| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2295953 = | 10 (0.060) | 155 (0.970) | 102/268 | 0.5 | 93.9% | coding (368/738 nt) | ccmC | heme export ABC transporter permease; CcmE‑interacting protein |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 2515614 | NA (NA) | intergenic (+171/+29) | insL1/yfeA | IS186 transposase/putative diguanylate cyclase | |||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
AATCGGCAGATTCACCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGCCAATAAACGCTGCCACTGCCAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/2295805‑2296101 | aatCGGCAGATTCACCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACcca < 1:1042028/150‑1 (MQ=255) cAGATTCACCACGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGt < 4:892916/150‑1 (MQ=255) tggagcttacaggtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGc < 2:494424‑M1/10‑1 (MQ=255) accacGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCata > 2:1317299‑M1/1‑147 (MQ=255) acGCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagc > 1:548255‑M1/1‑144 (MQ=255) gCCAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCC < 1:1702557‑M1/142‑1 (MQ=255) cAATCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgcta > 2:1613417‑M1/1‑140 (MQ=255) aaTCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGTCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaa > 2:834641‑M1/1‑139 (MQ=255) ggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCAc < 2:240152‑M1/3‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGC < 2:1266347‑M1/135‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGC > 1:1266347‑M1/1‑135 (MQ=255) gccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTc > 3:372307‑M1/126‑150 (MQ=255) ccattcgtgggacagtatctctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTcc > 1:365785‑M1/125‑150 (MQ=255) aGCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCC < 3:407814‑M1/134‑1 (MQ=255) gCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaa < 4:1112950‑M1/150‑17 (MQ=255) gCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaa < 2:152744‑M1/150‑17 (MQ=255) gCACCAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaa < 2:1100563‑M1/150‑17 (MQ=255) attcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTcccc > 2:442696‑M1/123‑150 (MQ=255) cAGGATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGc > 4:172729/1‑150 (MQ=255) ggATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttg > 3:623158‑M1/1‑128 (MQ=255) ggATACCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttg < 1:101112‑M1/150‑23 (MQ=255) aCCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagtgttgtggt > 4:906069‑M1/1‑124 (MQ=255) aCCTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggt > 4:445047‑M1/1‑124 (MQ=255) cTGCCGCACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat > 3:32520‑M1/1‑122 (MQ=255) tatccctgacagcctacaaaactcaattgaagatcgcgtgtcatcgtcttaacggggcaccgaggcgtcgcattctttagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGt > 3:506159‑M1/110‑150 (MQ=255) tatccctgacagcctacaaaacgcaatagaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGt < 1:1315905‑M1/41‑1 (MQ=255) ccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcaccgtcttaacgaggcaccgagccgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAAc < 4:507803‑M1/44‑1 (MQ=255) cctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAAcc < 2:386316‑M1/45‑1 (MQ=255) ctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCa > 1:1096537‑M1/105‑150 (MQ=255) cACGGCCCGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcc > 1:1360642‑M1/1‑116 (MQ=255) tgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAg > 1:90329‑M1/104‑150 (MQ=255) tgaaagcctacaaaacgaaattgaagcacgcgacggattgtctgaacgaggcacctaggcggcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAg > 1:813065‑M1/104‑150 (MQ=255) acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgatgcggcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAggg > 1:1489868‑M1/102‑150 (MQ=255) acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAggg > 1:454538‑M1/102‑150 (MQ=255) cGCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg > 2:1716688‑M1/1‑109 (MQ=255) gCCAGACGGCGGTCGTCGAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga < 4:9469‑M1/150‑43 (MQ=255) aaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGt < 2:1705601‑M1/59‑1 (MQ=255) aaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGt > 3:705415‑M1/92‑150 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGt > 4:702210‑M1/86‑93 (MQ=255) tcgtcgAAGGCGTGCCACAGGGCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccg < 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1:194093‑M1/1‑79 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCAt < 1:972572‑M1/83‑1 (MQ=255) ggCAATCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataa < 2:355433‑M1/80‑5 (MQ=255) aaTCACACCCACATACAAAAACAGCAGCACCAGTTCAGAAGTCAGACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactg < 2:1070551‑M1/150‑78 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCgccgcc < 2:1092538‑M1/90‑1 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGccgcca < 2:1663431‑M1/91‑1 (MQ=255) 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2:1459566‑M1/110‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttataCACCAGGTGCCCCGCATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGccgccaccgcc < 2:951588‑M1/96‑1 (MQ=255) gACGTGCATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaaggggtgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggata > 1:232835‑M1/1‑29 (MQ=255) agttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGCCAAt > 4:426841‑M1/15‑145 (MQ=255) gttagcgcttaagCACCAGCTGCCCCCTCTCCGTTAGTCCCGTGCATATCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGCCAATAAACGc > 1:1726766‑M1/14‑150 (MQ=255) ttagcgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGCCAATAAACGct < 4:140991‑M1/138‑1 (MQ=255) cATCCCATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcgg < 2:1751695‑M1/150‑128 (MQ=255) cgcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGCCAATAAACGctgcca > 4:2477‑M1/9‑150 (MQ=255) cgcttaggCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGCCAATAAACGctgcca > 4:1065751‑M1/9‑150 (MQ=255) cccATACCCACCAGGTGCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcac > 1:330782‑M1/1‑20 (MQ=255) gcttatgCACCAGGTGCCCCACATCGGTTTTCCCCATGCAGAGCCGGTAACCAGGGCAATAAAGGTAAACACGGCACCAATGGGGGCCATCGCCGCCACCGCCAGGTTGGCCATTTTCATCTGCCAGACAAGGc > 1:772677‑M1/8‑134 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |