New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 2700550 = | 162 (1.220) | 14 (0.120) | 12/238 | 13.4 | 9.4% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
? | NC_000913_3_pae_tpiA | 2700601 = | 129 (1.130) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCG > NC_000913_3_pae_tpiA/2700452‑2700747 | tCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTaaa > 1:1352382/1‑150 (MQ=255) tCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTaaa < 4:541453/150‑1 (MQ=255) gTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAgaga > 1:1002202/1‑150 (MQ=255) tttATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACg < 2:581545/150‑1 (MQ=255) ttATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACgg > 3:246863/1‑150 (MQ=255) ttATGCCAAAGAGTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATGCGTGCACTGATCCATACACGCTGTTGTTGGGGGTGACT‑GCGGGACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACGAGTTGGGGGGGGTTACTTTTGAAAGAGAACgg > 2:722832/1‑150 (MQ=255) tATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGt > 1:429852/1‑150 (MQ=255) tATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCACCATTCCTTTCCGTTTCGGGGGTTTTACTTTTTGAAGAGAACGGt < 2:791918/150‑1 (MQ=255) tAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat < 3:53463/150‑1 (MQ=255) aaaGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTattatt > 2:3725/1‑150 (MQ=255) aaGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTAttt < 1:244817/150‑1 (MQ=255) aaGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTAttt > 3:310082/1‑150 (MQ=255) gATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTAttttt < 1:799373/150‑1 (MQ=255) ttGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTTCCCTGATACATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTaa < 2:1407953/150‑1 (MQ=255) ttGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTACAGCGAACGGTCTTATCTTTaa > 2:1365503/1‑150 (MQ=255) ttGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTaa < 4:413749/150‑1 (MQ=255) gCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTCCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTGACCAGAGCGGGGGGTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACt > 1:648441/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACtt > 3:627799/1‑150 (MQ=255) aaGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACttt < 2:1105486/150‑1 (MQ=255) ttGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTTTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCaa < 1:1158232/150‑1 (MQ=255) ttGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCaa < 2:540015/150‑1 (MQ=255) tAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTAc > 3:684074/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTAc > 1:756383/1‑150 (MQ=255) aaaaGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTaaa > 1:1101374/1‑115 (MQ=255) aaaGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCg > 1:664724/1‑150 (MQ=255) gATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat > 2:1180877/1‑125 (MQ=255) gATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGtattat < 1:1180877/125‑1 (MQ=255) aaGTACACTGATCCAAACTCCCTGTTGCTGCTGG‑GCGTCACTGCACAAAATTAAAGTTAGAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGcac < 1:281472/150‑1 (MQ=255) acacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc < 1:1416098/150‑1 (MQ=255) acacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc < 1:294849/150‑1 (MQ=255) acacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc < 3:355422/150‑1 (MQ=255) cacTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAGGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGCTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCa > 2:844301/1‑150 (MQ=255) acTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCAt < 1:1315897/150‑1 (MQ=255) cTGTTCGATAATGGTTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGAACAAAATTAAAGTTAAATAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATa < 4:494414/150‑1 (MQ=255) tGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATa > 2:436892/1‑149 (MQ=255) tGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAg < 3:84032/150‑1 (MQ=255) gATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGt > 1:660759/1‑150 (MQ=255) aTCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTg > 2:313693/1‑150 (MQ=255) aTCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTg > 3:509889/1‑150 (MQ=255) cATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTAACAGTTCGGGGGATTTACTTTTTAACACGATAGGTATAAATTTTACCTTTCAATAATTACCGTGCCACCAGCATAGTGACg > 1:499229/1‑150 (MQ=255) aTAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGc > 3:689617/1‑150 (MQ=255) aTAATCACTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTCCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGc < 1:1445101/150‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTGTTGAGTGTGCAT‑GCTTCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTc < 4:839934/116‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCa > 1:159900/1‑150 (MQ=255) tgttgtTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGc < 1:217067/150‑1 (MQ=255) tgttgtTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGc > 4:79507/1‑150 (MQ=255) gttgAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGc > 1:963019/1‑150 (MQ=255) ttgAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCg > 3:6411/1‑150 (MQ=255) aGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTa > 1:1412551/1‑150 (MQ=255) 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gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCatat > 1:86632/1‑150 (MQ=255) tgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATAttt > 3:526039/1‑150 (MQ=255) gcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTg < 1:591524/150‑1 (MQ=255) cacaAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGta < 4:891818/75‑1 (MQ=255) cacaAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGta > 3:891818/1‑75 (MQ=255) cacaAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACAt < 1:763517/140‑1 (MQ=255) cacaAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACAt > 2:763517/1‑140 (MQ=255) aaaTTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACg < 4:503032/150‑1 (MQ=255) aaGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGc < 1:1081606/150‑1 (MQ=255) aaGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGc < 1:1069344/150‑1 (MQ=255) aGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCt > 1:1344492/1‑150 (MQ=255) aGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCt > 2:860509/1‑150 (MQ=255) ttAAAAATTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCttt < 4:589750/150‑1 (MQ=255) tAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCtttt > 1:1184143/1‑150 (MQ=255) aaaaaGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGc > 1:1034940/1‑103 (MQ=255) aaaaaGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGc < 2:1034940/103‑1 (MQ=255) aaaGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCg > 1:456241/1‑150 (MQ=255) gTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGc < 4:631711/122‑1 (MQ=255) gTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGc > 3:631711/1‑122 (MQ=255) tAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAg > 1:880097/1‑150 (MQ=255) aaaCCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGtt > 1:1116983/1‑150 (MQ=255) cGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGc > 2:181475/1‑150 (MQ=255) ttCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCt > 1:522025/1‑150 (MQ=255) ccTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTTTATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCg > 4:485423/1‑150 (MQ=255) cTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTAAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGc < 2:1047563/150‑1 (MQ=255) tACCAGGTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGccc > 4:242631/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGcccc > 3:438970/1‑150 (MQ=255) cAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCa > 1:478083/1‑130 (MQ=255) cAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCa < 2:478083/130‑1 (MQ=255) cAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAt > 2:483067/1‑150 (MQ=255) gTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGACCCAGCATAGTGCCGGTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtag > 1:27036/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagc < 2:86632/150‑1 (MQ=255) tCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagcc < 2:1133559/150‑1 (MQ=255) gggTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgtag < 3:77666/150‑1 (MQ=255) gTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTAGCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCAAGTTTTGATGCCTCGCCCCAtagccgtagcc > 2:136980/1‑150 (MQ=255) gTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgtagcc < 1:687320/150‑1 (MQ=255) ttttACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgtagccg > 4:705550/1‑150 (MQ=255) ttACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTc > 1:45340/1‑130 (MQ=255) ttACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTg > 1:1021306/1‑150 (MQ=255) tACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTCACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCTTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTgg < 4:842956/150‑1 (MQ=255) tACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTgg > 3:799709/1‑150 (MQ=255) aCTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGt > 4:164780/1‑150 (MQ=255) tttttAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGttt > 3:487050/1‑150 (MQ=255) tttttAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGttt > 4:661910/1‑150 (MQ=255) tttttAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGttt > 1:1055697/1‑150 (MQ=255) tAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCg > 3:139292/1‑150 (MQ=255) | TCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCAT‑GCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCG > NC_000913_3_pae_tpiA/2700452‑2700747 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |