| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 228108 | NA (NA) | 36 (0.270) | 25/236 | 9.9 | NA | noncoding (2350/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 228124 | NA (NA) | noncoding (2366/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_tpiA/227956‑228108‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < NC_000913_3_pae_tpiA/228124‑227976 AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C < 4:307181/150‑1AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C < 2:1688115/150‑1 ACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 2:277364/150‑1 cggTGACCTGTATTCCGGGGTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAGAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTG < 4:859169/147‑1 CGTTGACCAGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTG < 4:859174/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 4:935665/1‑150 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 3:708926/1‑150 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 3:587742/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 3:190448/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 2:1577646/1‑150 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 1:589064/150‑1 GTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGGTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 4:424657/1‑150 CCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 1:667526/145‑1 CCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 2:667526/1‑145 CCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C > 2:733232/1‑141 CCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C < 1:733232/141‑1 GTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCG < 1:1558984/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGGCATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 1:1025478/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 1:984958/150‑1 TGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 2:270944/150‑1 GGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 1:133314/128‑1 GGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 2:133314/1‑128 GACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCA > 2:1528805/1‑150 ACAGTNTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCCAAGGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAA < 3:279202/150‑1 AGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGC < 2:452928/150‑1 GTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCT < 3:999606/150‑1 GTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCT < 4:708926/150‑1 GTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCT < 1:1528805/150‑1 GTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCT < 2:1057262/150‑1 GTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 3:550674/107‑1 GTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT > 4:550674/1‑107 TTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCA < 2:1365807/131‑1 TTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCA > 1:1365807/1‑131 TTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA > 2:1138876/1‑126 TTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 1:1138876/126‑1 TGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGG > 2:98838/1‑135 TGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGG < 1:98838/135‑1 gGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAAC < 2:228588/149‑1 GCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C > 3:876339/1‑95 GCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑C < 4:876339/95‑1 gGGTCTCGTCCTAAAGAGGAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCT < 2:1156189/149‑1 CTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAA > 2:1082154/1‑114 CTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAA < 1:1082154/114‑1 TCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC > 2:232613/1‑89 TCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC < 1:232613/89‑1 CTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGC > 1:904005/1‑113 CTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGC < 2:904005/113‑1 AAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCA < 1:578337/150‑1 AAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT > 4:277161/1‑83 AAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CT < 3:277161/83‑1 GAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTA < 1:1071287/128‑1 GAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTA < 1:549892/128‑1 GAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTA > 2:1071287/1‑128 GAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTA > 2:549892/1‑128 AGCGCGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCTGCTTTCGCACCTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAA < 4:892835/150‑1 GAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACNTCAGGAGGNTAGNGCAATGGCATAAGCCTCCTTTCGCACCTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACagat > 3:892835/1‑146 TTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGC < 1:1279359/78‑1 TTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGC > 2:1279359/1‑78 AGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA > 3:17848/1‑56 AGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCA < 4:17848/56‑1 TTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTG > 3:311366/1‑85 TTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTG < 4:311366/85‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC > 1:370076/1‑150 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC > 2:1629912/1‑150 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC < 4:189237/150‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTT > 1:1423814/1‑104 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTT < 2:1423814/104‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTC < 1:1577398/91‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTC > 2:1577398/1‑91 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTCCGTGCTCCTCCGTTACGCTTTAGGAGGAGGCCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGC < 2:1581173/150‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGAC < 1:629587/67‑1 CTGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGAC > 2:629587/1‑67 TGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCC < 3:424206/118‑1 TGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCC > 4:424206/1‑118 TGCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGA > 2:860064/1‑113 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 3:769334/150‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCC > 3:150922/1‑93 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCC < 4:150922/93‑1 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTG > 3:305292/1‑56 GCTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTG < 4:305292/56‑1 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGCCCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACAATCTCCGCAAC > 3:615873/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC > 1:1341851/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC > 1:1154652/1‑150 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA > 4:765999/1‑149 CTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAA < 3:765999/149‑1 AACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCTAAAGAGTAACGGAGGAGCACGAAGGTTGGCTAATCCTGGTCGGACATCAGGAGGTTAGTGCAATGGCATAAGCCAGCTT‑‑G‑A‑CTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_tpiA/227956‑228108‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgcTCGCGCCGTCACGCTCGCAGTCAAGCTGGCTTATGCCATTGCACTAACCTCCTGATGTCCGACCAGGATTAGCCAACCTTCGTGCTCCTCCGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAAC < NC_000913_3_pae_tpiA/228124‑227976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |