| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_pae_tpiA | 1,263,669 | G→A | intergenic (‑169/‑45) | lolB ← / → hemA | lipoprotein localization factor/glutamyl tRNA reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_pae_tpiA | 1,263,669 | 0 | G | A | 84.3% | 205.6 / 27.8 | 83 | intergenic (‑169/‑45) | lolB/hemA | lipoprotein localization factor/glutamyl tRNA reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/5); new base A (38/32); total (46/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
ACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGGCGCTTGAC > NC_000913_3_pae_tpiA/1263523‑1263812 | aCGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACaa < 2:27633/150‑1 (MQ=255) ttATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTaa > 1:509174/1‑150 (MQ=255) ccTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAAc < 3:100080/144‑1 (MQ=255) ccTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAAc > 4:100080/1‑144 (MQ=255) cTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCa > 2:624110/1‑150 (MQ=255) aTGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGt < 1:624110/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatt > 3:689078/1‑150 (MQ=255) gTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATACTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatta > 1:1083348/1‑150 (MQ=255) ccGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGc < 2:509174/150‑1 (MQ=255) ccGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGc < 2:573551/150‑1 (MQ=255) gCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAg > 2:439003/1‑150 (MQ=255) cTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAACTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGCGCGCTCTCTTTTATTGATCGTCCGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAgc < 2:615234/150‑2 (MQ=255) gTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGa > 3:327449/1‑150 (MQ=255) tCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGAc > 4:288292/1‑150 (MQ=255) ttCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCtttt > 4:269180/1‑150 (MQ=255) ttCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCtttt > 2:430088/1‑150 (MQ=255) ttCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCtttt > 2:880722/1‑150 (MQ=255) aaGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGc > 2:280013/1‑150 (MQ=255) cTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCttt < 4:487225/139‑1 (MQ=255) cTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCttt < 4:487221/139‑1 (MQ=255) cTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCttt > 3:487221/1‑139 (MQ=255) cTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCttt > 3:487225/1‑139 (MQ=255) ttGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGc > 3:477524/1‑138 (MQ=255) ttGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGc < 4:477524/138‑1 (MQ=255) gCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAAcc > 2:55624/1‑150 (MQ=255) ccAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAAc < 1:28288/99‑1 (MQ=255) ccAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAAc > 2:28288/1‑99 (MQ=255) ccAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCa > 1:1058788/1‑150 (MQ=255) cAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCAt > 2:149998/1‑150 (MQ=255) gAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCg > 1:1081216/1‑113 (MQ=255) gAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCg < 2:1081216/113‑1 (MQ=255) aaTCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAg < 3:519659/130‑1 (MQ=255) aaTCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAg > 4:519659/1‑130 (MQ=255) tAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACgg > 1:107722/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGc > 1:791369/1‑150 (MQ=255) aCGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCa > 1:1150205/1‑150 (MQ=255) tttCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGt > 1:962867/1‑86 (MQ=255) tttCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGt < 2:962867/86‑1 (MQ=255) gCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCtttt > 4:672525/1‑112 (MQ=255) gCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCtttt < 3:672525/112‑1 (MQ=255) gCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAAc < 1:219824/128‑1 (MQ=255) gCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAAc > 2:219824/1‑128 (MQ=255) aaTTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGCCATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTAt < 2:348492/145‑1 (MQ=255) aaTTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTAt > 1:348492/1‑145 (MQ=255) aTTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGc < 1:430088/150‑1 (MQ=255) tCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATc < 3:93280/68‑1 (MQ=255) tCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATc > 4:93280/1‑68 (MQ=255) tCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGaa > 4:56096/1‑150 (MQ=255) cAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTa < 1:107653/103‑1 (MQ=255) cAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTa > 2:107653/1‑103 (MQ=255) cAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCt < 1:1111670/133‑1 (MQ=255) cAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCt > 2:1111670/1‑133 (MQ=255) cAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACg > 4:218780/1‑150 (MQ=255) aaaaGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACgt > 3:684641/1‑150 (MQ=255) aaGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACgtgt < 1:55624/150‑1 (MQ=255) ctctctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTc > 4:579536/1‑150 (MQ=255) tctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGAc > 2:268576/1‑76 (MQ=255) tctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGAc < 1:268576/76‑1 (MQ=255) tctTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGcc < 3:56096/150‑1 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCgg < 1:439003/150‑1 (MQ=255) ttttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCgg > 3:83162/1‑150 (MQ=255) tttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGa < 4:83162/150‑1 (MQ=255) tttATTGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGa < 3:288292/150‑1 (MQ=255) aTTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATaa < 1:280013/150‑1 (MQ=255) tGATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGc > 2:656365/1‑150 (MQ=255) gATCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGTATAAGCt < 2:1150205/150‑1 (MQ=255) aTCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatt > 1:384671/1‑53 (MQ=255) aTCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGtatt < 2:384671/53‑1 (MQ=255) aTCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCAc > 3:11107/1‑106 (MQ=255) aTCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCAc < 4:11107/106‑1 (MQ=255) aTCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGc < 3:328560/118‑1 (MQ=255) aTCTTACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGc > 4:328560/1‑118 (MQ=255) ttACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGAt > 1:895026/1‑150 (MQ=255) tACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATc < 2:1083348/150‑1 (MQ=255) tACGCATCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATc < 1:656365/150‑1 (MQ=255) gCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAgg > 2:1045254/1‑150 (MQ=255) cATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGgc < 1:1045254/150‑1 (MQ=255) aTCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACa < 1:895846/58‑1 (MQ=255) aTCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACa > 2:895846/1‑58 (MQ=255) aTCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGgcg > 1:916511/1‑150 (MQ=255) tCCTGTATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGgcgc < 3:218780/150‑1 (MQ=255) tATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGGCGCTTGAc > 2:804137/1‑150 (MQ=255) tATGATACAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGGCGCTTGAc < 2:791369/150‑1 (MQ=255) gataCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTc > 1:893344/1‑40 (MQ=255) gataCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATc > 3:44864/1‑136 (MQ=255) | ACGTTGCAGTTATAACCCTTAATGCTAGCGTTACCGTCCGCTATCGTCTATGTTCAAGTTGTCTTAATTGCCAGAATCTAACGGCTTTCGGCAATTACTCCAAAAGGGGGCGCTCTCTTTTATTGATCTTACGCATCCTGTATGATGCAAGCAGACTAACCCTATCAACGTTGGTATTATTTCCCGCAGACATGACCCTTTTAGCACTCGGTATCAACCATAAAACGGCACCTGTATCGCTGCGAGAACGTGTATCGTTTTCGCCGGATAAGCTCGATCAGGCGCTTGAC > NC_000913_3_pae_tpiA/1263523‑1263812 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |