| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913_3_pae_tpiA | 3,309,000 | 1 | . | C | 99.0% | 346.8 / ‑2.6 | 98 | intergenic (‑76/+33) | nlpI/pnp | lipoprotein involved in osmotic sensitivity and filamentation/polynucleotide phosphorylase/polyadenylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (53/44); total (53/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
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GCCAGGAAGTATTACTGCATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACT > NC_000913_3_pae_tpiA/3308852‑3309144 | gCCAGGAAGTATTACTGCATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑c > 4:37289/1‑150 (MQ=255) aGGAAGTATTACTACATCCTGCACGCGTAAGTGCTATCGCAACGCAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTCCCCTCTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACCAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑cccc < 2:483614/150‑1 (MQ=255) tACTGCATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGCTAAAAGCCCCCCCGCCGCa > 3:424441/1‑150 (MQ=255) 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1:166558/150‑1 (MQ=255) ccGGTTAAAAGCCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTcc < 2:34602/150‑1 (MQ=255) ccGGTTAAAAGCCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTcc < 3:381260/150‑1 (MQ=255) cGGTTAAAAGCCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCa < 4:226958/150‑1 (MQ=255) cGGTTAAAAGCCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCa < 1:327939/150‑1 (MQ=255) cGGTTAAAAGCCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGCCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCa < 2:512693/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |