New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1893757 = | 119 (1.180) | 12 (0.130) | 9/280 | 9.1 | 9.7% | intergenic (+46/‑376) | yoaB/yoaC | putative reactive intermediate deaminase/DUF1889 family protein |
? | NC_000913 | 1893784 = | 111 (1.160) | intergenic (+73/‑349) | yoaB/yoaC | putative reactive intermediate deaminase/DUF1889 family protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTTTTCTTTCTTAG > NC_000913/1893638‑1893929 | tGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAgaga > 2:113477/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAACTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGaa < 1:958387/149‑1 (MQ=255) tttcACGGTACAAGCGGGGTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCTGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATaa < 2:52731/146‑1 (MQ=255) cACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGat > 1:509438/1‑149 (MQ=255) cGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGatat > 1:876628/1‑149 (MQ=255) gTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTa < 2:556473/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt < 2:521047/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt > 1:960429/1‑149 (MQ=255) aaGCGGGTGTGATTAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGACGCAAAATAAGTCAGACGATATTTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGt < 2:1080465/149‑1 (MQ=255) 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ttGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATtatttaaatt < 2:141095/149‑1 (MQ=255) aaTTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGCTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTAtttatatttata > 2:325283/1‑149 (MQ=255) aTTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATaa < 2:960429/149‑1 (MQ=255) aTTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTGCTGCTAATTCATTAATTATATTTATaa > 2:892667/1‑149 (MQ=255) ttAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAAt < 2:1343486/149‑1 (MQ=255) 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tGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTa > 1:119054/1‑149 (MQ=255) gTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGtt > 1:969696/1‑129 (MQ=255) gTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGc > 1:251938/1‑149 (MQ=255) tttACATAAATCGACCAGATAATAAGATATTACTGTTTATGCTTCTTCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTAGATTAGCAActct < 1:1032533/149‑1 (MQ=255) aCATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGt < 2:1634851/149‑1 (MQ=255) 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tCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTAGCCCTTTGATTAGAAACTCTGGTtttattt > 1:412673/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATACAAAATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAATCATGACGTTGTGTTCTCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTtttcttt > 1:406754/1‑149 (MQ=255) cGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTtttctttc < 1:1433102/149‑1 (MQ=255) gACCAGAGAATAATATATTACTGTTGATTCTTCTTCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTTttctttct < 1:1472558/149‑1 (MQ=255) gACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTTttctttct < 2:251938/149‑1 (MQ=255) 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TGCGCTGCACGGTACAAGCGGGTTTGATGAACCCGAAGTATAAAGTTGAAATTAAGATTGTGGCTGCGGTGTAAGCTTTATCGAAGCAAAATAAGTCAGACGATAATTTATCGATAATACTGGTCGGTTTTACATAAATCGACCAGAGAATAAGATATTACTGTTGATGCTTCTGCTAATTCATTATTTATATTTATAATTTCAATTTTATCTATAAAACTAACTATATAAATAAACATAAACATGCCGTTGTGTTCGCCCTTTGATTAGCAACTCTGGTTTTCTTTCTTAG > NC_000913/1893638‑1893929 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |