| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3186096 = | NA (NA) | 59 (1.410) | 48/284 | 0.0 | 100% | intergenic (+6/‑91) | yqiG/insC1 | pseudogene; fimbrial export usher family;putative membrane; Not classified; putative membrane protein/IS2 repressor TnpA |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 3725928 | 0 (0.000) | coding (42/996 nt) | wecH | O‑acetyltransferase for enterobacterial common antigen (ECA) | |||||
ATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/3725780‑3726075 | gaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctgtaaatataggggcaaatccaGGATa < 1:504133‑M2/5‑1 (MQ=255) tttCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAt > 2:55076‑M2/1‑148 (MQ=255) tttCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGAAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAt < 1:680430‑M2/149‑2 (MQ=255) ttCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAta < 1:514174‑M2/149‑3 (MQ=255) cTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATCAACTGCACGGGATAtagac < 2:294376‑M2/149‑6 (MQ=255) cTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagac > 1:41836‑M2/1‑144 (MQ=255) tAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactg > 2:600818‑M2/1‑142 (MQ=255) tAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGACAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGACGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGAATaaaggagg < 2:629114/149‑8 (MQ=255) tAAGCCTCAATAAGCTGTAGTGATAAATTTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactg > 1:492183‑M2/1‑142 (MQ=255) gcagaggcgttcgagcattaaaacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaataactgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatatcggggcaaatccaGGATAGCGTGtt < 1:542684‑M2/12‑1 (MQ=255) gcagaggccttcgagaattataacgaatggcatccgcacagtgctctggtttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataaaagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGtt < 1:180638‑M2/12‑1 (MQ=255) ccgccTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAAGCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactgg > 2:541044‑M2/3‑141 (MQ=255) gCCTCTATAAGCTGTAGTGATAATACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTATTTTTAACCAGATCCAGCGACACAGATGCAGCCCAAAATGTACTGGATTGATAACCTGCGCGGGATAtagactggcc < 2:663780‑M2/149‑11 (MQ=255) gCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggcc < 1:72958‑M2/149‑11 (MQ=255) ttcgatcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaagatatgggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAAtggtgg < 2:155762‑M2/21‑1 (MQ=255) gCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggcc > 1:123082‑M2/1‑129 (MQ=255) gCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggcc < 2:123082‑M2/139‑11 (MQ=255) tGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctcc < 1:446784‑M2/149‑23 (MQ=255) tGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctcc > 2:112236‑M2/1‑127 (MQ=255) gTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctcca > 2:287902‑M2/1‑126 (MQ=255) gTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctcca > 1:431224‑M2/1‑126 (MQ=255) tAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccag > 2:641657‑M2/1‑125 (MQ=255) ataacgaatggcatccgcagagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTca < 2:390279‑M2/31‑1 (MQ=255) cgaatggcatccgcatagggcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCAcacc < 2:100758‑M2/35‑1 (MQ=255) aaaCTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaa > 2:446784‑M2/1‑117 (MQ=255) cTCAGATTATTCAAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCACAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagaaaacaaatat < 1:646130‑M2/149‑36 (MQ=255) gATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcact > 1:373833‑M2/1‑110 (MQ=255) actcactccagttCGCAACCCATTTGCATGATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGAGAACCTTCGAGGGATAtagactggcccgctgaatctccagacaaccaatatcact > 1:524998‑M2/7‑110 (MQ=255) atagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTAtgt < 1:472416‑M2/49‑1 (MQ=255) ggtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGa < 2:22734‑M2/51‑1 (MQ=255) aGTGCGCCAACCAAATGATTTAGCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagt < 1:571143‑M2/149‑49 (MQ=255) gctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgatagaagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCAATACCTGGTATTTGACCAAt > 2:390108‑M2/94‑149 (MQ=255) cgcCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgata > 2:568616‑M2/1‑97 (MQ=255) cgcCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgata > 2:170719‑M2/1‑97 (MQ=255) ggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTc > 1:79064‑M2/90‑149 (MQ=255) caaccaaATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtc < 1:342287‑M2/149‑56 (MQ=255) caaccaaATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatca > 1:191406‑M2/1‑94 (MQ=255) caaccaaATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatca < 2:191406‑M2/131‑38 (MQ=255) caaccaaATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctc < 2:85270‑M2/115‑22 (MQ=255) caaccaaATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctc > 1:85270‑M2/1‑94 (MQ=255) aaccaaATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACATGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtct < 2:402124‑M2/149‑57 (MQ=255) ttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCAt < 1:155242‑M2/62‑1 (MQ=255) atcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTa < 2:414179‑M2/39‑1 (MQ=255) atcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTa > 1:414179‑M2/86‑124 (MQ=255) aaTGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaata > 2:72958‑M2/1‑88 (MQ=255) 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gaCACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGGTAtagactggccgcctgaatctccagacaaccaatataacttaaataagtaatagtcttaatactagtatttagactaggcattggagaacagatgatagat < 2:647008‑M2/149‑101 (MQ=255) gaCACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgat > 1:294376‑M2/1‑49 (MQ=255) gttaagcgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCt < 1:98521‑M2/107‑1 (MQ=255) gataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGGTGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGCTCTCACCAATGTTCTCGATTCTgcctcac > 2:32275‑M2/36‑147 (MQ=255) taacagacgtcggcaaacataggggcaaatccaGGATAGCGTGTGTACTGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTTAATTCTGCCTCTCgt < 1:253293‑M2/116‑1 (MQ=255) 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ATTTCCTTAAGCCTCTATAAGCTGTAGTGATAAAACTCAGATTATTCCAGTGCGCCAACCAAATGATTTATCGGTCAGACTTTTTTTAACCAGATACAGAGACACAGATGCAGCCCAAAATTTACTGGATTGATAACCTGCGAGGGATAGCGTGTTTAATGGTGGTGATGATTCACACCACTACCTGGTATGTGACCAATGCTCATAGTGTTAGCCCCGTCACATGGGATATCGCCAATGTTCTGAATTCTGCCTCTCGTGTCAGCGTGCCGCTATTTTTCATGATTTCCGGCTAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/3725780‑3726075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |