| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913_3_pae_tpiA | 482,230 | G→A | P725L (CCG→CTG) | acrB ← | multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913_3_pae_tpiA | 482,230 | 0 | G | A | 98.6% | 225.6 / NA | 71 | P725L (CCG→CTG) | acrB | multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (39/30); minor base C (1/0); total (41/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGACATAAACTTTCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCGGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGTCAATCAGCTCAAAGTCAAAGCCGG > NC_000913_3_pae_tpiA/482084‑482371 | gcacatAAACTTTCTTCACACGCCCTCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCagg < 1:1065/147‑1 (MQ=255) catAAACTTTCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTa < 1:392654/149‑1 (MQ=255) cacaaaCTTTCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCTTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTa < 2:837307/146‑1 (MQ=255) aaaCTTTCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCt > 2:101000/1‑149 (MQ=255) aaaCTTTCTGCGCACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGAAATCAATCTTAACCTGCAGGGTATCt > 2:314610/1‑149 (MQ=255) tttCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑Ca > 2:638695/1‑149 (MQ=255) tttCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑Ca < 1:638695/149‑1 (MQ=255) cttcACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGAc < 1:101000/149‑1 (MQ=255) acacGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGtt > 1:900602/1‑149 (MQ=255) acacGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGtt > 1:293183/1‑149 (MQ=255) acacGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGtt > 1:227896/1‑149 (MQ=255) cgcGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTTGCATAGCTGCCGCCCCATGCAGTGTCCAGAGTGGTGTTAATGTTGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTTCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGttt < 2:763714/147‑1 (MQ=255) cacGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGttt < 1:916838/149‑1 (MQ=255) cGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTgg < 1:534140/149‑1 (MQ=255) ccGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTTTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGGATCTTC‑CCGCCCGGTTGGaag > 2:466878/1‑147 (MQ=255) cGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTg < 2:227896/149‑1 (MQ=255) gATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTTCGCtcg > 2:434476/1‑147 (MQ=255) gATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTgg > 1:290161/1‑149 (MQ=255) gTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCAGGTAGCGCCCAGAGTGGGGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCATGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACa < 2:827558/149‑1 (MQ=255) acaTAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAgg > 1:748466/1‑149 (MQ=255) acaTAGCTGACGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAgg < 1:65892/149‑1 (MQ=255) caTAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAggg < 2:299704/149‑1 (MQ=255) tAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCg < 2:19501/117‑1 (MQ=255) tAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCg > 1:19501/1‑117 (MQ=255) tGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTc > 2:604112/1‑149 (MQ=255) gccCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGC‑AGGACTCGCCGCAGACCCGTTGGAAGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTCCTTCgctg > 1:224786/1‑149 (MQ=255) ccATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTAGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACCTATCAGGGTGCTTAGCTGCtt > 2:579839/1‑149 (MQ=255) cATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGCGTGCTTCGCTGCTTc > 2:961751/1‑149 (MQ=255) cATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTATCTCCAATATATCAATCTTACACTTCAGGGTATCTTC‑CAGACCGATTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGTTTCGCTGCTTc > 1:480611/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTgc > 1:789445/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGCCCGTTTGAACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTCCTTCGCTGATTCTgcaa > 2:264615/1‑149 (MQ=255) gcgcCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTCCGCTGGTCAACATATCAGGGCGCTTCGCTCCTTCTgcagc > 2:694858/1‑147 (MQ=255) cccAGAGTGGTGTTAAGGGCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCATGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTgcaagcaa < 2:357324/149‑1 (MQ=255) ccAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGGCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAAc > 1:930196/1‑149 (MQ=255) gagTGGTGGTAATGTTGGTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTgg < 2:323219/149‑1 (MQ=255) gtggtgTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGtt < 1:604112/149‑1 (MQ=255) tggtgTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTa > 1:777599/1‑149 (MQ=255) tgtTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTAcgc > 2:750737/1‑149 (MQ=255) ttAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTGTCTTC‑CAGACCGGTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACgcgc > 1:249434/1‑149 (MQ=255) ttAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCATGCGCTTTTGCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACgcgc < 1:272091/149‑1 (MQ=255) tCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGt > 1:148179/1‑149 (MQ=255) ttGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAATCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAg > 1:814375/1‑149 (MQ=255) ttGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCACCTGGTTACGGGCCTGGGTCAg > 1:629870/1‑149 (MQ=255) ttGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAg < 1:792697/149‑1 (MQ=255) ttGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCCCCCGACTCAg > 2:206468/1‑149 (MQ=255) gATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTCCAAGCAACTGATTACGCGACTGAGCCCGtt > 2:780118/1‑149 (MQ=255) tAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTATCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGtttt > 2:462725/1‑149 (MQ=255) aaaCACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCACCTGGTTACGCGCCTGAGGCAGTTTTTCg > 1:278079/1‑149 (MQ=255) aaaCACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCg > 1:674832/1‑149 (MQ=255) aaCACCCAGCGCCTGGTCGTTTTCCGTGTCGATATCAATCTTAAACTGTAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGTTCAACATAGCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTGACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGt < 2:276391/149‑1 (MQ=255) aaCACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGTCCGTTTGGACGTACGATGGTTAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCATCTGGTTACGCGTCTTAGTCGGGTTTTCGt < 2:611939/149‑1 (MQ=255) cacCCAGCGGCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGGTTCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGa < 2:470718/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCaa < 1:739500/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCaa < 2:148179/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATAACAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTTGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCaa > 1:548634/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGcc < 1:138000/149‑1 (MQ=255) cgcTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCt > 1:513639/1‑149 (MQ=255) gcTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTg < 2:290161/149‑1 (MQ=255) tttttCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGt < 1:697200/149‑1 (MQ=255) tttttCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGt < 1:949955/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGTCAATCa < 1:714190/149‑1 (MQ=255) tGGTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGCGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGCTCAATCAg > 2:681466/1‑149 (MQ=255) gTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGCTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGACTCAGTTTTTCGTTCCCAAGGCAAGCCTGGTCCATAAGCt > 1:16197/1‑149 (MQ=255) gTCGATATCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑AAGACCGTTTGGACGTAAGCTGGTAAACATATCAGGGTGCTTCTCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGACTGAGTCAGTTTTTCGTGACGAAGGCCAGGCGGGTAAATGAgtt > 1:416457/1‑147 (MQ=255) atCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCaa > 2:936377/1‑54 (MQ=255) atCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCaa < 1:936377/54‑1 (MQ=255) atCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCaa < 1:204285/122‑1 (MQ=255) atCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCaa > 2:204285/1‑122 (MQ=255) atCAATCTTAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGTCAATCAGCtcaaagt > 1:558104/1‑149 (MQ=255) tCTTAAACTCCCGGGTATCATC‑CAGACCGTTTGTACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTCCCCTGCTTCTGCAGGCAACTGGTTACGCCCCTGCGCCAGCTGTTCGTGCCCAAGGCAAGCCCGGTCCATCAGCtcaaagtcagag > 2:613108/1‑149 (MQ=255) ttAAACTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGTCAATCAGCTCAAAGTCAAAGcc > 1:641354/1‑149 (MQ=255) aaaCTGCAGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGTCAATCAGCTCAAAGTCAAAGCCgg < 1:158694/149‑1 (MQ=255) | TGACATAAACTTTCTTCACACGACCGCGGTCGATAAAGTCGTTCACATAGCTGCCGCCCCATGCAGCGCCCAGAGTGGTGTTAATGTCGTTGATAGAAACACCCAGCGCCTGCGCTTTTTCCTGGTCGATATCAATCTTAAACTGCGGGGTATCTTC‑CAGACCGTTTGGACGTACGCTGGTCAACATATCAGGGTGCTTCGCTGCTTCTGCAAGCAACTGGTTACGCGCCTGAGTCAGTTTTTCGTGACCAAGGCCAGCCTGGTCAATCAGCTCAAAGTCAAAGCCGG > NC_000913_3_pae_tpiA/482084‑482371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |