New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 458737 | 65 (1.080) | 7 (0.120) | 6/268 | 7.3 | 10.5% | intergenic (+37/‑151) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 458748 | 57 (1.000) | intergenic (+48/‑140) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCT > NC_000913_3_hsa_tpiA/458602‑458885 | gTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTcc > 1:102341/1‑149 (MQ=255) gTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTcc > 2:904361/1‑149 (MQ=255) gAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCt > 1:764472/1‑149 (MQ=255) aaaaaGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGAGTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGCATCAAAAACCAGTCACAGACTATTATTTAACCAAAAAGGGGGGACTTTATCTCCTCtt > 1:295603/1‑149 (MQ=255) gTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAAtt > 1:384551/1‑149 (MQ=255) ttATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAAGCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAAAAAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTc < 2:811613/149‑1 (MQ=255) ttATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTc < 1:314137/149‑1 (MQ=255) tATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTcc < 2:623662/149‑1 (MQ=255) tCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCctc > 2:1021510/1‑149 (MQ=255) tCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCctc < 1:31872/149‑1 (MQ=255) tCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACAGATCAAGACGGATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATGTTATCTCCCCTTTAATTTTTCctc > 1:517207/1‑149 (MQ=255) gTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTACTTTTTCATCTATTCTCgcca > 2:987129/1‑146 (MQ=255) gTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCg > 1:583807/1‑149 (MQ=255) gTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 1:400686/149‑1 (MQ=255) gTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTACGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 1:945797/149‑1 (MQ=255) tCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATGTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTggg < 2:818728/149‑1 (MQ=255) tCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTggg < 1:373357/149‑1 (MQ=255) cGTTGCGGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATccc < 1:1021510/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATcccc < 1:203004/149‑1 (MQ=255) cTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCatat > 2:165064/1‑149 (MQ=255) tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCAtata < 1:904361/149‑1 (MQ=255) gaaaGCCAGAAGCGCAAGAGGCAGCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATAAAAATAGAAAAAAAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTAc < 2:800288/147‑1 (MQ=255) aaGCTGGAAGCGCAACAGGAATTTGGTGAAGAATTAACCCTTTCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCGCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt < 2:562751/149‑1 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt > 1:439656/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt < 1:135440/149‑1 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGACATCTTGGGAATAATTAACCTTTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTTCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCTGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt < 2:681300/149‑1 (MQ=255) gcgAACCGCAACAGGCAATTGGTGACTACTTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTa < 1:343389/147‑1 (MQ=255) gAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt < 2:583807/149‑1 (MQ=255) aGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAg > 2:614467/1‑149 (MQ=255) cggaaCAGGGATCTTGTGAATAATGTGCTATTCCCATACAATTAGTAAAACAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGAt < 2:218090/146‑1 (MQ=255) gcAACAGGCAACCGGTGAATAAATAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATg < 2:439656/149‑1 (MQ=255) aaCAGGGATCGGGGGAATAATTAAACATTCACATACAATGAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc < 2:837018/149‑1 (MQ=255) aCAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCACTTTAATTTTTCCTATATTCCCGGCGGTTAAGGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGCACATGTTAATAGATGGCg > 2:379835/1‑149 (MQ=255) aGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTg > 2:568909/1‑149 (MQ=255) gCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa < 1:165064/149‑1 (MQ=255) cATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAg < 1:614467/149‑1 (MQ=255) aTCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGc > 2:682008/1‑149 (MQ=255) gcTGGTGCATAATTACACATTCCCGTCCAATTAGTAAACCAAAAAGGGGGGTTTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCTGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGTCGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca < 2:339627/148‑1 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGAGTTAAATGTGGGGGAACCATCCCCATATACTGCCGTACATGTTAATAGATGGCGTGACGcgaa > 2:206614/1‑146 (MQ=255) gcgAATAATTAACCATTCCAATACAATTAGCTAACCGAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTACTTTTTGCGTTTAATGTGGGAGCAGCATCCTAATATACTGACGTACATTTTTATTGTAGGCGTGAAGCACGGt > 2:1041879/3‑149 (MQ=255) gTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGt > 1:210960/1‑149 (MQ=255) gTGAATAATTAACCATTACCATAGAAATAGAAAAAAAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGt < 2:323734/149‑1 (MQ=255) aataatTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt < 1:682008/149‑1 (MQ=255) atTAACCATTCCAATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTGTATTCTCGGAGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTGATAGATGGCGTGAAGCACGGTCgtgtga > 1:464848/1‑147 (MQ=255) tAACCATTCCCATACAAATAGTTAACCAAAAAGGCGTGATTTCCACTACCCAATAATTTTTCCTCTATTCTCGTCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCTTGTCATc < 1:506437/149‑1 (MQ=255) aaCCATTCCCATACAATTCGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCt < 1:77064/149‑1 (MQ=255) gcgaTTCCCATACAATAAGTTAACCAAGAAGGGGTGATTTTTTCTCCCCATTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAACGTGGGAGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTg < 2:570898/146‑1 (MQ=255) agcATACCAATACACTAATTAAACAAAAAAAGGGGGATTTTATCTCACCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTg < 2:570879/147‑1 (MQ=255) cATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgggg < 1:707550/84‑1 (MQ=255) cATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgggg > 2:707550/1‑84 (MQ=255) tCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTAc < 2:764472/149‑1 (MQ=255) cATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTg > 1:654858/1‑149 (MQ=255) tACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGc < 2:102341/149‑1 (MQ=255) ttAGTTCACCAAAAAGGGGGGATTTTATTTCCCCTTTAATTTTTCCTCTACTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGaaa < 2:517207/149‑1 (MQ=255) gggtAACCAAAAAGGGGGGATTTTATGTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGATGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAAtt < 2:269582/146‑1 (MQ=255) tAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTaaa < 2:746918/149‑1 (MQ=255) aCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGAGTTGAATGTGGGGGGAATATCCCCTTATACTGACGTACATGTTAGTGGATGACTTGAACCACAGTGTTGTACTATCATTTCTTGACGGAGATTAAGCt > 2:13327/1‑149 (MQ=255) aaaaaGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATAGTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGAATACCTGGCGGATATTAAACTAag > 2:869484/1‑149 (MQ=255) aaaaGGGTGGATTTTATCTCCTCTTTAATTTTACCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAaga < 2:464848/149‑1 (MQ=255) gggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGct > 1:108759/1‑149 (MQ=255) gggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGct > 1:55422/1‑149 (MQ=255) | GTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCT > NC_000913_3_hsa_tpiA/458602‑458885 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |