| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_pae_tpiA | 264,098 | G→T | L50L (CTC→CTA) | ykfH ← | uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_pae_tpiA | 264,098 | 0 | G | T | 100.0% | 245.9 / NA | 68 | L50L (CTC→CTA) | ykfH | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (34/34); total (34/34) | |||||||||||
ACGGGCTCCCAGGCGCAGTGTAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCGAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGATAATTTT > NC_000913_3_pae_tpiA/263951‑264244 | aCGGGCTCCCAGGCGCAGTGTAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAg < 3:373878/150‑1 (MQ=255) tCCCAGGCGCAGTGTAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTcc > 3:40974/1‑150 (MQ=255) aGTGTAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATcc < 1:851809/150‑1 (MQ=255) tgtAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCgg > 3:16873/1‑150 (MQ=255) tAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGaa > 1:169022/1‑150 (MQ=255) aTCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACg > 1:343044/1‑150 (MQ=255) ctcCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTc < 4:356477/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCg < 2:873805/150‑1 (MQ=255) ggCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGgtgt < 1:817244/150‑1 (MQ=255) cccTGGTAGGGGTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAAt > 2:630735/1‑150 (MQ=255) cTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGa < 4:104655/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGAc < 2:169022/150‑1 (MQ=255) gTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCAGTGTAATGAc < 1:291136/148‑1 (MQ=255) gTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCAGTGTAATGAc > 2:291136/1‑148 (MQ=255) gTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGcc > 2:656874/1‑149 (MQ=255) ttACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGaa < 2:50478/114‑1 (MQ=255) ttACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGaa > 1:50478/1‑114 (MQ=255) ttACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGcc > 3:311671/1‑150 (MQ=255) ttACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTACTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTACCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGcc > 1:364063/1‑150 (MQ=255) 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tggttGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGcc < 4:539646/147‑1 (MQ=255) tATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTTTACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGgtg > 1:597932/1‑114 (MQ=255) tATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGgtg < 2:597932/114‑1 (MQ=255) aTTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCgg < 1:53509/150‑1 (MQ=255) ttGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGt > 1:182008/1‑150 (MQ=255) tGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTg < 4:16873/150‑1 (MQ=255) 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aGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCg > 4:97391/1‑138 (MQ=255) tGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGa < 3:508274/101‑1 (MQ=255) tGCTCATAAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGa > 4:508274/1‑101 (MQ=255) gcacatcaGGCAGGTATGGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCTTATACCGCTAGGACTCCGGCGATTTCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATTACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCg < 2:364063/147‑1 (MQ=21) gCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCg < 4:311671/150‑1 (MQ=255) cTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCgg < 4:40974/150‑1 (MQ=255) atcaGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGAc > 3:354835/1‑150 (MQ=255) atcaGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGAc > 3:245100/1‑150 (MQ=255) gcaggTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAgg > 2:653545/1‑150 (MQ=255) gTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGc > 2:222985/1‑150 (MQ=255) tataGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCggg < 3:179461/138‑1 (MQ=255) tataGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCggg > 4:179461/1‑138 (MQ=255) taGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTgg < 4:2930/150‑1 (MQ=255) gggCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCg > 4:114901/1‑150 (MQ=255) ggCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAAt < 2:141296/79‑1 (MQ=255) ggCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAAt > 1:141296/1‑79 (MQ=255) ggCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACTCGACCGTGCCACTGGTATTTGc > 1:832170/1‑109 (MQ=255) ggCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGc < 2:832170/109‑1 (MQ=255) gCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGt < 2:371494/150‑1 (MQ=255) ccATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGtat > 3:125866/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATc < 2:182008/150‑1 (MQ=255) gCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGt < 2:545447/150‑1 (MQ=255) cGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATGCGGGACTCAGGAGGCTGGCGGTATATCGTc > 2:41333/1‑150 (MQ=255) 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ggcgTTCGGCGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCAc < 2:906533/80‑1 (MQ=255) cGTATACCGCTAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTGTTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGa < 3:403241/150‑1 (MQ=255) cgctAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGATAAtttt < 4:245100/150‑1 (MQ=255) cgctAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGATAAtttt > 2:380235/1‑150 (MQ=255) cgctAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGATAAtttt < 4:354835/150‑1 (MQ=255) cgctAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGATAAtttt > 1:383506/1‑150 (MQ=255) | ACGGGCTCCCAGGCGCAGTGTAATCTCCCGCTGCAGGCCCCTGGTAGGGTTGCTCATTACAGTTCTCCACTATTGTCAGTTCAGGGTGATGCTCATCAGGCAGGTATAGGGCCCATTGCGGTCCTGGCGGCGTTCGGCGTATACCGCGAGGACTCCGGCGATATCCGGAACGTCCCTGCCGGTGTAATGACAGACGCTACCGTGCCACTGGTATTTGCCGGTGCAGTAGCGAAAGATTCGGGACTCAGGATGCTGGCGGTATATCGTCATTGCCCTGCGTTTACTGATAATTTT > NC_000913_3_pae_tpiA/263951‑264244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |