| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 370895 = | 1715 (0.940) | 97 (0.060) | 50/226 | 61.2 | 5.9% | intergenic (+216/+51) | JCVSYN2_01610/JCVSYN2_01615 | hypothetical protein/phosphoglycerate kinase |
| ? | CP016816 | 370925 = | 1564 (0.960) | intergenic (+246/+21) | JCVSYN2_01610/JCVSYN2_01615 | hypothetical protein/phosphoglycerate kinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1819 total aligned reads displayed.
TATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCCCA > CP016816/370798‑371052 | taatCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTaa < 2:806934/125‑1 (MQ=255) tCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATTATTAAAGTGTCAGGATGCGTTTAAAATATTAGTTAAGAAAGAATATATCCAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTActct > 1:2416188/1‑128 (MQ=255) ccTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTa > 2:2867377/1‑128 (MQ=255) cTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTat > 2:3456784/1‑128 (MQ=255) ttattCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTattaat > 2:2536918/1‑128 (MQ=255) tattCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTattaatt < 2:1471644/128‑1 (MQ=255) tattCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTattaatt < 2:2674596/128‑1 (MQ=255) tatgCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTattaatt < 1:1650512/128‑1 (MQ=255) ttCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTTAATTATTAAAGTGTCAGTAAGCGTTTAAAATATTACTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAAATCAATATAAATTAAGTTATTTAATCAATTAAATAg > 1:2544213/1‑128 (MQ=255) cAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTa > 2:2018945/1‑128 (MQ=255) atcAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTAt > 1:665103/3‑128 (MQ=255) aaCAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAACTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTAt > 1:957750/1‑128 (MQ=255) aCAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATATATTAATTAGTAtt < 2:1882860/128‑1 (MQ=255) ggaggTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGATTAAAATATTAGATAATAAAGAATATATCAATCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGATTATTTTAATCTATAAATTATAATTaaa > 2:3568675/1‑128 (MQ=255) gaggTTCTATAGTTTCTGAATGATATAAGTGTCATGATTCGTTTATAATATTAGTTAATTAAGTATATATCAAGAAATTAAAATATGTCTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTTTTAATTAGTATTaaaa < 2:2469757/128‑1 (MQ=255) gaggTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAATCAATAAAAAACTAAATATAAATTTAGTTTATTAATATATTAATAAGAATTaaaa > 2:2731469/1‑128 (MQ=255) gaggTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTaaaa < 2:1578771/128‑1 (MQ=255) tCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAattatt > 1:3946516/1‑128 (MQ=255) tCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAattatt < 1:1334460/128‑1 (MQ=255) cTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATTTCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTAAGTTTTTTAAAATAATAATAAGTATTAAaattaatt > 2:3870205/1‑128 (MQ=255) cTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAAttattt > 1:3619609/1‑128 (MQ=255) cTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAAttattt > 2:3793550/1‑128 (MQ=255) ataCTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAAttatttat < 1:1206677/128‑1 (MQ=255) tCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGa < 1:443137/128‑1 (MQ=255) ccTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGaa > 1:1559502/1‑128 (MQ=255) cTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAAt < 1:511444/128‑1 (MQ=255) gAATGATTAATTTGTCAGTAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATTAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTg < 1:303923/128‑1 (MQ=255) gAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTg < 1:897686/128‑1 (MQ=255) aTGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCa < 2:1813747/128‑1 (MQ=255) ttAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGaaa > 2:3942026/1‑128 (MQ=255) gtgtCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCt > 2:845673/1‑128 (MQ=255) tctCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCta < 1:2275552/126‑1 (MQ=255) gtCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCtaa < 2:2602971/128‑1 (MQ=255) tCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCtaat < 2:3351071/128‑1 (MQ=255) tCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCtaat > 2:1955706/1‑128 (MQ=255) cAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAattatt > 2:3154024/1‑101 (MQ=255) cAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAattatt < 1:3154024/101‑1 (MQ=255) gAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAAtt > 1:3540258/1‑128 (MQ=255) gCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATCATTCtt > 2:2934842/1‑128 (MQ=255) gCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCtt < 1:3692603/128‑1 (MQ=255) tAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTttcct > 2:1019984/1‑128 (MQ=255) aaaTATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTttccttc > 2:221501/1‑128 (MQ=255) atatTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCt > 2:3514708/1‑109 (MQ=255) atatTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTATTTTCCTTCCa > 2:683994/1‑128 (MQ=255) tAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTATTTTAATCTATAAATTAGTATTATAATTATTTATATTGAATTTCATAAATACCTAATATATCTTTTCCTTCCTTaaa > 2:1095547/1‑128 (MQ=255) gTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAAtt < 1:2833809/128‑1 (MQ=255) gTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAAtt > 1:572119/1‑128 (MQ=255) ttAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTTCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTc > 2:3083132/1‑128 (MQ=255) aataaAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCaa > 1:3292171/1‑128 (MQ=255) taaAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGc < 1:3378056/128‑1 (MQ=255) aaaGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAATCg > 2:2418513/1‑128 (MQ=255) aaaGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTACCATAAATTCAAGct > 2:914092/1‑127 (MQ=255) aGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTATCCTTCCATAAATTCAAGCGaa < 1:2610656/128‑1 (MQ=255) atatatCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAg > 2:1386221/1‑126 (MQ=255) atatatCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCATTCCATAAATTCaagctaagct > 1:2785684/1‑128 (MQ=255) tatCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGctcct > 2:2814873/1‑128 (MQ=255) tgaatacAATAAACAACTCACTTTATAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGctcctc < 2:2082827/122‑1 (MQ=255) atCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGctcctc > 1:2041825/1‑128 (MQ=255) agcAAGCAATAATAAACTCACTATAAAGTGTGTTTTTTTATCTATTAATTTGTATTAAAATTATTTATCTTGTATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCATTAAATTCAAGCGAAGctcctc < 2:2278871/126‑1 (MQ=255) ccaGCAATAACAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCg < 1:767072/126‑1 (MQ=255) caatcaatTAAAATCTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTACTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCg < 2:1661971/128‑1 (MQ=255) caatcaatAAAAAACTCTCTATAAAGTTAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCATGCGAAGCTCCTCCg < 1:1979857/128‑1 (MQ=255) cAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCg < 2:53647/128‑1 (MQ=255) cAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCg > 1:2695999/1‑128 (MQ=255) cAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCg < 1:2335916/128‑1 (MQ=255) gCAATATAATACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTAGTATAATTATTTATCTTGAATTGAAGAAATTCCTAATAATGCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCa < 1:3456254/128‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGt < 1:2098679/128‑1 (MQ=255) tAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGtag > 1:1839048/1‑126 (MQ=255) aaaaaaCTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGa < 2:3195982/128‑1 (MQ=255) aaaaTCACTATCAAGAGAGTTTATTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAAt < 1:2483087/128‑1 (MQ=255) aaaaTCACTATAAATTGATGTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAAt < 2:3291904/128‑1 (MQ=255) aaaCTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTAATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCATTCCATAAATTCAAGCGAAGATCCTCCGCCAGTAGAAAt > 2:2359565/1‑128 (MQ=255) aaCTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAAtt > 2:450526/1‑128 (MQ=255) cTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTATTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCAAGTTGAAATTCa > 2:3019076/1‑128 (MQ=255) tCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCAt < 2:1313098/128‑1 (MQ=255) tCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCAATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGATGAAATTCAt > 1:1293932/1‑128 (MQ=255) cACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTttcct < 1:290022/85‑1 (MQ=255) cTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGaa < 1:113333/128‑1 (MQ=255) cTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCAATAAATTCTAGAGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGat > 1:3857068/1‑127 (MQ=255) tataAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGaaa > 2:603603/1‑128 (MQ=255) ataAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAATCTAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGaaaa > 2:169504/1‑128 (MQ=255) ataAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCTCCAGTTGAAATTCATGaaaa > 2:367197/1‑128 (MQ=255) ttaaGTGATTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTTTTTATCTTGAATTGAAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAAt < 2:151047/126‑1 (MQ=255) tataGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAAt > 2:1759728/4‑128 (MQ=255) taAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAAt < 1:1919481/128‑1 (MQ=255) aaGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCg > 2:3743293/1‑105 (MQ=255) aaGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGcc > 2:2155454/1‑107 (MQ=255) aaGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAAttt < 1:3770079/128‑1 (MQ=255) gTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGATAATTTAt > 1:1000583/1‑128 (MQ=255) tGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTTTTAAATTTATTTATCTTGAATTGCAGATATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATc < 2:1238254/128‑1 (MQ=255) tGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATc > 1:2191690/1‑128 (MQ=255) gTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCttt < 1:1070730/128‑1 (MQ=255) gTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCttt > 1:819012/1‑128 (MQ=255) ttttttAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTGTa > 2:117488/1‑128 (MQ=255) tttttAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTaa > 1:3096274/1‑128 (MQ=255) ttttAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTaaa < 1:1456029/128‑1 (MQ=255) ttttAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTaaa < 1:3213986/128‑1 (MQ=255) tttAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGACAGTTGAAATTCATGATAATTTATCTTTAAAt > 1:1737610/1‑128 (MQ=255) ttAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGAAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATc < 1:2740538/128‑1 (MQ=255) tAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATcc < 1:1395657/128‑1 (MQ=255) | TATTCCTGATTATTCAACAGGAGGTTCTATACTTCCTGAATGATTAAAGTGTCAGGAAGCGTTTAAAATATTAGTTAATAAAGAATATATCAAGCAATAAAAAACTCACTATAAAGTGAGTTTTTTAATCTATTAATTAGTATTAAAATTATTTATCTTGAATTGCAGAAATTCCTAATAATTCTTTTCCTTCCATAAATTCAAGCGAAGCTCCTCCGCCAGTTGAAATTCATGAAAATTTATCTTTAAATCCCA > CP016816/370798‑371052 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |