| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
AACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGTATGATATGAATTTCTCCTCTATCGTGGCTGATGAATATGGGATACCACGACAATTGAATGAAAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGG > NC_000913_3_pae_tpiA/4352512‑4352805 | aaCAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGTATGATATGAATTTCTCCTCTATCGTGGCTGATGAATATGGGATACCACGACAATTGAATGAAAACTcc < 1:53190/150‑1 (MQ=255) aaGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGTATGATATGAATTTCTCCTCTATCGTGGCTGATGAATATGGGATACCACGACAATTGAATGAAAACTCCTTc < 4:945375/150‑1 (MQ=255) aaGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGTATGATATGAATTTCTCCTCTATCGTGGCTGATGAATATGGGATACCACGACAATTGAATGAAAACTCCTTc < 1:1409390/150‑1 (MQ=255) 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aatgaaAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACaa > 3:945400/1‑143 (MQ=255) tgaaAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGATCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagg > 1:1204630/1‑150 (MQ=255) tgaaAACGCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagg > 2:1400895/1‑150 (MQ=255) gaaAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGATGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTGGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:1119877/150‑1 (MQ=255) gaaAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga > 2:41695/1‑150 (MQ=255) gaaAACGCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga > 1:231486/1‑150 (MQ=255) | AACAAGTTCAATACTTATGTTGTTTCTTTTGATTATCCATCATCTTATTCCTCAGTGTTCTTAAGATTAAGATCATTGATGTATGATATGAATTTCTCCTCTATCGTGGCTGATGAATATGGGATACCACGACAATTGAATGAAAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGG > NC_000913_3_pae_tpiA/4352512‑4352805 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |