| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 3736204 = | NA (NA) | 6 (0.110) | 5/264 | 7.1 | NA | noncoding (51/171 nt) | REP268 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP268 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 4484368 | NA (NA) | noncoding (54/84 nt) | REP342 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP342 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TGGTGTCATTGTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCTTTACCAGAACGCCA > NC_000913_3_hsa_tpiA/4484223‑4484517 | tggtgTCATTGTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCg > 2:308295/1‑150 (MQ=255) tCATTGTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATaa < 2:169329/150‑1 (MQ=255) aTTGTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAgg < 2:358094/150‑1 (MQ=255) ttGTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATCAGGc > 2:159252/1‑150 (MQ=255) gTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGt < 1:308295/150‑1 (MQ=255) tCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGtt < 1:470494/150‑1 (MQ=255) cAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTGGGTCGGCTAAGGCGTTcc > 1:443052/1‑149 (MQ=255) aGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAc > 2:458094/1‑150 (MQ=255) gcaGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTAGTGGTGGATTTAAATACGGATGAGGGATACACCGCAGCGCCTGTTGCGACGCTGTTGTGTCTTATCGGGCCTCGGATTTCAGTGCTGTGTCGGTTGGATAAGACTTTCCcg > 2:198099/3‑150 (MQ=255) gAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATAGGCATTAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTTTCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTGGGTCGGATAAGGCGTTccag > 2:412085/1‑147 (MQ=255) cgcgTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCATGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaa > 2:881488/1‑150 (MQ=255) cgcgTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACAGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTCAACTAATAGTCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCaa > 1:238626/1‑150 (MQ=38) gTTTTTCATAAATGTGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCAGCCGGCAATaa < 1:999240/150‑1 (MQ=255) tttCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATGTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAg < 2:428713/150‑1 (MQ=255) aTAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCtt < 1:350170/150‑1 (MQ=255) aTAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCtt > 1:367867/1‑150 (MQ=255) aaaTGGGGCTTCTTGTTGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGc < 2:867516/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGc > 1:861526/1‑150 (MQ=255) aaaTGGGGCTTCTTGGGGTGGATTTAAATACGCATAAGGTATACACTGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCGGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGc < 2:870422/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTAACAGCCTTGCCt > 1:417234/1‑150 (MQ=255) ggCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAGGCCGCATCCGGCAATAACAGGCTTGCCTGTCg > 1:342849/1‑150 (MQ=255) ttcttGTGGTTGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTCTGTCGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCaa < 1:460925/150‑1 (MQ=255) ttGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTa > 1:573270/1‑150 (MQ=255) gtggATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCtt > 2:473484/1‑150 (MQ=255) gtggATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGCTATATTATCACTTTCACGCCGCATCCGGCCATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCtt > 1:802792/1‑150 (MQ=255) tggATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTAACAGCCTTGCCTGACGCAATTCCTCTTc > 2:527501/1‑150 (MQ=255) ttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGt < 1:458094/150‑1 (MQ=255) aTACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACACCCTTGCCCGACGCAACTACTCCCCGcccctaac > 2:133546/1‑144 (MQ=38) cGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAAccc > 2:855818/1‑150 (MQ=255) tCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGGAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACGGCCTTGCCTGACGCCAGTACTATTCGCCGGTAAAACCAgcc > 1:14913/1‑149 (MQ=38) ggTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCgg < 1:364762/150‑1 (MQ=255) gTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGt < 1:855818/150‑1 (MQ=255) gTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCACCGCGGt > 2:285857/1‑150 (MQ=255) ataCACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGttt > 2:301783/1‑150 (MQ=255) taaacCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCCGGCCAGCGAGGTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACGCCGCGCGGGTTa > 1:297740/4‑150 (MQ=38) taCACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACCCCATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCCCGGTTTa > 2:323088/1‑150 (MQ=255) acCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACa < 1:865870/99‑1 (MQ=255) acCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACa > 2:865870/1‑99 (MQ=255) ccGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAg < 2:861526/150‑1 (MQ=255) cGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCTTATGGGATTAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAgg > 1:1006100/1‑150 (MQ=39) gCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGa < 2:816996/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGaa < 1:983165/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAAc > 1:38825/1‑150 (MQ=255) cgcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGCGTTAACCGGAACtg > 1:501495/1‑150 (MQ=255) gtcTGGTGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCACCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACtgt < 1:310153/148‑1 (MQ=255) gcCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACtgt < 1:384651/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGc < 2:38825/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCAGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGc < 1:759822/150‑1 (MQ=255) gCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCa > 1:955827/1‑150 (MQ=255) gACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcgcc > 2:657385/1‑66 (MQ=255) gACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 1:657385/66‑1 (MQ=255) gtCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATACCAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCCCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACACTACCCgacg > 2:567879/1‑150 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCTGATAAGGCGCTGACGCCTCATCCAGCAATAACAGCCTTGCCTGACGGCATTACTCTTAGCCAATAAACCCAGCGCGGTTTCACAGGAACTGTGCCACCAACCCTACCgaccgc > 2:126112/1‑145 (MQ=255) ttATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGAcc > 1:742550/1‑150 (MQ=255) ttATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGAcc > 1:851553/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAAc > 2:825207/1‑64 (MQ=255) tCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAAc < 1:825207/64‑1 (MQ=255) aGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCAATGACTGAAACGATATCTGGGGAGCGTGGAACCCAGCGCGGGTTAACAGGAACTGTGCCAGCACCGCTACCGGCCGACCGGTgg > 2:628681/1‑150 (MQ=21) cTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGcc < 1:569483/150‑1 (MQ=255) cTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGcc > 2:477783/1‑150 (MQ=255) cTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGcc > 1:842963/1‑150 (MQ=255) tACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCt > 2:840463/1‑150 (MQ=255) gAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGTAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCtttt > 2:6165/1‑150 (MQ=255) aGTTCAGGGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTg < 2:238626/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGGCTGTCTAGGTCGGCTACGGTGTTCATGCCGCATCCGCCAATAACCGCCTTGCCTGACGCAATCACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGc < 1:595798/150‑1 (MQ=255) ttCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCt < 1:301783/150‑1 (MQ=255) ttCAGTGCTGGGTAGGTCGGATAAGGCGTGTCCGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCt < 2:450551/150‑1 (MQ=255) ttgtAGCACGAATAAGTCGTTCCGGTGGCACCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCTTTACCAGaa < 2:1025411/149‑1 (MQ=255) gtAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCTTTACCAGAAca > 1:1025411/1‑149 (MQ=255) aGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCTTTACCAGAACGcc > 1:290100/1‑150 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCTTTACCAGAACGctg > 2:978968/1‑148 (MQ=255) | TGGTGTCATTGTCCAGAAGGTAGAACGTCGCGTTTTTCATAAATGGGGCTTCTTGTGGTGGATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAATTACTCTTCGCCGTTAAACCCAGCGCGGTTTAACAGGAACTGTGCCAGCAACGCTACCGGACGACCGGTGGCGCCTTTTGCTTTACCAGAACGCCA > NC_000913_3_hsa_tpiA/4484223‑4484517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |