New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 3287115 | 54 (0.950) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 5.5% | intergenic (+90/‑311) | agaI/yraH | galactosamine‑6‑phosphate isomerase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
? | NC_000913_3_hsa_tpiA | = 3287131 | 53 (1.030) | intergenic (+106/‑295) | agaI/yraH | galactosamine‑6‑phosphate isomerase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
TTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATGAAAAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/3286983‑3287279 | tttATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAg < 1:547960‑M2/150‑2 (MQ=255) acggcaGCACAGTAACTTTATTTGTTGAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATCTGCTCAAAATGTTGAAATTAACCTATGTAACAGGCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGCTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAgtta > 2:284551‑M2/3‑146 (MQ=255) ggCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAgttatg < 3:24211‑M2/150‑7 (MQ=255) gCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAgttatgttca < 1:270334‑M2/150‑11 (MQ=255) aGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaacaa > 1:271687/1‑150 (MQ=255) tAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatt > 1:66916/1‑150 (MQ=255) aaCTGTATTTGTTGAATTGACACTCACACAGATGAAAAGTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGTCTGGGTTGAACATAACGCCGCTAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaattt < 2:533172/150‑1 (MQ=255) tttATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaat > 3:100504/1‑150 (MQ=255) tttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTa < 4:44934/150‑1 (MQ=255) cacCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATaa < 4:41275/150‑1 (MQ=255) acCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAAc > 4:364110/1‑150 (MQ=255) cTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACtt < 2:509596/150‑1 (MQ=255) tAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTg < 2:547960/150‑1 (MQ=255) gATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATATCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTAt < 3:314647/150‑1 (MQ=255) gATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTAt < 1:576737/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta < 2:313060/150‑1 (MQ=255) gAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaa > 2:257158/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaata < 4:28791/150‑1 (MQ=255) aaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaataa < 2:386349/150‑1 (MQ=255) ttGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGTCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCa < 4:373707/150‑1 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAgttatgttcaacccagtcaaatgttatttaatataatgcgtgactgttacataagttaattt < 3:369337‑M2/150‑63 (MQ=255) aaaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAgttatgttcaacccagtcaaatgttatttaatataatgcgtgactgttacataagttaatttaa > 4:369337‑M2/1‑86 (MQ=255) aaaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTa < 1:418135/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTCCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTa > 2:387710/1‑150 (MQ=255) aaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTAt < 2:357417/150‑1 (MQ=255) aaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATGCAATAAGATTTGACTGGGTTGAAGATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATAGACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCTCCTCGTac < 2:54660/150‑2 (MQ=255) aTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTAtt < 2:172465/150‑1 (MQ=255) gTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCt < 4:181226/150‑1 (MQ=255) gTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCt < 1:475178/150‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTg > 2:410907/1‑150 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTg > 4:211376/1‑150 (MQ=255) tttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAAAAATTTAATCTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTg < 2:145259/150‑1 (MQ=255) ttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGa > 3:127836/1‑150 (MQ=255) ttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGa > 1:126585/1‑150 (MQ=255) ttAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGa > 1:96761/1‑150 (MQ=255) tAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGAc < 1:534696/150‑1 (MQ=255) aaaTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACt < 2:537341/150‑1 (MQ=255) ttATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCt < 3:25509/150‑1 (MQ=255) ttATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCt < 3:25415/150‑1 (MQ=255) tGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgc > 1:420284/1‑150 (MQ=255) tAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGgcgc > 3:102085/1‑150 (MQ=255) tCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCaaa > 1:123081/1‑150 (MQ=255) tCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCaaa > 2:512796/1‑150 (MQ=255) atatTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCAt < 2:493068/150‑1 (MQ=255) ttAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTta < 2:66916/150‑1 (MQ=255) aaTAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATAc > 2:426611/1‑150 (MQ=255) aaTAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATAc > 4:256735/1‑150 (MQ=255) tAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGAGCAGCAAAGTCAGGCATTTATActc > 2:303667/1‑150 (MQ=255) aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtttt < 3:10223/150‑1 (MQ=255) ttGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCACCAATATAATCTTAGAAACCCGGAGAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGa < 1:498522/150‑1 (MQ=255) ttGCACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGa > 4:19798/1‑150 (MQ=255) ttGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGa > 2:37150/1‑150 (MQ=255) ttGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGa > 3:263533/1‑150 (MQ=255) ttGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGa > 4:332713/1‑150 (MQ=255) gAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGaaa > 2:549001/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGATAGCAAAAGGAgttatgttcaacccagtcaaatgttatttaatataatgcgtgactgttacataagttaatttaaacattttgagcaaatttttcatctggttaggtgttaattaaacaaataaagttactgtgcagccata < 3:112760‑M2/150‑132 (MQ=255) aaCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGat < 1:262438/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGat < 3:165511/150‑1 (MQ=255) aCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGata > 1:457454/1‑150 (MQ=255) cGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat > 3:325485/1‑150 (MQ=255) cGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat > 1:331880/1‑150 (MQ=255) gCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATc > 1:494235/1‑150 (MQ=255) aaaaGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATg > 1:309794/1‑150 (MQ=255) aaGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATGaa < 1:35025/150‑1 (MQ=255) gAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCGCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATGTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATGAAAat > 2:396581/1‑150 (MQ=255) | TTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATATCAATATAATGAAAAT > NC_000913_3_hsa_tpiA/3286983‑3287279 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |