Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913_3_pae_tpiA | 913,000 | C→T | G272D (GGC→GAC) | hcp ← | hybrid‑cluster [4Fe‑2S‑2O] subunit of anaerobic terminal reductases |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913_3_pae_tpiA | 913,000 | 0 | C | T | 98.6% | 247.7 / NA | 70 | G272D (GGC→GAC) | hcp | hybrid‑cluster [4Fe‑2S‑2O] subunit of anaerobic terminal reductases |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (28/41); minor base A (0/1); total (28/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCGATGATGCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGCCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGTATTTACC > NC_000913_3_pae_tpiA/912856‑913145 | tCGATGATGCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg < 3:351546/150‑1 (MQ=255) tCGATGATGCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg < 2:297303/150‑1 (MQ=255) tCGATGATGCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg > 4:144717/1‑150 (MQ=255) gcGATGATGCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg < 2:176429/149‑1 (MQ=255) gCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGAc < 1:327134/150‑1 (MQ=255) aGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACAt < 1:578523/150‑1 (MQ=255) tcatcaCGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCg > 2:187483/1‑150 (MQ=255) catcaCGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGt < 1:304466/150‑1 (MQ=255) catcaCGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCAAAGTGGGTGTCGACATTAACGCCCGt < 4:238542/150‑1 (MQ=255) cGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCtt < 3:63863/150‑1 (MQ=255) ggggCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGt < 3:307745/150‑1 (MQ=255) ggggCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGt < 2:703684/150‑1 (MQ=255) aGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCg < 3:210918/142‑1 (MQ=255) aGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCg > 4:210918/1‑142 (MQ=255) aGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTc > 2:265021/1‑150 (MQ=255) gAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCcag < 1:475264/150‑1 (MQ=255) gAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGc > 4:439478/1‑129 (MQ=255) gAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGc < 3:439478/129‑1 (MQ=255) tCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAgaga > 1:585941/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCAACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCttt < 1:724500/150‑1 (MQ=255) tGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTg < 2:270784/150‑1 (MQ=255) caaGCCGCTGTCGTAGATACCGACCAGATGCATGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGAcc > 2:44096/3‑150 (MQ=255) cAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCg > 4:167154/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCgg > 4:278750/1‑150 (MQ=255) cGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCTTGGGTGTAGACATTAACGCGCGTTCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGGTCTTTGAGATCGTGACCGGaaa > 1:705294/1‑150 (MQ=255) tGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTGGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCa < 4:310574/150‑1 (MQ=255) ccGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTag < 1:46825/120‑1 (MQ=255) ccGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTag > 2:46825/1‑120 (MQ=255) ccGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGa < 4:357303/150‑1 (MQ=255) ccGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGa > 2:528222/1‑150 (MQ=255) cGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGaa > 3:63563/1‑150 (MQ=255) gTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg > 1:419855/1‑70 (MQ=255) gTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg < 2:419855/70‑1 (MQ=255) tAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCt > 1:554974/1‑100 (MQ=255) tAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCt < 2:554974/100‑1 (MQ=255) tAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATg < 3:514/150‑1 (MQ=255) aGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGc < 1:37031/150‑1 (MQ=255) gTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCa < 1:265021/150‑1 (MQ=255) aCCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCAttt > 4:105336/1‑150 (MQ=255) ccGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg < 4:432244/63‑1 (MQ=255) ccGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTgg > 3:432244/1‑63 (MQ=255) ccGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTa > 1:291209/1‑150 (MQ=255) gACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTAcc > 2:197808/1‑150 (MQ=255) cTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTc > 3:377669/1‑148 (MQ=255) cTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTc < 4:377669/148‑1 (MQ=255) gAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCATCGCttt < 3:278750/150‑1 (MQ=255) aTTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGa < 2:291209/150‑1 (MQ=255) tttACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGAt < 1:393108/107‑1 (MQ=255) tttACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGAt > 2:393108/1‑107 (MQ=255) tttACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGAc < 2:585941/150‑1 (MQ=255) gCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCttt < 3:381551/97‑1 (MQ=255) gCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCttt > 4:381551/1‑97 (MQ=255) gCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTGCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGa < 4:20860/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGAc < 1:252212/150‑1 (MQ=255) cGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGGTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGGCCTGGGt > 3:263964/1‑150 (MQ=255) ggTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAgg < 2:312069/74‑1 (MQ=255) ggTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAgg > 1:312069/1‑74 (MQ=255) ggTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTg < 1:528222/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGt < 1:110251/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAAt > 1:80634/1‑101 (MQ=255) ccATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAAt < 2:80634/101‑1 (MQ=255) cATGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCg > 1:834485/1‑150 (MQ=255) aTGCGCAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATAAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCgg < 2:220940/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCAGCATTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTg < 3:144717/150‑1 (MQ=255) gcagcaTTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGGCCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGt > 1:730985/1‑150 (MQ=255) gcagcaTTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGt < 4:510484/150‑1 (MQ=255) caTTTCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGTAttt > 1:187344/1‑150 (MQ=255) aTTTCGTCGTGGGTGTAGACATTACCGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGACATCTTCGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCTTTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGTATTTa < 2:586188/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGTATTTAcc < 4:328365/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGTATTTAcc < 4:328351/150‑1 (MQ=255) | TCGATGATGCAGTTCGAGGTCATCACGATGGGGCCAGGGAAACGAGCGAACTCCACTTGCTGATTCTGCCAGCCGCTGCCGTAGTTACCGACCAGATGCTTGAATTTACGCAGCTCCGGGTAGCCATGCGCAGGCAGCATTTCGCCGTGGGTGTAGACATTAACGCCCGTGCCTTCGGTCTGTTCCAGCAGGTTGTAGAGATCTTTGAGATCGTGACCGGAAATCAGAATGCATTTACCCGCCGTCGCTTTGACGTTGACCTGGGTTGGCGTCGGGTGACCGTATTTACC > NC_000913_3_pae_tpiA/912856‑913145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |