCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTgggg > 1:272230/1‑149 (MQ=255) tCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTgggg < 2:4824/149‑1 (MQ=255) cGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGa < 1:388978/149‑1 (MQ=255) ttCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGa < 1:835100/149‑1 (MQ=255) catcatGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTCCTGGTTTCTGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGaaa > 2:480816/1‑149 (MQ=255) catcatGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGaaa > 2:480850/1‑149 (MQ=255) atcatGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAAt > 1:368325/1‑149 (MQ=255) atcatGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTAATGGTTTCTGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAAt > 1:811868/1‑149 (MQ=255) aaTGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCCTTg > 1:178226/1‑149 (MQ=255) aaTGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTg < 2:368325/149‑1 (MQ=255) aTGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTgg > 1:617389/1‑149 (MQ=255) gCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGtt < 1:264766/149‑1 (MQ=255) gCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGtt > 1:14376/1‑149 (MQ=255) ttgttCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCa < 2:641514/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGtt > 1:3151/1‑149 (MQ=255) tCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATAGCCGTGGGGATATCTGAAATCCCCGCCATTCGCGTTTAGTTCCAggta > 2:150472/1‑146 (MQ=255) gcTCGTACCGGGTACGGGTTCGGTCGCCGTTTATGCGCATCGTCATATGAGCCCGTTCTTTTGCTATCTCACGGCCTGGTCTTACTGGGTTATGTGGATGGCGGTGGGGGTCTCTGGAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt < 2:596255/148‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt < 2:272230/149‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt < 2:506114/149‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGGGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt < 1:124449/149‑1 (MQ=255) ccTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTGATGCGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCt < 1:124144/149‑1 (MQ=255) cTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTg < 2:66951/149‑1 (MQ=255) tCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTgg > 1:325340/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTc > 1:295976/1‑149 (MQ=255) cggttCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATgg < 1:717647/149‑1 (MQ=255) cggttCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATgg > 1:351986/1‑149 (MQ=255) cggttCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATgg > 1:264815/1‑149 (MQ=255) ccgttcgCCGTTTATGCGCATCGTCATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCa < 1:669338/148‑1 (MQ=255) gttcgCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGGGATGGCGCAGt < 1:523241/149‑1 (MQ=255) gtacgCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCCCCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGt < 2:203639/146‑1 (MQ=255) ttcgCCGTTTATGCGCATCGTTATATGGGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGTATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTg < 2:71711/149‑1 (MQ=255) tcgCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCACGAGATGGCCCCGTgc > 2:337563/1‑148 (MQ=255) ccGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATa > 1:586052/1‑149 (MQ=255) cGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATAc > 2:125132/1‑149 (MQ=255) gtgtATGCGCATCGTTATATGAGCCCGCTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCGCGGAGATGGCGCAGTGGATAcc > 2:344751/4‑149 (MQ=255) gTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATAcc < 2:116059/149‑1 (MQ=255) tttATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGAGGGCGGTGGGGCTCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTTGATAccc > 1:385523/1‑149 (MQ=255) tGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCAt < 2:3151/149‑1 (MQ=255) gcgcATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCAtt > 2:599412/1‑149 (MQ=255) ccGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGACGTGGCggtggt > 2:266552/1‑149 (MQ=255) cGTTCTTGGGCTACCGCACCGGCTGGTCTCATTGGGTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCtggtg < 2:57437/149‑1 (MQ=255) tttGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGtt > 1:518613/1‑149 (MQ=255) cTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGa > 2:516195/1‑149 (MQ=255) tATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGaa < 2:247645/149‑1 (MQ=255) aTCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCTAAt < 2:586052/149‑1 (MQ=255) tcACCGCCGTGTCTTAGTGGCTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTg < 2:23922/149‑1 (MQ=255) ggTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGgcggtg < 1:599412/149‑1 (MQ=255) gcTGGTTTATGTGGGTGGTGGTGGGGGTCTCTTAGATCACCGGCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGGGGTGGCGCAGTGGACACCCGCATGGGTCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTg < 2:3357/148‑1 (MQ=255) tGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGACTCTGGCGGCGGTGCGGTTGTa > 2:34869/1‑149 (MQ=255) gTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGgcg > 2:688457/1‑79 (MQ=255) gTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGgcg < 1:688457/79‑1 (MQ=255) ttATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGc > 1:255235/1‑149 (MQ=255) gtgGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAATGGCGCTGTTTGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGCGaaa < 1:125132/149‑1 (MQ=255) gggATGGCGGTGGGGATCTTTGAAATCACCGCCATTGGCGGTTTTGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGCGAAAt < 2:481138/148‑1 (MQ=255) ggATGGCGGTGGGGATCTCTGAAGTCAACGTCTATGGCGTGTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGCGAAATc < 2:576695/149‑1 (MQ=255) gATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGCGAAATCg > 2:137848/1‑149 (MQ=255) | CGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAGATGGCGCAGTGGATACCCGCATTGATCGCAGTGGCGCTGGTGGCGTTGGCGAATCTGGCGGCGGTGCGGTTGTACGGCGAAATCG > NC_000913_3_hsa_tpiA/3981042‑3981334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |