New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2700550 = | 136 (0.850) | 15 (0.110) | 14/230 | 15.2 | 11.9% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2700601 = | 105 (0.770) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_tpiA/2700715‑2700550 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAG > NC_000913_3_hsa_tpiA/2700601‑2700749 CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG < 4:716800/150‑1 CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG < 1:1374665/150‑1 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGG < 1:1326947/150‑1 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGG < 3:644043/150‑1 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG < 1:185488/150‑1 AAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGGGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTT > 3:344341/1‑150 TGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTAC > 1:128332/1‑150 GCGGACAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATCATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTCGTAAGGAACGGGGGTTTTACTT > 2:1324438/1‑150 GGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTACTTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTT > 2:332773/1‑150 GAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTT > 2:1601304/1‑150 AAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTA < 2:1745615/150‑1 AAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATTTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 1:1811161/150‑1 AAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 1:1550814/150‑1 ATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATA > 1:94363/1‑150 TTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGC > 1:1029445/1‑150 ACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAACGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAAC > 1:899317/1‑150 TTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCA > 2:1176974/1‑79 TTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCA < 1:1176974/79‑1 TTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTT > 1:719756/1‑150 TAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTT > 2:1420559/1‑150 AAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTC > 2:1720668/1‑150 AAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCC > 2:1390755/1‑150 AAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGGTTTACTTTTTAACGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCC > 1:346734/1‑150 AAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCCGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCG > 4:116583/1‑150 TAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAG > 3:546480/1‑150 AAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGC > 1:134876/1‑106 AAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGC < 2:134876/106‑1 AACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGC > 2:141341/1‑150 CGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCG > 1:20683/1‑150 GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAA < 1:75403/106‑1 GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAA > 2:75403/1‑106 GTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCC > 2:301724/1‑150 TTACTTTTTAACGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTG < 2:899317/150‑1 TTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTG > 4:18689/1‑150 TACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCTCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATTGCCGTAGCCtttt > 2:530362/1‑146 TACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGG > 2:706984/1‑150 ACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGT < 3:313369/150‑1 ACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATG > 1:320644/1‑86 ACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATG < 2:320644/86‑1 CTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTT > 2:826802/1‑150 CTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTT < 4:888091/150‑1 CTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCC < 2:214885/130‑1 CTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCC > 1:214885/1‑130 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTTACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 2:1076666/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 2:755496/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 4:447119/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 3:854981/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGACGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 1:417753/1‑150 TTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTG < 4:48149/150‑1 TTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTG < 2:1374665/150‑1 TTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTG < 1:706984/150‑1 TTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGC < 1:738657/150‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC < 2:1475992/150‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC < 2:112247/150‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTT < 2:580680/88‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTT > 1:580680/1‑88 TAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCG < 2:20683/150‑1 TAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCG > 3:620447/1‑150 TAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCG > 1:1747843/1‑150 AAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGA < 2:1550814/150‑1 AAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTG > 2:1270899/1‑87 AAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTG < 1:1270899/87‑1 AAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAG < 2:1029445/150‑1 CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_tpiA/2700715‑2700550 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAG > NC_000913_3_hsa_tpiA/2700601‑2700749 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |