| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 3427078 = | NA (NA) | 33 (0.220) | 24/236 | 12.2 | 81.6% | noncoding (75/77 nt) | ileU | tRNA‑Ile |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 4037236 | 8 (0.050) | intergenic (+19/‑24) | ileT/alaT | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACcaaatttgc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_tpiA/3427225‑3427078‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGCTTCT < NC_000913_3_pae_tpiA/4037236‑4037079 CCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCA < 2:158292/150‑1 CTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGCGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAA > 1:1373659/1‑150 TACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 2:1748096/1‑150 ACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTGAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTTAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATT > 1:1103771/1‑150 CTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG > 3:807091/1‑150 CTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG > 2:1727108/1‑150 CTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG > 4:26257/1‑150 CTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG > 1:1382697/1‑150 CTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG > 1:102542/1‑150 TTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC > 2:1584542/1‑150 TTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC < 4:825135/150‑1 TTAAAGAAGCGTACTTTGCAGGGCTCACACAGAATGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACACCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC > 4:242311/1‑150 TAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCC > 3:838886/1‑150 CGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAAT < 4:602894/150‑1 TACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTT < 4:838886/150‑1 TACTGTGCATTGGTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTT < 2:1717064/150‑1 ACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG < 1:425189/150‑1 ACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG > 1:229817/1‑137 ACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTG < 2:229817/137‑1 CTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGG < 2:1079601/150‑1 AGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTA > 2:783969/1‑146 AGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTA < 1:783969/146‑1 ATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTta > 2:1852620/1‑148 ATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTGGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGA < 4:210687/150‑1 CTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGG > 3:918964/1‑130 CTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGG < 4:918964/130‑1 AGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGAGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTACCGTGCAAATTTGGTAGGACTGAGTGGACTTGAACAACCGACATCACCCagaa > 3:1172140/1‑146 TAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG > 4:302843/1‑108 TAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG < 3:302843/108‑1 AAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG < 1:373748/107‑1 AAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG > 2:373748/1‑107 AAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGC > 1:1695560/1‑100 AAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGC < 2:1695560/100‑1 GCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT > 2:530103/1‑80 GCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT < 1:530103/80‑1 GCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA > 2:1490577/1‑77 GCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAA < 1:1490577/77‑1 GCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT < 2:802185/73‑1 GCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT > 1:802185/1‑73 GGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT < 3:110407/63‑1 GGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAT > 4:110407/1‑63 AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG > 2:1907255/1‑75 AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG < 1:1907255/75‑1 AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT > 2:279123/1‑61 AGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTT < 1:279123/61‑1 GAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC < 3:1046357/62‑1 GAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGC > 4:1046357/1‑62 GCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG < 2:163053/72‑1 GCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTG > 1:163053/1‑72 CCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGA < 1:55631/94‑1 CCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGA > 2:55631/1‑94 CCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGT > 2:1637581/1‑78 CCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGT < 1:1637581/78‑1 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGA < 1:1571537/83‑1 TGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGA > 2:1571537/1‑83 TTCAAGTCCGCTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGC > 4:446917/1‑35 TTCAAGTCCGCTCAGGCCTACCAAATTTGCCGTGC < 3:446917/35‑1 CCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCT < 4:274791/97‑1 CCAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCT > 3:274791/1‑97 CAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGA > 2:399309/1‑150 CAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGA > 1:325375/1‑150 CAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCAT < 1:1058625/122‑1 CAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCAT > 2:1058625/1‑122 AAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAA < 4:66028/150‑1 AAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTA > 2:310518/1‑107 AAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTA < 1:310518/107‑1 AATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAAC < 2:631339/76‑1 AATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAAC > 1:631339/1‑76 TTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGCT < 4:924389/150‑1 TGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTC > 2:1685036/1‑114 TGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTC < 1:1685036/114‑1 GCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGCTTC < 3:1024585/150‑1 CCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGCTTCT < 2:1205948/150‑1 CCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGC > 2:740379/1‑146 CCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGC < 1:740379/146‑1 CCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTA > 2:716975/1‑100 CCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTA < 1:716975/100‑1 CCGTGAAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGCTTCT < 1:1252624/150‑1 CCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACcaaatttgc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_pae_tpiA/3427225‑3427078‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAATTTGCCGTGCAAATTTGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAAGCCTGTAGAGGTTTTACTGCTCATTTTCATCAGACAATCTGTGTGAGCACTTCAAAGAACGCTTCT < NC_000913_3_pae_tpiA/4037236‑4037079 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |