| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1,774,576 | G→A | G263E (GGG→GAG) | ydiB → | quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_hsa_tpiA | 1,774,576 | 0 | G | A | 99.3% | 506.7 / NA | 142 | G263E (GGG→GAG) | ydiB | quinate/shikimate 5‑dehydrogenase, NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (74/66); total (74/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGTA > NC_000913_3_hsa_tpiA/1774429‑1774722 | aatCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAgagg < 3:203862/150‑1 (MQ=255) ttGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa < 2:761284/150‑1 (MQ=255) ttGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGAACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCAGGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa < 1:1349173/150‑1 (MQ=255) tAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGtt < 2:1330941/150‑1 (MQ=255) tGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTg > 3:1005833/1‑150 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa > 2:1015626/1‑129 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGtt > 1:1160732/1‑134 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGc > 3:224413/1‑150 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGc > 4:1049767/1‑150 (MQ=255) ttACATCCGGGACTTCTGGTCACTCAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGaa < 1:1015626/129‑1 (MQ=255) cATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCaaa < 1:908218/150‑1 (MQ=255) aTCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAg > 1:1703017/1‑150 (MQ=255) cGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGAtt > 1:1465425/1‑150 (MQ=255) gggACTTCTGGTCACTGGATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGAttt < 2:1398325/150‑1 (MQ=255) tCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCctct > 4:303490/1‑150 (MQ=255) gTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGaa > 1:1671562/1‑150 (MQ=255) tCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAat < 4:367936/150‑1 (MQ=255) aCTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAatat > 4:516803/1‑150 (MQ=255) tGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGt > 1:1255824/1‑150 (MQ=255) tgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAgg > 4:121376/1‑150 (MQ=255) tgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAgg > 3:554727/1‑150 (MQ=255) tgtATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAgg > 1:843580/1‑150 (MQ=255) ataACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGtt > 1:1054121/1‑100 (MQ=255) taACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGa < 2:176923/110‑1 (MQ=255) taACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCAt < 3:121376/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg > 3:432556/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg > 1:1737638/1‑150 (MQ=255) aaCCCGAATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg > 4:859967/1‑150 (MQ=255) aCCCGCATATGACGAAGGTATTGCAGCAAGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGCCTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATgg < 4:639374/150‑1 (MQ=255) ccGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATgggg > 1:809996/1‑150 (MQ=255) cGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGt > 2:1732387/1‑150 (MQ=255) atatGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCg < 3:463193/150‑1 (MQ=255) gACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGc < 2:1652856/150‑1 (MQ=255) aCGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGcc > 3:935657/1‑150 (MQ=255) gAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTg > 2:1787576/1‑150 (MQ=255) gTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAAGAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACa < 4:851693/150‑1 (MQ=255) gTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACa > 1:1815382/1‑150 (MQ=255) tATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAgg < 4:670980/150‑1 (MQ=255) aTTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGc < 1:1748123/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTcaca < 2:1796296/81‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGaa > 1:1539373/1‑111 (MQ=255) ttGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg > 2:1048357/1‑129 (MQ=255) tGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTg > 1:1107751/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGa > 1:91472/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGtt < 3:98441/114‑1 (MQ=255) cagcagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGt > 4:322709/1‑122 (MQ=255) cagcagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGt < 3:322709/122‑1 (MQ=255) cagcagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGAc > 1:422019/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGAc < 2:879737/150‑1 (MQ=255) agcagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGAcc < 4:723704/150‑1 (MQ=255) cagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGtt < 1:279044/128‑1 (MQ=255) cagGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGtt > 2:279044/1‑128 (MQ=255) ggCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGt < 1:1787576/150‑1 (MQ=255) gcgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTg > 1:179219/1‑150 (MQ=255) gcgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTg > 2:1351557/1‑150 (MQ=255) gcgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTg > 2:209137/1‑150 (MQ=255) cgcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGc < 1:338788/150‑1 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCa > 3:98793/1‑150 (MQ=255) gcAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCa > 2:104264/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAg > 2:571771/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGGTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAgg > 4:1117239/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAggg < 2:1435955/150‑1 (MQ=255) ggTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaa > 2:1009679/1‑150 (MQ=255) gTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTgg > 4:937923/1‑70 (MQ=255) gTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAAAAGGTCATGGGGATCGATGGCTGATAGGCAGAGTGCGTGCAGAAAGGGTaaa > 3:40722/1‑150 (MQ=255) ttGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaa > 2:597942/1‑150 (MQ=255) tagCAAAACGATAGATGGATACGGCATGTTGTTGTAGAAAGGGGCTAAACAGTTCACAAGAAAGGCTGGCAAGGATTTTCCTGAGGAATATGTTAAGGAGGTGATGGGGTGCGGTGGCTGAAAGACTGCCCGTGTGCAGAAGGGGTaaaa < 2:739013/148‑1 (MQ=255) cAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTg > 2:1098854/1‑82 (MQ=255) cAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCGCTg < 1:1098854/82‑1 (MQ=255) aaaaCGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATg > 4:657727/1‑150 (MQ=255) aaaaCGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATg > 2:1595968/1‑150 (MQ=255) aTGGATACGGTATGTTGTTGAGTGAAGCGGCGGAAACGTTGACATTCAGGACCGGCAAAGCTCTTCCTCTGCAATATGTTAAACAGATCATAGAATACATTGCTTAAGCGGCTGCTTGATTACATAAAGTGAAAAAAATGAAAACCGTaa < 2:1476189/150‑1 (MQ=255) aTGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTaa < 1:966903/150‑1 (MQ=255) aTGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTaa < 2:577764/150‑1 (MQ=255) aTGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTaa > 1:1630854/1‑150 (MQ=255) gATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTg > 1:296058/1‑150 (MQ=255) aTACGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGt < 1:1009558/150‑1 (MQ=255) aCGGCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTaa < 1:1647985/150‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaaa < 3:74499/129‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTaaaaa > 4:74499/1‑129 (MQ=255) cATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAAc > 3:894924/1‑135 (MQ=255) cATGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAAc < 4:894924/135‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg < 1:1057335/81‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGTGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATg > 2:1057335/1‑81 (MQ=255) gttgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGAtct < 3:859967/150‑1 (MQ=255) ttgttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGAtctc < 2:1630854/150‑1 (MQ=255) gttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGt < 4:554727/150‑1 (MQ=255) gttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGt > 2:1287667/1‑150 (MQ=255) gttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGt < 2:1465425/150‑1 (MQ=255) ttgtGGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTc < 1:489988/150‑1 (MQ=255) tgGCAAGAGGCTGACGAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCGCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAtt < 1:1015564/150‑1 (MQ=255) tgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAtt < 4:224413/150‑1 (MQ=255) tgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAtt > 1:457910/1‑150 (MQ=255) tgGCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAtt < 4:385811/150‑1 (MQ=255) tgGCAAGAGGCTGAACAGGTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCAtt < 2:1786792/150‑1 (MQ=255) ggCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAat > 1:1740715/1‑54 (MQ=255) gCAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTgg > 2:1807/1‑150 (MQ=255) cAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGt > 3:1000395/1‑150 (MQ=255) cAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGt > 4:1014582/1‑150 (MQ=255) cAAGAGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAAAAAAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGt < 2:91472/150‑1 (MQ=255) | AATCATTGGTTAATGATATCAGTCTGTTACATCCGGGACTTCTGGTCACTGAATGCGTGTATAACCCGCATATGACGAAGTTATTGCAGCAGGCGCAACAAGCTGGTTGCAAAACGATTGATGGATACGGCATGTTGTTGTGGCAAGGGGCTGAACAGTTCACATTATGGACTGGCAAAGATTTCCCTCTGGAATATGTTAAACAGGTCATGGGGTTCGGTGCCTGACAGGCTGACCGCGTGCAGAAAGGGTAAAAAATGAAAACCGTAACTGTAAAAGATCTCGTCATTGGTA > NC_000913_3_hsa_tpiA/1774429‑1774722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |