| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTG > NC_000913/1158358‑1158651 | agaccttctctcagtgggctgcttaccagaacccggtagttgcgtttggcatttacggtttcatcgaacgttgcctggtaccgtttggtctgcaccacatctggaacgtacctttccagatgcagattggtgtattcaccaatctgCAt > 2:700603‑M1/147‑149 (MQ=255) gaccttctctcagtgggctgcttaccagaacccggtagttgcgtttggcatttacggtttcatcgaacgttgcctggtaccgtttggtctgcaccacatctggaacgtacctttccagatgcagattggtgtattcaccaatctgCATc > 1:1012698‑M1/146‑149 (MQ=255) ccttctctcagtgggctgcttaccagaacccggtagttgcgtttggcatttacggtttcatcgaacgttgcctggtaccgtttggtctgcaccacatctggaacgtacctttccagatgcagattggtgtattcaccaatctgCATCTg > 1:666648‑M1/144‑149 (MQ=255) 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agTCCTCCATCTCGCCGCCGATTGGTTCTGCAACCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCCGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCt < 2:371987/148‑1 (MQ=255) ccttagttGGCCGCCGATTGTTTCGGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTcc < 2:798955/143‑1 (MQ=255) ttCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCCCCACATCTGGAACGTa > 1:231299/1‑141 (MQ=255) ttCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTa < 2:231299/141‑1 (MQ=255) ttCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCa > 1:368464/1‑149 (MQ=255) 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2:412299/1‑149 (MQ=255) tGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTc < 1:911409/149‑1 (MQ=255) tgtattcaccaatctgCATCTGGAAAGGTACGTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTc < 2:647703‑M1/133‑1 (MQ=255) tttGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGcaggtcagg > 1:732927/1‑73 (MQ=255) tttGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGcaggtcagg < 2:732927/73‑1 (MQ=255) tattcaccaatctgCATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGGAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCaa < 1:906809‑M1/135‑1 (MQ=255) ggTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGtattcaccaatctgcatctggaacgtgcctttccagatgcagattgaggaatacaccaacgccgcaggccaggttttccacggcgacatccccccttatctgt < 2:530215‑M2/149‑104 (MQ=255) tCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGCTTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGGTATATGGCGGCTGCCCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTAGCTTCCTGTTCACAATGt > 2:275697/1‑149 (MQ=255) tCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGtattcaccaatctgcatctggaacttacctttccagatgcagattggtgaatacacaaacgcagcaggtcaggttttccacggcgacattccgcgttatatggcg < 2:777310‑M2/149‑106 (MQ=255) accaatctgCATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATCCACCAAAGCAGCCGGTCAGGTTTTGCACGGTGATATGCCGCGTGATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGt < 1:961071‑M1/140‑1 (MQ=255) cTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTa < 2:370026/149‑1 (MQ=255) cTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTa < 1:525571/149‑1 (MQ=255) gCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGtattcaccaatctgcatctggaacgtacctttccagatgcagattggtgaatacaccaacgcagcaggtcaggttttccacggcgacattccgcgttatatggcgggt < 1:889341‑M2/149‑109 (MQ=255) caccacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGtattcaccaa < 2:702644‑M2/50‑11 (MQ=255) caccacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCaa < 1:702644/50‑1 (MQ=255) atctgCATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACgg > 2:885621‑M1/6‑149 (MQ=255) atctgCATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAAAGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGGAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGGTCaaaatggaagg < 1:474282‑M1/144‑6 (MQ=255) accacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGt > 1:836514/1‑149 (MQ=255) ccacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGtattcaccaatctgcatctggaacgtacctttccaaatgcagattggtgaatacaccaacgcagcaggtcaggttttccacggcgacattccgcgttatatggcgggtgac < 1:117485‑M2/149‑112 (MQ=255) cacaTCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACCGTCt > 1:231489/1‑149 (MQ=255) gCATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTg < 1:1011256‑M1/148‑1 (MQ=255) | ACTGGCGTTGTGCTGTCCTTCATTTGGCCGCCGATTGGTTCTGCAATCCAGACCTTCTCTCAGTGGGCTGCTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTG > NC_000913/1158358‑1158651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |