| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1596351 = | 1 (0.020) | 44 (0.910) | 38/282 | 0.4 | 97.8% | pseudogene (1637/3861 nt) | yneO | pseudogene, AidA homolog |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 1651548 | NA (NA) | intergenic (+11/‑3) | insD1/intQ | IS2 transposase TnpB;IS, phage, Tn; Transposon‑related functions; extrachromosomal; transposon related/pseudogene, Qin prophage; phage integrase family;Phage or Prophage Related | |||||
TCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGC > NC_000913_3_hsa_tpiA/1596203‑1596499 | tcCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCtgtg < 1:92090/149‑1 (MQ=255)caaggaaccttgcagaggcgttcgagcagttgaacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgatcacagatggatggtaatataggggcaaatccag > 2:504232‑M1/149‑149 (MQ=255)caaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccag > 2:274660‑M1/149‑149 (MQ=255)caaagaaccgtgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccag > 2:525109‑M1/149‑149 (MQ=255) agaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTAt < 1:711591‑M1/4‑1 (MQ=255) attcGACATTCGGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCTGTACCAGATGGCCCTACGTACATATTGGATGTTTCAAGAAGAGAGTTGTGCACATCCCCCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCt > 2:501518‑M2/2‑148 (MQ=255) tgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttacgcgataatagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACgcgc > 2:566173‑M1/139‑149 (MQ=255) gggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTaa > 2:640912‑M1/134‑149 (MQ=255) atgcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagttcgcggggttatcgctcgccacgggactatctgcggcagcgggcttgtaatgggtttagtgaggacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTaa > 1:507129‑M1/134‑149 (MQ=255) aggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTaa < 2:397715‑M1/16‑1 (MQ=255) ggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAAc > 2:13845‑M1/133‑149 (MQ=255) cGTACCGTTATTCGTCAGGGTTGACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATGGAATGTTTCAAGACGGGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccct > 2:713994‑M2/1‑135 (MQ=255) aTTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctcca > 2:724045‑M2/1‑126 (MQ=255) ataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatcagGTATCACAGGGTTTAACTATACCTCCggtgg < 1:178552‑M1/31‑1 (MQ=255) taacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCggtggt < 1:556970‑M1/32‑1 (MQ=255) tCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagccaa < 1:594918‑M2/149‑29 (MQ=255) aacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggacagtccaGTGTCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTa < 1:19987‑M1/33‑1 (MQ=255) aGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccccgaatctccagacaacc > 2:151283‑M2/1‑119 (MQ=255) tggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatatcggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTGTACGTCCGGTGGTAATATTc < 2:724155‑M1/39‑1 (MQ=255) cgtacccgtaccAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcac > 1:77536‑M2/1‑111 (MQ=255) gtacccgtaccAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcact > 2:457666‑M2/1‑110 (MQ=255) gcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCAcc < 1:184840‑M1/47‑1 (MQ=255) atagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttataatgggttaggtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTCAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGGTCACCCg < 1:165477‑M1/49‑1 (MQ=255) taccAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAAAGAGTTCTGCACATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTATCATTGAGAGCTATCTATGTATCtagactggccccctgaatatccagacaaccaatatcacttaaacaa < 2:618216‑M2/149‑47 (MQ=255) ccAGATGTCCCGACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagt > 2:551258‑M2/1‑101 (MQ=255) gATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgat < 2:448997‑M2/149‑52 (MQ=255) aTGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTTCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgata > 1:448997‑M2/1‑97 (MQ=255) aTGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgata < 2:624810‑M2/149‑53 (MQ=255) tgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTCTCCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTGACCCTCGCCTAATa < 1:553469‑M1/58‑1 (MQ=255) tgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATa > 1:605490‑M1/92‑149 (MQ=255) ggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCAAGCGCTTTCCCTATACCTCCGGTGGTAATATTCATTTCACCCGTGCCTATTaca > 2:711591‑M1/90‑149 (MQ=255) tACGTACATATTGAGTGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccactagcacttaaataagtgatagtcttaa < 2:600921‑M2/149‑60 (MQ=255) atcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGa > 2:556970‑M1/86‑149 (MQ=255) tcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGAc > 2:789039‑M1/85‑149 (MQ=255) cATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactag > 2:110312‑M2/1‑84 (MQ=255) gccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACCCCGACCtgtgg < 1:124819‑M1/71‑3 (MQ=255) atatTGAAGGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagt > 2:551992‑M2/1‑83 (MQ=255) cacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCa < 1:563732‑M1/73‑1 (MQ=255) atTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGCGCTATCTGTGTATCtacaccggcgccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagttt < 1:198677‑M2/149‑69 (MQ=255) ttGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgactctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttt < 2:662070‑M2/149‑70 (MQ=255) ttGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTATGTCATAGAGAGCTAGCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaatacgtgatagtcttaatactagtttt < 1:713116‑M2/149‑70 (MQ=255) gAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCCCCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagttttta > 2:258357‑M2/1‑78 (MQ=255) gAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctcccgacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttattcctagttttta < 1:744548‑M2/149‑72 (MQ=255) gAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagttttta > 1:256733‑M2/1‑78 (MQ=255) gAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagttttta < 1:656002‑M2/149‑72 (MQ=255) tctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGtt < 1:27689‑M1/83‑1 (MQ=255) gaagaGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaactaagtgatagtcttaacaagagctttgagactactcatt > 2:712126‑M2/1‑67 (MQ=255) gcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAgatga > 1:397715‑M1/58‑149 (MQ=255) ttCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGATCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttcgactagtcattggagaaca > 2:713116‑M2/1‑59 (MQ=255) gcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACAcc > 1:222250‑M1/54‑115 (MQ=255) gcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACAcc < 2:222250‑M1/62‑1 (MQ=255) tGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgcatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagat < 1:174447‑M2/149‑94 (MQ=255) taatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACAGCCCTGTGGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTtac < 1:656183‑M1/101‑2 (MQ=255) cATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggggaacagatgatt < 1:727033‑M2/149‑98 (MQ=255) cATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgatt > 1:20225‑M2/1‑52 (MQ=255) aatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTaaa < 1:552522‑M1/102‑1 (MQ=255) tCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatga < 1:574156‑M2/145‑96 (MQ=255) tCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatga > 2:112093‑M2/1‑50 (MQ=255) tCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatga > 2:574156‑M2/1‑50 (MQ=255) tCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatga < 1:112093‑M2/145‑96 (MQ=255) gttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCa > 2:510940‑M1/43‑149 (MQ=255) ttaagtgataacagatgtctggaaatatagggccaaatccaGTATCACGCGCCTCAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCag > 2:665750‑M1/42‑149 (MQ=255) taagtgataacaggtgtctggaaatataggggcaaatgcaGTATCACGCGCTTTATCTATACCTCCGGGGGTAATATTAAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCaga > 2:165477‑M1/41‑149 (MQ=255) taagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCaga > 2:92156‑M1/41‑149 (MQ=255) taagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCaga > 2:27689‑M1/41‑149 (MQ=255) taagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCaga < 2:33661‑M1/109‑1 (MQ=255) ccTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaagatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtct > 1:256018‑M2/1‑45 (MQ=255) cTCACGTCGCCCTTACTTGTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtctt > 1:292348‑M2/1‑44 (MQ=255) tCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtctta < 1:261402‑M2/149‑107 (MQ=255) aCGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtaattggagaacagatgattgatgtcttagg < 2:549245‑M2/149‑109 (MQ=255) gTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggc > 2:58107‑M2/1‑39 (MQ=255) cccTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccgga < 1:749801‑M2/149‑115 (MQ=255) cagatgtctggaactataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGt > 1:524379‑M1/31‑149 (MQ=255) cagatgtctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCACTTGTGCGTTAGTCGCTGATGTCTTTAAATTCACGAGATTGTCCGt < 2:240181‑M1/119‑1 (MQ=255) tctggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACGGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAat < 2:763849‑M1/125‑1 (MQ=255) tttGTCATCGAGAGCCATCTGTGTATCtagactgtccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgattgtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgca > 1:769853‑M2/1‑27 (MQ=255) tggaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAACTTCCAGAGCCTGTCCGTTGCAatat < 1:303483‑M1/127‑1 (MQ=255) ggtCATTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatataacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcagtggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcaga > 2:420983‑M2/2‑25 (MQ=255) gaaatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTa < 2:373596‑M1/129‑1 (MQ=255) aatataggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAAc > 1:225666‑M1/19‑149 (MQ=255) aTTGAGAGCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtgttagggacggggaaacgccgacggc < 1:392073‑M2/149‑129 (MQ=255) ggggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATccc > 1:33661‑M1/13‑149 (MQ=255) agagCTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggaggacagagaattgatgtcttagggcaggagaaacgcagccggcgtac < 1:53092‑M2/149‑133 (MQ=255) ggcaaatccaGTATCACGCGCTTTAAATATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCt < 1:836885‑M1/139‑1 (MQ=255) gCTATCTGTGGATTtagactggcctcctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccac > 2:656002‑M2/1‑14 (MQ=255) cTATCTGTGTATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccaca > 1:240025‑M2/1‑13 (MQ=255) cagtATCACGCGCTTTAAGTATCCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCATCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGCGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATCCCAGAGACTGTCCGTTGTAATATTAACTATCCCCTTACCGGAg < 1:644314/147‑1 (MQ=255) caGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTAccggcg < 2:135569‑M1/147‑3 (MQ=255) tgtATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtacca < 1:87950‑M2/140‑135 (MQ=255) tgtATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtacca > 2:87950‑M2/1‑6 (MQ=255) aGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAgg < 2:214478‑M1/148‑1 (MQ=255) gtATCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaa > 1:688311‑M2/1‑5 (MQ=255) | TCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGC > NC_000913_3_hsa_tpiA/1596203‑1596499 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |