| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 165049 | 1851 (1.020) | 92 (0.060) | 49/222 | 61.0 | 5.4% | intergenic (+13/‑529) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| ? | CP016816 | = 165050 | 1621 (1.010) | intergenic (+14/‑528) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 669 total aligned reads displayed.
TCAAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/164907‑165049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaagactttctAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA < CP016816/165050‑164924 ctAGATTTTTAATTAATATATGATTATCAATTTGATTATTTTAAACATTATTTATATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATTATAATAAATTAAATCCTTTTTATATAATTAGT‑TTTTTTTA < 1:1092355/126‑1 CAAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTA < 2:3903658/128‑1 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ATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATTATAATAAATTAAATCATTTAAATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAA > 2:571116/1‑128 TTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAATT‑TTTATTTAAAAAA > 2:3700429/1‑128 TTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAA > 1:1169119/1‑128 TTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAA > 1:864839/1‑128 TTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAA < 1:3246272/128‑1 TTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAA < 2:462226/128‑1 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ATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAATACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTT < 1:1508812/128‑1 ATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTT > 1:2289805/1‑128 TTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTTT < 1:215972/128‑1 TAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTTTC < 1:2511535/128‑1 TAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATAAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTTTC > 1:3948939/1‑128 AATAAATGTTTATAAATTATATTATTTTAAACATTATTTATATTTAAAAAAAAATTTTAATAAAATTTATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTTTCT < 1:532336/128‑1 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TAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA < 2:3009761/128‑1 TCAAGATTATAAATTAATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGT‑TTTATTTAAAAAAAGACTTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/164907‑165049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaaaagactttctAAGAAAGTCTTTTTTTAAATAAAACTTTTTATATATAAAGGATTTAATTTATTATCATCATCAATTTTAATAAAATGTTTTTTTAAATCTAAATAATGTTTTAAATAATCAAATTGATAATCATTTA < CP016816/165050‑164924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |